Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,119,572 | 0 | T | G | 7.7% | 346.9 / 16.8 | 115 | intergenic (‑460/+25) | yghJ/glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/65); new base G (4/5); total (45/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.35e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GTTTTGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCA > NC_000913/3119424‑3119718 | gTTTTGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATAtt < 2:199912/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATAtt < 1:481862/150‑1 (MQ=255) tttGCGTGATAAAATAATTGATGTTATCACGCTCTTAATTATTTATCAGTTTATCTGAAATCAAAACATTATTGCTGCATTGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTaa < 1:501552/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |