Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,002,400 | 0 | T | A | 6.1% | 1176.7 / 40.6 | 359 | intergenic (+24/+19) | corA/yigF | Ni(2(+))/Co(2(+))/Mg(2(+)) transporter/DUF2628 domain‑containing protein YigF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (170/166); new base A (10/12); total (181/178) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.66e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
ATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACC‑TGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATA > NC_000913/4002252‑4002549 | ggCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGc < 2:1101209/150‑1 (MQ=255) ggCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGc > 2:36377/1‑150 (MQ=255) gCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCt > 2:302018/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |