Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,815,819 | C→G | 5.4% | intergenic (‑51/+44) | pyrE ← / ← rph | orotate phosphoribosyltransferase/truncated RNase PH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,815,819 | 0 | C | G | 5.4% | 703.8 / 20.4 | 205 | intergenic (‑51/+44) | pyrE/rph | orotate phosphoribosyltransferase/truncated RNase PH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (92/102); new base G (6/5); total (98/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.52e-01 |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
AGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCC > NC_000913/3815672‑3815967 | ggggCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGt > 2:1783479/1‑150 (MQ=255) ggggCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGt > 1:865890/1‑150 (MQ=255) gtcTTTTTCGCCGGGATTTCAGCGTAAACTAGCCAAAATTTAACAGCTGATTGCTAAGCGAAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGTTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAAAAAAAAAAGGCGAGTCATCAGTCg < 2:649066/148‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |