Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,476,586 | T→C | 10.0% | intergenic (‑146/+21) | yheO ← / ← fkpA | putative DNA‑binding transcriptional regulator YheO/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase FkpA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,476,586 | 0 | T | C | 10.0% | 266.3 / 16.5 | 101 | intergenic (‑146/+21) | yheO/fkpA | putative DNA‑binding transcriptional regulator YheO/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase FkpA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/48); new base C (3/7); total (45/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.41e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGCGCTGGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAATTCGGTGGGATCCCCGGAACAC > NC_000913/3476437‑3476734 | aCATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGt > 2:1045992/1‑150 (MQ=255) cATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTc < 1:1794996/150‑1 (MQ=255) aTGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCa > 1:662925/1‑150 (MQ=255) 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aCCGCCGCCTGACCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGCGCTGGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAATTCGGTGGGAt > 1:1491300/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGCCTGACCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGCGCTGGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAATTCGGTGGGAt > 2:1107432/1‑150 (MQ=255) ccgccTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGGATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGCGCTGGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAATTCGGTGGGATcccc < 1:890849/150‑1 (MQ=255) cgccTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTATTTAGAAGAATCTGCGCCTATCGCATCAGCTTCCGGCTATGCATCAGCCTTCGTCGCTCGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAAATCGGTGGGATACCCg > 2:283041/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGCGCTGGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAATTCGGTGGGATCCCCGGa > 1:2650/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGCGCTGGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAATTCGGTGGGATCCCCGGAacac > 2:242497/1‑150 (MQ=255) | ACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGCGCTGGTTTCACATCCAGCAGCTCTACGTCAAACACCAGGGTAGAATTCGGTGGGATCCCCGGAACAC > NC_000913/3476437‑3476734 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |