| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,157,632 | A→T | 6.9% | intergenic (+58/‑237) | ycfH → / → ptsG | putative metal‑dependent hydrolase YcfH/glucose‑specific PTS enzyme IIBC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,157,632 | 0 | A | T | 6.9% | 321.3 / 10.2 | 102 | intergenic (+58/‑237) | ycfH/ptsG | putative metal‑dependent hydrolase YcfH/glucose‑specific PTS enzyme IIBC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/46); new base T (5/2); total (54/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TTGCCGTTGAAGAACTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGC > NC_000913/1157486‑1157778 | ttGCCGTTGAAGAACTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAAtt < 1:441923/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTGAAGAACTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTg < 1:23467/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGAACTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCg > 1:1585708/1‑150 (MQ=255) gaagaaCTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTg < 2:770750/150‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTg < 2:688799/150‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTg < 2:682052/150‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTg < 2:41300/150‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTg > 1:923284/1‑150 (MQ=255) gaagaaCTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTg > 1:41300/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAAc > 1:65410/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGaacttt > 2:872963/1‑146 (MQ=255) tGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAAcc > 2:1593296/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCCAAAATTGGGCGGTGAATAAcc > 2:1280739/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCa > 2:935048/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCa > 1:1981857/1‑150 (MQ=255) aGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGttt < 2:1231084/150‑1 (MQ=255) ccaccGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAata > 2:1163159/1‑150 (MQ=255) ccaccGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAata > 2:1901396/1‑150 (MQ=255) ccaccGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAata > 1:1933462/1‑150 (MQ=255) ccGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAATATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtg < 1:1038264/150‑1 (MQ=255) cGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGGTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtgt > 1:1725619/1‑150 (MQ=255) gATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtgtg < 1:1816726/150‑1 (MQ=255) gATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtgtg < 1:567784/150‑1 (MQ=255) aTAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGa < 2:835803/150‑1 (MQ=255) tAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGAc < 1:1278867/150‑1 (MQ=255) tAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGAc < 1:1285715/150‑1 (MQ=255) attagCCCGTCTGATTCACATCAACGCTTCCCGCATTCAATCCATAAGAAGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTAGTAATTAATGGCTAAAAAGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGCGCGATGAATAACCAAGTTTGAAATATTGTGACata > 2:138546/5‑150 (MQ=255) cGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGt > 2:1549261/1‑150 (MQ=255) cGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGt > 1:1077965/1‑150 (MQ=255) gcacGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAATCTCGTAATTAATCGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAAATGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATCtt > 2:652768/4‑150 (MQ=255) gCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTTGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGtt > 2:564441/1‑150 (MQ=255) gTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGt < 1:321428/150‑1 (MQ=255) tGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCATCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACTAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCaa < 2:1854908/150‑1 (MQ=255) tCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtg > 2:500920/1‑150 (MQ=255) acaTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑GTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtgtg > 1:291916/1‑150 (MQ=255) caTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGc > 2:1297940/1‑150 (MQ=255) aTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGCTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCa > 1:164562/1‑150 (MQ=255) cGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAc > 2:1360137/1‑150 (MQ=255) gACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGttt > 2:1379851/1‑112 (MQ=255) gACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGttt < 1:1379851/112‑1 (MQ=255) gACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTAAAAATTTGaaagt > 1:241896/1‑148 (MQ=255) cTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTtctc < 1:1593296/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTcc < 2:672533/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTcc > 1:1709117/1‑150 (MQ=255) ttCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTcc < 2:896467/150‑1 (MQ=255) tCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCTAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCa < 2:223202/150‑1 (MQ=255) ccGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCaa < 1:687669/150‑1 (MQ=255) gCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGa < 1:935048/150‑1 (MQ=255) ccTTCAATCCATCCGTTTAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCC‑TAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATc < 2:880883/150‑1 (MQ=255) cTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATc > 1:1356710/1‑150 (MQ=255) tCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTg > 1:999401/1‑150 (MQ=255) atccatccGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAg > 2:58475/1‑150 (MQ=255) atccatccGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAg < 1:1336242/150‑1 (MQ=255) catccGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTg > 2:1016605/1‑150 (MQ=255) gTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACg < 2:194267/150‑1 (MQ=255) gTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACg < 1:1549261/150‑1 (MQ=255) gTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACg < 1:1016605/150‑1 (MQ=255) ttGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGt < 2:65410/150‑1 (MQ=255) aaTGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGAt > 2:486491/1‑150 (MQ=255) aaTGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGAt < 2:299788/150‑1 (MQ=255) ttttttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTc > 1:1127154/1‑150 (MQ=255) ttttttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTc < 1:935559/150‑1 (MQ=255) ttttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaa < 2:1510728/150‑1 (MQ=255) ttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaac < 2:1077965/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaaca < 2:1151712/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaaca < 1:58475/150‑1 (MQ=255) aGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAAt > 1:1994046/1‑150 (MQ=255) aGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTACTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAAt > 1:998335/1‑150 (MQ=255) cGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGc < 2:1725619/150‑1 (MQ=255) gTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGAACTGAATTTGAAACTTGATAGCCGACAAACAAATTGGCa > 1:1070350/1‑150 (MQ=255) taattaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCag > 1:1919319/1‑149 (MQ=255) ttaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGACGAAAATTGGGCGGTGAATAACCCCGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAAAGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGa > 2:55787/1‑150 (MQ=255) taatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGaa < 2:1981857/150‑1 (MQ=255) aatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAat > 2:370998/1‑150 (MQ=255) ggCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTgg > 1:33330/1‑139 (MQ=255) ggCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTgg < 2:33330/139‑1 (MQ=255) cTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTAttt > 2:434975/1‑150 (MQ=255) tAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTAtttt < 1:1901396/150‑1 (MQ=255) aaaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTAc < 1:697386/150‑1 (MQ=255) aaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTAct > 1:1767106/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTAct > 1:873451/1‑150 (MQ=255) gAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCtg < 2:1936954/150‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCAAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCtgtg > 1:1958748/1‑150 (MQ=255) tAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCTAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTgtgt > 1:1788249/1‑150 (MQ=255) aaaGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTTATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGta < 1:1280739/150‑1 (MQ=255) ttattCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGtaa > 1:680086/4‑150 (MQ=255) tattCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTAttt < 1:1067336/135‑1 (MQ=255) tattCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTAttt > 2:1067336/3‑137 (MQ=255) tCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTaataaa > 1:1675506/1‑150 (MQ=255) cACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTaataaat > 2:680738/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTaataaata > 1:1581614/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTaataaata < 2:1933462/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTaataaata < 2:1273890/150‑1 (MQ=255) ccgcccAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAataaataa > 1:1723963/1‑150 (MQ=255) cgccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGAAATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATTATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAAtaaataaa < 1:1297940/150‑1 (MQ=255) gccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCAGGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAg < 1:652768/150‑1 (MQ=255) gccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAg < 1:564441/150‑1 (MQ=255) ccgAAAATTGGGCTGTTAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATTTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTTAAGTTGAAACGTGATAGCAGTAAAACAAATTGTCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAgg < 1:138546/150‑1 (MQ=255) gAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGgc > 1:1893447/1‑150 (MQ=255) gAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGgc > 1:528626/1‑150 (MQ=255) | TTGCCGTTGAAGAACTGGCGCAGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAG‑TTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGC > NC_000913/1157486‑1157778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |