| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,616,399 | T→G | 5.4% | V73G (GTG→GGG) | nikC → | Ni(2(+)) ABC transporter membrane subunit NikC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,616,399 | 0 | T | G | 5.4% | 278.8 / 7.6 | 93 | V73G (GTG→GGG) | nikC | Ni(2(+)) ABC transporter membrane subunit NikC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/45); new base G (3/2); total (46/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
GATTGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGT > NC_000913/3616250‑3616548 | gATTGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCgt > 1:679309/1‑150 (MQ=255) aTTGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCgtg < 2:935440/150‑1 (MQ=255) aTTGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCgtg > 1:1432179/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCgtgt > 2:988415/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTc < 2:1262342/150‑1 (MQ=255) tGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTc > 2:1712996/1‑150 (MQ=255) cACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACACGCGGGTCGCtgcc < 1:1585655/150‑4 (MQ=255) aCCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCtcggt < 1:755523/150‑1 (MQ=255) ccagccagTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCtcggtt < 1:460955/150‑1 (MQ=255) ccagccagTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACACGCGGGTCGCtgccat > 2:1317350/1‑145 (MQ=255) cagccagTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCtcggttg < 1:788166/150‑2 (MQ=255) gccagTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCtcggttcgg > 2:10892/1‑150 (MQ=255) gccagTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCtcggttcgg < 1:1947985/150‑1 (MQ=255) ccagTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCATGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCtcggttcggt > 2:1840515/1‑150 (MQ=255) agTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTaa < 2:274888/150‑1 (MQ=255) ggtggCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATgg > 2:353734/1‑150 (MQ=255) ggtggCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCGGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATgg < 2:1783271/150‑1 (MQ=255) tggCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGgcc < 2:359820/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGgcctg < 2:1425064/150‑1 (MQ=255) cTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGgcctgc > 1:126833/1‑150 (MQ=255) tGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGgcctgcc < 1:391160/150‑1 (MQ=255) tGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGgcctgcc < 1:1963993/150‑1 (MQ=255) ccGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGcctgcctg > 1:387152/1‑150 (MQ=255) cGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGTTCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCctgcctgc < 1:1688916/150‑1 (MQ=255) gTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCctgct < 2:1863357/150‑1 (MQ=255) tATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCctgctg > 1:1402230/1‑150 (MQ=255) tGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCctgctgct < 1:1359176/150‑1 (MQ=255) tGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCctgctgct < 1:1366048/150‑1 (MQ=255) gACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCctgctgctg > 1:1106939/1‑150 (MQ=255) cccACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGt > 1:1547472/1‑150 (MQ=255) acaGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCt < 1:659189/150‑1 (MQ=255) aGGCGATTTATTTTCCGTCGCGCCTGCTTTCGCGGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGa < 2:387152/150‑1 (MQ=255) cGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATAACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTAGGTTAGGTAATGGCCTGCATGCTGCTGGTGCTGACAt > 2:870939/1‑150 (MQ=255) gattTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGGCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAggg < 1:1673903/150‑1 (MQ=255) attTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGc > 2:968191/1‑150 (MQ=255) tGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTgg < 2:1246305/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTgg > 1:1598911/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGt > 1:53674/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGtt < 1:540953/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGtt > 1:1856419/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGtt > 2:1642823/1‑150 (MQ=255) gTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGTCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTAt < 1:870939/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTg > 1:198489/1‑150 (MQ=255) 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cTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAgc > 2:1470562/1‑150 (MQ=255) cGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCg > 1:1012254/1‑150 (MQ=255) ccGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCggg < 1:831803/150‑1 (MQ=255) ccGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCggg > 2:1103305/1‑150 (MQ=255) cGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGt < 2:355233/150‑1 (MQ=255) 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aCCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAg < 1:435367/150‑1 (MQ=255) tCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGccac < 1:907113/150‑1 (MQ=255) cTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCAt > 2:1366047/1‑150 (MQ=255) tAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATgc > 2:133931/1‑150 (MQ=255) ggTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATgcgc > 2:1303870/1‑150 (MQ=255) cgATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGc > 1:1399050/1‑150 (MQ=255) atTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGat > 1:531186/1‑150 (MQ=255) tttCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGatat < 1:1470562/150‑1 (MQ=255) tttCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGatat > 1:64091/1‑150 (MQ=255) tctcGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGt > 1:102209/1‑150 (MQ=255) cgcgGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTa < 2:1106939/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTAt > 2:1759327/1‑150 (MQ=255) cTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGAcc > 2:903628/1‑150 (MQ=255) gaaccgaGCGACACGCGGGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCtt > 2:1520785/7‑150 (MQ=255) accgaGCGACACGCGGGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTcc > 1:1534896/5‑150 (MQ=255) gCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCg > 2:49889/1‑150 (MQ=255) gCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCg < 1:1759327/150‑1 (MQ=255) gCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGAcc < 2:53674/150‑1 (MQ=255) cGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCt < 2:126833/150‑1 (MQ=255) cccGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGa > 1:879626/1‑150 (MQ=255) cccGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGa > 2:1453190/1‑150 (MQ=255) ccGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGAt < 2:1432179/150‑1 (MQ=255) acgcgGGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGAt < 2:1534896/149‑1 (MQ=255) tgtCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTCTTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGt < 1:954813/150‑1 (MQ=255) | GATTGCGCTCACCAGCCAGTGGTGGCTGCCGTATGACCCACAGGCGATTGATTTGCCGTCGCGCCTGCTTTCGCCGGATGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGT > NC_000913/3616250‑3616548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |