Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,286,116 | C→G | 5.3% | G419A (GGC→GCC) | acs ← | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,286,116 | 0 | C | G | 5.3% | 867.6 / 24.2 | 252 | G419A (GGC→GCC) | acs | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (121/117); new base G (2/12); total (123/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.10e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
AGTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTA > NC_000913/4285967‑4286265 | gTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGACCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGGAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAAccgcc > 2:1418081/1‑150 (MQ=255) tGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGttt < 1:520604/150‑1 (MQ=255) gATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTc > 2:1287156/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGt > 2:1902056/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGt > 1:1846028/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGt > 1:1086835/1‑150 (MQ=255) acaaGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTc > 1:1980962/4‑150 (MQ=255) aCCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTc < 1:782375/150‑1 (MQ=255) 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tACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGccacc > 1:1435631/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTAt > 1:908950/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATc > 2:1101803/1‑150 (MQ=255) gTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCg < 1:210121/150‑1 (MQ=255) tGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGa < 1:1551899/150‑1 (MQ=255) 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cgccgGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCtt < 2:330334/150‑1 (MQ=255) ccgGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTa > 2:162361/1‑150 (MQ=255) | AGTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTA > NC_000913/4285967‑4286265 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |