Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,212,470 | 0 | A | C | 6.1% | 503.8 / 16.5 | 157 | intergenic (‑166/+70) | ymgK/ymgL | protein YmgK/protein YmgL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/78); new base C (5/5); total (74/83) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAA‑TTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATGTTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCC > NC_000913/1212321‑1212619 | tataACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAA‑TTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGa < 1:216287/150‑1 (MQ=255) gATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAA‑TTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGtgtg < 2:1376336/150‑1 (MQ=255) ataataATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGtgtg < 1:126401/150‑1 (MQ=255) 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TATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAA‑TTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATGTTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCC > NC_000913/1212321‑1212619 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |