| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 493,126 | T→G | 5.6% | R345R (CGT→CGG) R345R (CGT→CGG) |
dnaX → dnaX → |
DNA polymerase III subunit tau DNA polymerase III subunit tau |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 493,126 | 0 | T | G | 5.6% | 277.0 / 7.5 | 89 | R345R (CGT→CGG) R345R (CGT→CGG) | dnaX dnaX | DNA polymerase III subunit tau DNA polymerase III subunit tau |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/45); new base G (3/2); total (42/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.86e-01 | |||||||||||
ACTTTCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTGCCGCCGCAACCGCAAT > NC_000913/492979‑493274 | aCTTTCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCg < 1:1095626/150‑1 (MQ=255)aCTTTCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCg > 1:1966186/1‑150 (MQ=255)aCTTTCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCg < 2:741679/150‑1 (MQ=255) cTTTCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGc > 2:1586295/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCAt > 2:1304070/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCAt < 2:389214/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGACGGTCCGGCGCAtacg < 2:50670/150‑4 (MQ=255) ccTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGc > 1:988593/1‑150 (MQ=255) ctgctgCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGTGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCg > 2:498430/1‑150 (MQ=255) ctgctgCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCg < 1:305427/150‑1 (MQ=255) ctgctgCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGACGGTCCGGCGCAtacggt < 2:1982017/150‑6 (MQ=255) gctgcACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGtt < 2:1847754/150‑1 (MQ=255) gcACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTgag < 1:976272/150‑1 (MQ=255) aCTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGAt < 2:341415/150‑1 (MQ=255) tGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGAc < 1:40195/150‑1 (MQ=255) cAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTgaga < 1:244427/143‑1 (MQ=255) cAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTgaga > 2:244427/1‑143 (MQ=255) cAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACgct > 2:1589701/1‑150 (MQ=255) aCGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACgctgc < 1:1041982/150‑1 (MQ=255) gACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGctgctg < 2:1561810/150‑1 (MQ=255) cATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTgcg < 2:1451394/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTgcgc > 1:1715659/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTgcgcgc > 1:1252394/1‑150 (MQ=255) gccgccATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGCCGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTTCTgcgcgcg < 2:1966186/150‑1 (MQ=255) cgccATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCt < 2:148112/150‑1 (MQ=255) gccATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTgag > 1:1899874/1‑129 (MQ=255) gccATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTgag > 1:1906972/1‑129 (MQ=255) gccATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTgag < 2:1899874/129‑1 (MQ=255) gccATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTgag < 2:1906972/129‑1 (MQ=255) ccATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTgg < 1:1059249/150‑1 (MQ=255) gAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTc < 2:336791/150‑1 (MQ=255) gAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTc < 2:1792598/150‑1 (MQ=255) tGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATc < 1:417618/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGTGAACTGGCGCACACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCcg < 1:201604/150‑1 (MQ=255) 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ggCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGcc > 2:1399187/1‑150 (MQ=255) cgcgcACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTg > 2:891628/1‑150 (MQ=255) cACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGcc < 2:1963265/150‑1 (MQ=255) ccATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAg > 1:1823304/1‑150 (MQ=255) ccATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAg > 1:444404/1‑150 (MQ=255) cATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGa < 2:1823304/150‑1 (MQ=255) ccgccgACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTg > 1:961179/1‑150 (MQ=255) ccgccgACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACAGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGAGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTg > 1:961180/1‑150 (MQ=255) cgccgACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGc > 1:190265/1‑150 (MQ=255) cgACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCAc < 2:214460/150‑1 (MQ=255) 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cccaTGCGACGGTCCGGCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTgc > 1:1438445/4‑150 (MQ=255) cccaTGCGACGGTCCGGCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTgc > 1:1208294/4‑150 (MQ=255) gTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTgcc < 2:889216/150‑1 (MQ=255) caTGCGACGGTCCGGCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTgccg > 1:1453492/2‑150 (MQ=255) gcCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCTTCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTGCCGccgca < 2:1164759/150‑1 (MQ=255) ggACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTGCCGccgcaacc > 1:1644533/1‑150 (MQ=255) ggACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTGCCGccgcaacc > 2:769234/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTGCCGccgcaaccgca > 1:1128752/1‑150 (MQ=255) gTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTGCCGCCGCAACCGCAAt > 2:1956328/1‑150 (MQ=255) | ACTTTCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCGGACCGTCGCATGGGCGTTGAGATGACGCTGCTGCGCGCGCTGGCATTCCATCCGCGTATGCCGCTGCCTGAGCCAGAAGTGCCACGACAGTCCTTTGCACCCGTCGCGCCAACGGCAGTAATGACGCCAACCCAGGTGCCGCCGCAACCGCAAT > NC_000913/492979‑493274 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |