Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,647,418 | T→A | 6.7% | S374T (TCT→ACT) | gor → | glutathione reductase (NADPH) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,647,418 | 0 | T | A | 6.7% | 320.1 / 8.9 | 104 | S374T (TCT→ACT) | gor | glutathione reductase (NADPH) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/40); new base A (5/2); total (62/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTG > NC_000913/3647270‑3647567 | ccTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCctc > 2:325939/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCctc < 1:1344927/150‑1 (MQ=255) taataaCAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCAc > 1:1843291/1‑150 (MQ=255) taataaCAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTCGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCAc < 1:483156/150‑1 (MQ=255) taaCAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACcgc > 1:756635/1‑150 (MQ=255) aaCAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGAGGATTTATACACTTTCAcctga < 1:1666893/150‑4 (MQ=255) aCAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGa > 2:676304/1‑150 (MQ=255) aCAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGa > 1:814431/1‑150 (MQ=255) aCAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGa > 1:807677/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGta > 2:1025020/1‑150 (MQ=255) cGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGtata > 1:789155/1‑150 (MQ=255) tGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGAGGATTTATACACTTTCAcct > 1:99072/1‑136 (MQ=255) tGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGAGGATTTATACACTTTCAcct < 2:99072/137‑2 (MQ=255) 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aaaGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGc > 1:119835/1‑150 (MQ=255) tgtATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTcg < 1:1298344/150‑1 (MQ=255) taAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGt < 1:970313/150‑1 (MQ=255) taAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGt > 1:158234/1‑150 (MQ=255) taAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGt > 1:1704455/1‑150 (MQ=255) aaTCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCTCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTgg < 2:279196/150‑1 (MQ=255) aaTCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTgg > 1:279196/1‑150 (MQ=255) ctctTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCt < 2:139392/150‑1 (MQ=255) tctTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTg < 2:463280/150‑1 (MQ=255) | CCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTG > NC_000913/3647270‑3647567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |