| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,287,116 | G→T | 6.7% | intergenic (+91/‑310) | agaI → / → yraH | putative deaminase AgaI/putative fimbrial protein YraH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,287,116 | 0 | G | T | 6.7% | 449.7 / 15.6 | 134 | intergenic (+91/‑310) | agaI/yraH | putative deaminase AgaI/putative fimbrial protein YraH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/64); new base T (5/4); total (66/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TATCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATC > NC_000913/3286968‑3287265 | tataCCGGCCTCATTTTTATTGGTTCAAATTTACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGc < 1:993305/150‑1 (MQ=255) aTCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGcc > 2:1841855/1‑150 (MQ=255) aTCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGcc > 1:1326050/1‑150 (MQ=255) tCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCg < 2:1561635/150‑1 (MQ=255) tCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCg < 2:1848069/150‑1 (MQ=255) cccGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGa > 2:1073408/1‑150 (MQ=255) ttATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGt > 2:414586/1‑150 (MQ=255) tATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGtt < 1:1428194/150‑1 (MQ=255) gCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGt < 2:759266/150‑1 (MQ=255) cTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGtt < 1:86923/150‑1 (MQ=38) cTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGtt < 1:243701/150‑1 (MQ=255) cTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGtt > 2:1047274/1‑150 (MQ=255) gCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTca < 1:163830/150‑1 (MQ=255) cacaGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaa > 2:735200/1‑150 (MQ=255) cacaGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaa < 2:230116/150‑1 (MQ=255) acaGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaac < 2:602866/150‑1 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTa < 1:249236/141‑1 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaac > 2:401659/1‑149 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaac < 1:401659/149‑1 (MQ=255) gTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaat > 2:1498850/1‑150 (MQ=255) cTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGACGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaa > 1:1351167/1‑150 (MQ=255) cTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACACAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaa < 1:1643246/150‑1 (MQ=255) tATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaattt < 1:1795567/150‑1 (MQ=255) tttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaac > 2:25897/1‑138 (MQ=38) tttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaac < 1:25897/138‑1 (MQ=38) tttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTa > 1:532375/1‑150 (MQ=255) tGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTTGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa < 2:682915/150‑1 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 2:78923/1‑150 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 1:372311/1‑150 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 2:1635722/1‑150 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGCAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 1:759322/1‑150 (MQ=255) aattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATAc < 2:1186046/150‑1 (MQ=255) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAATATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACa < 2:1947937/150‑1 (MQ=255) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaacc > 2:582598/1‑130 (MQ=37) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaacc < 1:582598/131‑2 (MQ=37) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACa < 2:372311/150‑1 (MQ=255) ttaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACat > 1:631668/1‑150 (MQ=255) cacCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATaa < 2:154302/150‑1 (MQ=255) ccTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACt > 1:208937/1‑150 (MQ=255) cTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCTATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACtt < 2:1577349/150‑1 (MQ=255) tAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTg > 1:1203467/1‑150 (MQ=255) aaCCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGt < 2:1726862/150‑1 (MQ=255) aaCCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGt < 1:1354609/150‑1 (MQ=255) aCCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGtt < 1:1101076/150‑1 (MQ=255) aCCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGtt < 2:942904/150‑1 (MQ=255) cAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCt > 2:1897345/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTAtt < 1:1252048/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta > 1:740062/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta > 1:410808/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta > 2:143088/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaat < 2:1326050/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaat < 2:107222/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaata < 1:1980144/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaata < 2:52677/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaata < 1:905965/150‑1 (MQ=255) aaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaataa < 2:140860/150‑1 (MQ=255) aTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTTAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAAt < 1:1811002/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCAc < 2:532375/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCAc > 1:1239231/1‑150 (MQ=255) cAAAATTTTTAAATTTACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg < 2:7334/150‑1 (MQ=255) cAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg > 2:495431/1‑150 (MQ=255) cAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg < 2:1120247/150‑1 (MQ=255) tttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaatt < 1:1612880/102‑1 (MQ=255) tttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaatt > 2:1612880/1‑102 (MQ=255) tttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTg > 2:1806888/1‑150 (MQ=255) tAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGAc > 1:1205157/1‑150 (MQ=255) aaTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTc > 1:261279/1‑150 (MQ=255) aTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCg < 1:1841855/150‑1 (MQ=255) aTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCg > 1:1422634/1‑150 (MQ=255) ttAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGc < 1:853628/150‑1 (MQ=255) aCTTATTTAACAGTCACTATTTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAATAGGAGTTATGTTCAAGAATTTAATTTTAGATATTCATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGcccc < 1:1573646/150‑1 (MQ=255) aagTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAAGTTTAGATATACATAAAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTgg > 2:833182/3‑150 (MQ=255) aTGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTgg < 1:1498850/150‑1 (MQ=255) tGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgc > 1:237654/1‑150 (MQ=255) gTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgcg < 1:1095998/150‑1 (MQ=255) gTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgcg > 1:666149/1‑150 (MQ=255) tAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGAATGGGTTGAACATAAAGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACATCGTATACTGACTAGCCCCCTGgcgc > 2:23529/1‑150 (MQ=255) aCAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCgcag < 2:1643324/150‑1 (MQ=255) cAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCgcagc > 2:1380953/1‑150 (MQ=255) cGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTc < 2:410808/150‑1 (MQ=255) tatTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCAtt < 2:1203467/150‑1 (MQ=255) ttAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAAGCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTta > 2:1339818/1‑150 (MQ=255) aaaTAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTtata > 2:103306/1‑150 (MQ=255) aCATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCtt > 1:1969127/1‑150 (MQ=255) aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCtttt > 2:1269030/1‑150 (MQ=255) tttGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTg < 2:740062/150‑1 (MQ=255) taCTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt < 1:495431/149‑1 (MQ=255) gACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt < 1:1413268/150‑1 (MQ=255) gACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt < 1:1244183/150‑1 (MQ=255) gACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt > 2:935150/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATAc > 1:746085/1‑150 (MQ=255) aattgTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATAc > 1:812938/5‑150 (MQ=37) gggTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACAt < 1:103306/150‑1 (MQ=255) gTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAg > 1:677988/1‑150 (MQ=255) gAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGaaa > 2:431665/1‑150 (MQ=255) cATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAAtt > 1:1143251/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGat > 2:1372315/1‑150 (MQ=255) aCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGata < 2:1969127/150‑1 (MQ=255) cGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGatat > 2:1124852/1‑150 (MQ=255) gCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATc < 2:1143251/150‑1 (MQ=255) | TATCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATC > NC_000913/3286968‑3287265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |