Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 469,577 | G→T | 5.7% | R236L (CGG→CTG) | mdlA → | ABC transporter family protein MdlA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 469,577 | 0 | G | T | 5.7% | 236.7 / 2.9 | 70 | R236L (CGG→CTG) | mdlA | ABC transporter family protein MdlA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/33); new base T (2/2); total (35/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 |
CTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGTTTTATGATGTATTT > NC_000913/469432‑469721 | cTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTg < 2:101763/150‑1 (MQ=255) tGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTgg > 2:1741276/1‑150 (MQ=255) acaGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGcgcg < 2:664961/150‑1 (MQ=255) caGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGt > 2:1813682/1‑150 (MQ=255) ggcggcGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCTGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATTCGGGTGGCGCGTAt < 2:1760374/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTAtt < 2:1667990/150‑1 (MQ=255) cggcgTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTg < 1:1703927/150‑1 (MQ=255) ggcgTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGa < 1:227490/150‑1 (MQ=255) ttttCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCt > 1:958386/1‑150 (MQ=255) tttCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTc < 1:1375849/150‑1 (MQ=255) ccAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGtt > 1:1870744/1‑150 (MQ=255) aGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTc < 2:1870744/150‑1 (MQ=255) aGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTc < 1:511587/150‑1 (MQ=255) aGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTCGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTc > 2:613608/1‑150 (MQ=255) ttaTGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTcgacct < 2:920231/148‑2 (MQ=255) gCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCt < 2:958386/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTatat < 1:1861185/150‑1 (MQ=255) cAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGC‑AAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATcg > 2:1064441/1‑150 (MQ=255) ggAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATcgc < 1:833248/150‑1 (MQ=255) gCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTg > 2:1706016/1‑150 (MQ=255) ccTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTgg < 1:978768/150‑1 (MQ=255) cACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTAt > 2:84392/1‑150 (MQ=255) aCCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATg < 1:1741276/150‑1 (MQ=255) attATCCGCATCATCAAAGCATTTGCTCTGGAAGATCTCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCCGAAAAAAAAACATCCGTGAGCCGATTATTTATGCACCTATCGACCCGACCATCTATATCCCGATTGGTATggag > 2:1823879/3‑148 (MQ=255) aTCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAAc > 1:661319/1‑150 (MQ=255) aTCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAAc > 2:206244/1‑150 (MQ=255) ccGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACtt > 2:795906/1‑150 (MQ=255) cGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTg > 1:1034351/1‑150 (MQ=255) cGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTg > 1:1041259/1‑150 (MQ=255) cATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTCGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCt < 1:613608/150‑1 (MQ=255) aTGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTg < 2:1915637/150‑1 (MQ=255) tGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTgg < 1:1128062/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGAtt > 2:882365/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGAtt > 1:1306906/1‑150 (MQ=255) tGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGcggcgg < 1:867766/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGt > 2:1855947/1‑150 (MQ=255) ggAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTg > 2:1785556/1‑150 (MQ=255) ggAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTg > 1:1148231/1‑150 (MQ=255) gAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTgg > 1:944222/1‑150 (MQ=255) gAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAAAATGCGGGTGGCGCGTATTGATGTTCGTTTCGACCCCACCATCTATATAGCGATTGGTATGGCGAACTTGATGGCGATTGGCGGCGGTAGTTgg > 2:663924/1‑150 (MQ=255) aGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGAt < 2:1195498/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATcgc < 2:1327395/101‑1 (MQ=255) cGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATcgc > 1:1327395/1‑101 (MQ=255) gCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGAtggtgg < 2:1306906/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGAtggtgg < 1:1823879/150‑1 (MQ=255) gCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGc < 1:1813682/150‑1 (MQ=255) gCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGc < 2:506071/150‑1 (MQ=255) gCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGc < 1:84392/150‑1 (MQ=255) tATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGtt > 1:1855914/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTaa > 1:1303763/1‑150 (MQ=255) gCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCTGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACg > 2:1304265/1‑150 (MQ=255) gCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCTGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACg > 2:1310869/1‑150 (MQ=255) ccGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCTGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGc < 1:1304265/150‑1 (MQ=255) ccGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCTGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGc < 1:1310869/150‑1 (MQ=255) ggATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTggg < 2:1148231/150‑1 (MQ=255) aTGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGcc > 2:1818824/1‑150 (MQ=255) tGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAATTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCa > 2:1848103/1‑150 (MQ=255) gCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAg < 1:882365/150‑1 (MQ=255) ccGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGc > 2:882138/1‑150 (MQ=255) ccGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGGGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGAGGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGc < 1:1602776/150‑1 (MQ=255) ccGAACATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGAGCGTATTGATGATCGTTTCGACCCGACCAACTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGATGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGc > 2:1658849/1‑150 (MQ=255) cGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCt > 2:509730/1‑150 (MQ=255) ccGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGtt > 2:985170/1‑150 (MQ=255) ccGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGtt > 1:822304/1‑150 (MQ=255) cGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGttt > 2:601765/1‑150 (MQ=255) ggCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGtttt > 2:381740/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaCATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGTTTTatga < 1:158860/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaCATGCGGGGGGCGCGTCTTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGTTTTatga < 1:1938748/150‑1 (MQ=255) cATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGTTTTATGATGTAttt < 2:944222/150‑1 (MQ=255) cATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGTTTTATGATGTAttt < 2:1303763/150‑1 (MQ=255) | CTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTGGTATGGCGAACTTGCTGGCGATTGGCGGCGGTAGTTGGATGGTGGTGCAGGGCAGTTTAACGCTGGGCCAGCTCACCAGTTTTATGATGTATTT > NC_000913/469432‑469721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |