| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,287,127 | A→T | 6.8% | intergenic (+102/‑299) | agaI → / → yraH | putative deaminase AgaI/putative fimbrial protein YraH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,287,127 | 0 | A | T | 6.8% | 449.9 / 15.1 | 143 | intergenic (+102/‑299) | agaI/yraH | putative deaminase AgaI/putative fimbrial protein YraH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/66); new base T (5/5); total (72/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAATGAA > NC_000913/3286981‑3287276 | tttATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAg < 1:393564/150‑1 (MQ=255) ttATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGt > 2:414586/1‑150 (MQ=255) tATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGtt < 2:40888/150‑1 (MQ=255) tATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGtt < 1:1428194/150‑1 (MQ=255) gCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGt < 2:759266/150‑1 (MQ=255) cTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGtt < 1:86923/150‑1 (MQ=38) cTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGtt > 2:1047274/1‑150 (MQ=255) gCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTca < 1:163830/150‑1 (MQ=255) cacaGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaa > 2:735200/1‑150 (MQ=255) acaGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaac < 2:602866/150‑1 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTa < 1:249236/141‑1 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTa > 2:249236/1‑141 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaac < 1:401659/149‑1 (MQ=255) aaCTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaattt < 1:499134/150‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGACGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaa > 1:1351167/1‑150 (MQ=255) cTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACACAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaa < 1:1643246/150‑1 (MQ=255) tATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaattt < 1:1795567/150‑1 (MQ=255) tttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaac > 2:18527/1‑138 (MQ=38) tttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaac < 1:18527/138‑1 (MQ=38) tttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTa > 1:532375/1‑150 (MQ=255) ttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAg > 1:1438419/1‑150 (MQ=255) tGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTTGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa < 2:682915/150‑1 (MQ=255) tGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa < 2:118377/150‑1 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 2:1635722/1‑150 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGCAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 1:759322/1‑150 (MQ=255) aattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATAc < 2:1186046/150‑1 (MQ=255) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAATATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACa < 2:1947937/150‑1 (MQ=255) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaacc < 1:582598/131‑2 (MQ=37) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACa < 2:372311/150‑1 (MQ=255) attaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACa > 2:1550408/1‑150 (MQ=255) ttaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACat > 1:631668/1‑150 (MQ=255) cacCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATaa < 2:154302/150‑1 (MQ=255) ccTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACt > 1:208937/1‑150 (MQ=255) cTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCTATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACtt < 2:1577349/150‑1 (MQ=255) tAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTg > 1:1203467/1‑150 (MQ=255) aaCCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGt < 2:1726862/150‑1 (MQ=255) aCCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGtt < 2:942904/150‑1 (MQ=255) aCCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGtt < 1:1101076/150‑1 (MQ=255) ccAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTc > 2:853628/1‑150 (MQ=255) gATCAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTAt < 1:1629766/150‑1 (MQ=255) aTGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTAtt < 1:1252048/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta > 1:410808/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta > 2:143088/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta > 1:740062/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaat < 2:1326050/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaat < 2:107222/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaata < 1:905965/150‑1 (MQ=255) aaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATaaa < 2:208937/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCAc < 2:532375/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCAc > 1:1239231/1‑150 (MQ=255) cAAAATTTTTAAATTTACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg < 2:7334/150‑1 (MQ=255) cAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg > 2:495431/1‑150 (MQ=255) cAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg < 2:1120247/150‑1 (MQ=255) aaaaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGt > 1:1227768/1‑150 (MQ=255) tttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTg > 2:1806888/1‑150 (MQ=255) tAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGAc > 1:895657/1‑150 (MQ=255) aaTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTc > 1:261279/1‑150 (MQ=255) aTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCg < 1:1841855/150‑1 (MQ=255) ttAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGc < 1:853628/150‑1 (MQ=255) tAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGcc < 1:1360678/150‑1 (MQ=255) aCTTATTTAACAGTCACTATTTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAATAGGAGTTATGTTCAAGAATTTAATTTTAGATATTCATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGcccc < 1:1573646/150‑1 (MQ=255) aagTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAAGTTTAGATATACATAAAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTgg > 2:833182/3‑150 (MQ=255) tGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgc < 1:1294472/150‑1 (MQ=255) tGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgc > 1:237654/1‑150 (MQ=255) tGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgc > 2:1413268/1‑150 (MQ=255) gTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgcg < 1:1095998/150‑1 (MQ=255) gTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgcg > 1:666149/1‑150 (MQ=255) tAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGAATGGGTTGAACATAAAGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACATCGTATACTGACTAGCCCCCTGgcgc > 2:23529/1‑150 (MQ=255) cAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCgcagc > 2:1380953/1‑150 (MQ=255) aagCATAATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACAAAAAGACGATAGCAAAAGGAGTAATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGt > 2:758713/3‑150 (MQ=255) aCGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGt > 2:541111/1‑150 (MQ=255) cGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTc < 2:410808/150‑1 (MQ=255) aTTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAgg < 1:78923/150‑1 (MQ=255) ttAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAAGCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTta > 2:1339818/1‑150 (MQ=255) aaaTAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATAACCTCGTATTCTGACTCGCCACCTGGCGCAGAAAAGTCAGGCATTtata > 2:1630093/1‑150 (MQ=255) aCATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCtt > 1:1969127/1‑150 (MQ=255) aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCtttt > 2:1269030/1‑150 (MQ=255) gACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt > 2:935150/1‑150 (MQ=255) gACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt < 1:1413268/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATAc > 1:746085/1‑150 (MQ=255) tGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACa < 1:23529/150‑1 (MQ=255) gggTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACAt < 1:103306/150‑1 (MQ=255) gTTGAACATAACTACTTTTGCTATCGGCGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTAGTATTCTGACTAGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATaa > 2:1045071/1‑149 (MQ=37) gTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAg > 1:677988/1‑150 (MQ=255) cATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAAtt > 1:1143251/1‑150 (MQ=255) tAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGa > 1:257730/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGat > 2:1372315/1‑150 (MQ=255) aCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGata < 2:1969127/150‑1 (MQ=255) cGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGatat > 2:1124852/1‑150 (MQ=255) cGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCaa > 1:1966614/1‑150 (MQ=255) gATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAat > 2:735866/1‑150 (MQ=255) tAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAatat > 2:456853/1‑150 (MQ=255) tAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAatat < 1:1806888/150‑1 (MQ=255) tcAAAATGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATTTCAATATaa < 2:1279940/149‑1 (MQ=255) gCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAgg < 1:310735/106‑1 (MQ=255) gCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAgg > 2:310735/1‑106 (MQ=255) gCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATaa > 2:1714120/1‑150 (MQ=255) gCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATaa > 1:785955/1‑150 (MQ=255) cAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAAt < 2:1227768/150‑1 (MQ=255) cAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAAt > 1:1534536/1‑150 (MQ=255) | TTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAATGAA > NC_000913/3286981‑3287276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |