Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,374,899 | 0 | T | A | 5.4% | 426.4 / 7.6 | 131 | L11I (TTA→ATA) ‡ | dcuD | putative transporter DcuD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/82); new base A (5/3); total (46/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.28e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGC‑AAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGT‑ATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTCGATCCCACCAAAAGCAGCGGCTACTTGATCGTCGAT > NC_000913/3374750‑3375048 | cacctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGC‑AAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGT‑at > 1:1620182/1‑150 (MQ=255) cctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGC‑AAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGT‑atta < 1:1901762/150‑1 (MQ=255) cctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGC‑AAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGACGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGT‑atta > 1:468108/1‑150 (MQ=255) 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CACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGC‑AAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGT‑ATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTCGATCCCACCAAAAGCAGCGGCTACTTGATCGTCGAT > NC_000913/3374750‑3375048 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |