Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,654,551 | T→G | 5.4% | intergenic (+24/‑132) | slp → / → dctR | starvation lipoprotein/putative DNA‑binding transcriptional regulator DctR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,654,551 | 0 | T | G | 5.4% | 853.7 / 31.2 | 260 | intergenic (+24/‑132) | slp/dctR | starvation lipoprotein/putative DNA‑binding transcriptional regulator DctR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (133/113); new base G (4/10); total (137/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.64e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.09e-01 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GAAGTGGTTAATACCACCTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACC > NC_000913/3654402‑3654700 | gaAGTGGTTAATACCACCTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCTGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCtt > 1:1622419/1‑150 (MQ=255) ggTTAATACCACCTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCa > 1:1782420/1‑150 (MQ=255) gTTAATACCACCTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAg < 1:1192231/150‑1 (MQ=255) tAATACCACCTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCa > 1:1045766/1‑150 (MQ=255) caccTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGca < 1:914713/150‑1 (MQ=255) caccTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGca < 2:81455/150‑1 (MQ=255) caccTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGca < 1:1949679/150‑1 (MQ=255) caccTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGca < 2:267772/150‑1 (MQ=255) accTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGcat < 1:1619243/150‑1 (MQ=255) accTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGcat < 1:398740/150‑1 (MQ=255) accTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGcat < 2:572446/150‑1 (MQ=255) ccTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGcatc < 1:456426/150‑1 (MQ=255) cTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGcatca > 2:1363131/1‑150 (MQ=255) ataACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATg < 2:873346/150‑1 (MQ=255) aCCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGca < 1:362177/142‑1 (MQ=255) aCCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACCACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCAt > 2:1635125/1‑150 (MQ=255) ccTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCAtt < 1:961641/150‑1 (MQ=255) tgtgGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTg > 1:409524/1‑137 (MQ=255) tgtgGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTAc > 2:50204/1‑150 (MQ=255) tgGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACAt > 2:289246/1‑150 (MQ=255) gATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCaa > 1:1566682/1‑150 (MQ=255) ttACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAAt < 1:1099915/150‑1 (MQ=255) aCGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTa > 2:1370778/1‑150 (MQ=255) gCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATa < 1:1264576/150‑1 (MQ=255) gCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATa < 1:1040816/150‑1 (MQ=255) tATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATaca < 1:1510961/150‑1 (MQ=255) aTTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGc < 1:772921/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCt < 1:1518327/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTa < 1:845000/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAAc > 1:233266/1‑150 (MQ=255) ggCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATa > 2:454686/1‑135 (MQ=255) ccGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCGTCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACtat > 1:511733/1‑150 (MQ=255) gAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACtattat < 2:805655/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACtattattattat > 2:387113/1‑150 (MQ=255) cTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATaa > 2:1988836/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAg < 1:1214633/150‑1 (MQ=255) ggggTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGAAGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGc > 2:243723/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCCCCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGccc > 2:1921053/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGccc > 1:818277/1‑150 (MQ=255) gcCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGTATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCcctgtcc < 1:276514/150‑1 (MQ=255) cTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCcctgtcctg < 1:1741751/150‑1 (MQ=255) ttACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCcctgtcctgt > 2:768743/1‑150 (MQ=255) ttACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCcctgtcctgt < 2:1529416/150‑1 (MQ=255) ttACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCcctgtcctgt < 1:1284182/150‑1 (MQ=255) tactacACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGtt < 2:1513949/150‑1 (MQ=255) ctacACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTaa < 1:191818/150‑1 (MQ=255) acacCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAAtt < 1:562686/150‑1 (MQ=255) cAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCt > 1:75998/1‑150 (MQ=255) aaTGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCtt < 2:522883/150‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAAc > 1:310226/1‑113 (MQ=255) aTGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCttt > 2:1100907/1‑150 (MQ=255) gCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTgg < 1:1765209/150‑1 (MQ=255) gCGGGGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTgg < 2:1617242/150‑1 (MQ=255) cGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGc > 2:1956801/1‑150 (MQ=255) cGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGc < 2:1876472/150‑1 (MQ=255) cGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGc > 2:1066363/1‑150 (MQ=255) gTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTg < 2:657023/150‑1 (MQ=255) cAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGAt > 2:1488269/1‑150 (MQ=255) cAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGAAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGAt > 2:1730420/1‑150 (MQ=255) cacCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAg > 1:428340/1‑150 (MQ=255) cacCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAg < 1:666976/150‑1 (MQ=255) cacCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAAGACACAGTAAGCTAACTATTATTATTTTAAGCCCTGTCCTGTTAGTTACCTTTGGCAAACAGATAATAAAg > 2:833473/1‑150 (MQ=255) acCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGt < 2:1289278/150‑1 (MQ=255) acCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGt < 2:1469978/150‑1 (MQ=255) tGAGCTTGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTaa < 1:1832007/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTACCTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAAt > 1:1389170/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAAt < 2:1043054/150‑1 (MQ=255) tGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTcc < 2:1591770/150‑1 (MQ=255) ggTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATATACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCg < 1:1370778/150‑1 (MQ=255) ggTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCg > 1:650457/1‑150 (MQ=255) ggTAAAATAACACAACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTAAAAGCCCTGTCCTCATAATTACATTTGGCAAACTGATTATAAAGTAAATGTccc > 1:101762/1‑149 (MQ=255) gTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGc > 2:1237116/1‑150 (MQ=255) tCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCa > 2:178441/1‑150 (MQ=255) cAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCAc > 1:884994/1‑150 (MQ=255) cAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCAc > 2:1214276/1‑150 (MQ=255) tAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAgg > 1:1971244/1‑150 (MQ=255) tAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAgg < 1:1335546/150‑1 (MQ=255) tAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAgg < 1:681574/150‑1 (MQ=255) aaCACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGa > 2:892113/1‑150 (MQ=255) ccaccGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCg > 1:1032976/1‑150 (MQ=255) caccGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGtt < 2:1677488/129‑1 (MQ=255) accGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGt > 1:812735/1‑150 (MQ=255) aatgcatgatgcagatgcTGAGAAAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGt > 1:1725390/8‑150 (MQ=39) aatgcatgatgcagatgcTGAGAAAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGt > 2:1412213/8‑150 (MQ=39) cGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGttt > 1:1872621/1‑149 (MQ=255) cGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTa > 1:1865847/1‑150 (MQ=255) aaaGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATg < 1:166063/150‑1 (MQ=255) atgatgcagatgcTGAGAAAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGt > 2:680207/3‑150 (MQ=255) atgcagatgcTGAGAAAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTg > 1:630633/1‑101 (MQ=38) tgcagatgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCt > 2:1853188/1‑150 (MQ=255) gcagatgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCtt < 1:1702313/150‑1 (MQ=255) cagatgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTta > 2:1031042/1‑150 (MQ=255) cagatgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTta > 2:1885846/1‑150 (MQ=255) gatgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGTAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTtata < 2:357333/150‑1 (MQ=255) gatgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTtata < 1:1488269/150‑1 (MQ=255) gatgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAAATATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTtata > 2:957498/1‑150 (MQ=255) tgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAAt > 2:1547812/1‑150 (MQ=255) tgcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGCTATGTTTCTTATAAt > 2:1809421/1‑150 (MQ=255) gcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAAtt < 1:1274433/150‑1 (MQ=255) gcTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGACGGTTATGTTTCTTATAAtt > 2:1152942/1‑150 (MQ=255) | GAAGTGGTTAATACCACCTATAACCTGTGGGATTACGGCTATGGTGCATTCTGGCCGGAACCGGGCTGGGGTGCGCCTTACTACACCAATGCGGTGAGTCAGGTAACACCTGAGCTGGTCAAATAACACCACCGAAAGATGCAGATGCTTTCTCAGCATCTGCATCATGCATTACATCAAATTAATACACAGTAAGCTAACTATTATTATTATAAGCCCTGTCCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACC > NC_000913/3654402‑3654700 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |