| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,031,221 | T→A | 7.7% | intergenic (‑290/‑146) | ygfT ← / → uacT | fused putative oxidoreductase, Fe‑S subunit and nucleotide‑binding subunit/urate:H(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,031,221 | 0 | T | A | 7.7% | 272.7 / 8.4 | 89 | intergenic (‑290/‑146) | ygfT/uacT | fused putative oxidoreductase, Fe‑S subunit and nucleotide‑binding subunit/urate:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/43); new base A (4/3); total (43/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATTATTTCAACATTGCCGATCAAAAGAGCGCTATCCAGATAAAAACGATTAAATGCGAGAGTGCGACATGCCAGAATGATTAATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACTGATG > NC_000913/3031072‑3031369 | attattTCAACATTGCCGATCAAAAGAGCGCTATCCAGATATAAACGATTAAATGCGAGAGTGCGACATGCCAGAATGATTAATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGttt < 2:1217646/150‑1 (MQ=255)attattTCAACATTGCCGATCAAAAGAGCGCTATCCAGATAAAAACGATTAAATGCGAGAGTGCGACATGCCAGAATGATTAATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGttt > 1:1714902/1‑150 (MQ=255) tattTCAACATTGCCGATCAAAAGAGCGCTATCCAGATAAAAACGATTAAATGCGAGAGTGCGACATGCCAGAATGATTAATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTaa < 1:1920288/150‑1 (MQ=255) 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taatCGTGGTTAAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGGAAGgaga > 2:1259075/4‑150 (MQ=255) taatCGTGGTTAAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGgaga > 1:1881016/4‑150 (MQ=255) aatCGTGGTTAAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGaa > 2:115003/3‑150 (MQ=255) tGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACt < 1:910717/150‑1 (MQ=255) tGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACt > 1:1495800/1‑150 (MQ=255) ggTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtg > 1:1001011/1‑150 (MQ=255) ggTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtg > 2:65227/1‑150 (MQ=255) ggTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtg > 2:44079/1‑150 (MQ=255) gTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtga < 1:1233092/150‑1 (MQ=255) gTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtga < 1:1324235/150‑1 (MQ=255) gTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtga > 2:344041/1‑150 (MQ=255) ttAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtgatg < 2:565927/150‑1 (MQ=255) ttAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACtgatg < 1:1341384/150‑1 (MQ=255) ttAACCACGATTATGTGACTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCGTTTTACTCTGGCGGGGGAAAGGAGAAACACtgatg > 2:457226/1‑150 (MQ=255) | ATTATTTCAACATTGCCGATCAAAAGAGCGCTATCCAGATAAAAACGATTAAATGCGAGAGTGCGACATGCCAGAATGATTAATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAAAGGAGAAACACTGATG > NC_000913/3031072‑3031369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |