| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,616,931 | T→A | 5.3% | F250L (TTT→TTA) ‡ | nikC → | Ni(2(+)) ABC transporter membrane subunit NikC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,616,931 | 0 | T | A | 5.3% | 304.3 / 5.1 | 95 | F250L (TTT→TTA) ‡ | nikC | Ni(2(+)) ABC transporter membrane subunit NikC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/45); new base A (2/3); total (47/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.95e-01 | |||||||||||
GCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGT > NC_000913/3616783‑3617079 | gCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTa > 2:1587895/1‑150 (MQ=255) ccATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTAt > 2:1947103/1‑150 (MQ=255) cATATGATGCTGCACGTTGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATc < 1:1852778/150‑1 (MQ=255) tatGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAg < 2:1069560/150‑1 (MQ=255) tgatgCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCg > 1:1802340/1‑150 (MQ=255) gatgCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGt < 2:31574/150‑1 (MQ=255) gatgCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGt > 1:1374622/1‑150 (MQ=255) atgCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTg < 1:1587895/150‑1 (MQ=255) tgctgcACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGa > 2:1412065/1‑150 (MQ=255) ctgcACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGATAAACAGCgccagc < 2:133550/150‑6 (MQ=255) ctgcACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGATAAACAGCgccagc < 2:1215268/150‑6 (MQ=255) ctgcACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGATAAACAGCgccagc < 2:1207799/150‑6 (MQ=255) gcACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACAGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGc > 2:1287578/1‑150 (MQ=255) cACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATc > 1:1587852/1‑138 (MQ=255) cACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATc < 2:1587852/138‑1 (MQ=255) aCGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCt < 2:53859/150‑1 (MQ=255) cGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCACCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCtt > 2:1335597/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCttt > 1:1883963/1‑150 (MQ=255) cgcgGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTaa < 2:32151/150‑1 (MQ=255) gcgGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAAc < 1:1826908/150‑1 (MQ=255) ggggATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCt < 2:1815300/150‑1 (MQ=255) gATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCtggt < 2:402648/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGc > 1:1264395/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTg < 1:1335597/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTgcg > 1:1140043/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTgcgc < 2:1883963/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTgcgc > 1:454305/1‑150 (MQ=255) tCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGcgcg > 2:590063/1‑150 (MQ=255) tCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGCGCTGGCGCTGTTTATCAGCCTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGcgcg > 2:1503459/1‑150 (MQ=255) cGGTGTGACCGCGCCGACGGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATATGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGa < 1:600898/150‑1 (MQ=255) cGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGa < 1:1337666/150‑1 (MQ=255) tgtgACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGatca < 1:1320401/150‑1 (MQ=255) gtgACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGatcat > 1:1007256/1‑150 (MQ=255) gACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCt < 2:1264395/150‑1 (MQ=255) gACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCt > 1:1805263/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCAGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTgg > 1:743582/1‑150 (MQ=255) gcgcCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGAc > 1:196590/1‑150 (MQ=255) gcgcCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGAc < 1:282595/150‑1 (MQ=255) gACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCa > 1:786891/1‑150 (MQ=255) ccgccgAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGTGCTGTTTATCATCGGGATTGCCTTTATCCTTTTGGGTGTCGAAATGCGCGATCATCTGGACCCTCATc < 2:1824111/150‑1 (MQ=255) ccgccgAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATc < 2:786891/150‑1 (MQ=255) cgccgAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCt < 2:1374622/150‑1 (MQ=255) cgccgAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGATGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCt > 1:1501748/1‑150 (MQ=255) gccgAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTg > 1:392019/1‑150 (MQ=255) cgAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGt < 1:206503/150‑1 (MQ=255) gAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGGGACTCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTg < 2:1828798/150‑1 (MQ=255) aaTGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGa < 1:1900077/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGAc < 2:1533258/150‑1 (MQ=255) ggggCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTAACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACgg < 1:17205/150‑1 (MQ=255) ggCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAg < 2:1408369/150‑1 (MQ=255) tgatgaTTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAgcacg > 2:1114847/1‑150 (MQ=255) gatTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGcaca > 2:360308/1‑150 (MQ=255) gatTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGcaca < 1:454037/150‑1 (MQ=255) atTAAAGAAGAGCGCAAGTATATCTGGACCCAGCAGCTGCAAATGTTCTGGACGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCacac > 2:750793/1‑150 (MQ=255) ttAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACt < 1:1788957/150‑1 (MQ=255) ttAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACt > 1:998867/1‑150 (MQ=255) ttAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACACAGCCGCTGCAAATGTTCTGGACGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACt > 2:1627671/1‑150 (MQ=255) gacgCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGc > 1:1279933/1‑150 (MQ=255) gacgCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGc > 1:1611526/1‑150 (MQ=255) gacgCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGc < 1:803482/150‑1 (MQ=255) acgCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGcc > 2:1159186/1‑150 (MQ=255) cgcCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGATGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAAc < 2:1501748/150‑1 (MQ=255) gcCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACa < 1:1412065/150‑1 (MQ=255) 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aaTGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAg < 1:1287578/150‑1 (MQ=255) tGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGc < 1:142260/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCcgc > 1:629726/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCcgcg > 2:373359/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGt > 1:1032266/1‑125 (MQ=255) ccGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGt < 2:1032266/125‑1 (MQ=255) cGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGcc < 2:629726/150‑1 (MQ=255) ggggCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCg < 2:220837/150‑1 (MQ=255) gccatcacgcTGATAAACAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGc > 1:1757606/8‑150 (MQ=255) ccatcacgcTGATAAACAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCt > 1:1491483/7‑150 (MQ=255) cTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTgg < 1:966435/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTgg < 1:590063/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGt < 2:998867/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGc < 2:1814455/134‑1 (MQ=255) ggCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGc > 1:1814455/1‑134 (MQ=255) gcgcTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTac < 2:1411977/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTac > 2:1264242/1‑150 (MQ=255) ttATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGgttt < 1:1264242/150‑3 (MQ=255) | GCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGT > NC_000913/3616783‑3617079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |