| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,237,611 | C→G | 7.1% | A14G (GCC→GGC) | dadA → | D‑amino acid dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,237,611 | 0 | C | G | 7.1% | 228.1 / 7.9 | 70 | A14G (GCC→GGC) | dadA | D‑amino acid dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/24); new base G (2/3); total (43/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.24e-01 | |||||||||||
CACCATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAG > NC_000913/1237470‑1237760 | cACCATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCt > 2:1198191/1‑150 (MQ=255)cACCATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGCTGGCAACGCCt < 1:88425/150‑1 (MQ=255) aCCATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTg < 1:373254/150‑1 (MQ=255) aCCATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTg < 1:477475/150‑1 (MQ=255) ccATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGCTGGCAACGCCtac < 1:799853/150‑3 (MQ=255) cATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGt < 2:1431262/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTa < 2:683245/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGCTGGCAACGCCtaccaca < 2:119110/150‑7 (MQ=255) aaaGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTaa > 2:963906/1‑150 (MQ=255) cGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATcag < 1:680226/150‑1 (MQ=255) tGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATcaggcag > 1:1911228/1‑150 (MQ=255) tGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATCCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATcaggcag < 2:1030313/150‑1 (MQ=255) gTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATcaggcagg < 2:453567/150‑1 (MQ=255) gTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATcaggcagg < 2:794305/150‑1 (MQ=255) ttGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGa > 1:1506952/1‑150 (MQ=255) gAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACa < 1:227861/150‑1 (MQ=255) ataataTTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATg > 1:837665/1‑150 (MQ=255) taataTTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGa > 2:200139/1‑150 (MQ=255) taataTTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGa < 1:1198191/150‑1 (MQ=255) atatTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAgg < 1:490913/150‑1 (MQ=255) atTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTc > 2:1939486/1‑150 (MQ=255) atTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTc > 1:1991818/1‑150 (MQ=255) ttCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCAcc < 2:454185/150‑1 (MQ=255) gTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGAt > 2:35636/1‑150 (MQ=255) ttATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATc > 1:431227/1‑150 (MQ=255) aTCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCgg > 1:1966231/1‑150 (MQ=255) cAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGa > 1:1315355/1‑150 (MQ=255) tgATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGTGAATTGGTTTGGTAGGCGTTGCCAGAGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTTATCGTGAGCCgtgg < 2:843795/150‑1 (MQ=255) tgATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCgggg > 1:1408259/1‑150 (MQ=255) attagattaTTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGgc > 1:926670/1‑150 (MQ=255) ttagattaTTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGgcc < 1:200139/150‑1 (MQ=255) ttagattaTTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGgcc < 1:963906/150‑1 (MQ=255) gattaTTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGgccgcc > 2:1235103/1‑150 (MQ=255) gattaTTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGgccgcc > 2:1232588/1‑150 (MQ=255) ttattattCTTTTACTTTATCTACCGTAATCGGACTGGCTATGCGATTTGTCATACTCCCAACAGCTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAAACAGGCAGTACATGAGGTCACCCTCATTGATCTGGAGCCGGGGCCCGCCCt > 2:373167/1‑150 (MQ=255) tACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGc > 2:1632962/1‑150 (MQ=255) tACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGc > 2:1414604/1‑150 (MQ=255) aCTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGcc > 2:247413/1‑150 (MQ=255) cTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGCGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCcg > 2:351342/1‑150 (MQ=255) aCCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTACCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGcc > 1:176162/1‑150 (MQ=255) cgatcctCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCg < 1:1998497/144‑1 (MQ=255) aTCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCaa > 2:1456137/1‑150 (MQ=255) tCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCaaa > 1:1436030/1‑150 (MQ=255) gCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTccccc > 1:946390/1‑150 (MQ=255) cTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCg > 1:1832074/1‑150 (MQ=255) tGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGat < 2:431227/150‑1 (MQ=255) tGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGat > 1:964842/1‑150 (MQ=255) tGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGat > 2:1605015/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGatat > 1:1938170/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGatat < 2:1966231/150‑1 (MQ=255) cTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTgg > 1:256450/1‑150 (MQ=255) gggAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGggc < 1:1414604/150‑1 (MQ=255) aGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCCCCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCa > 2:1807856/1‑150 (MQ=255) gtggtgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCAc > 2:1527581/1‑150 (MQ=255) gtggtgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCAc < 2:1199773/150‑1 (MQ=255) gtgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAg < 2:926670/150‑1 (MQ=255) gtgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAg > 1:66524/1‑150 (MQ=255) tgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAgg > 2:955028/1‑150 (MQ=255) tgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGACACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAgg > 1:985904/1‑150 (MQ=255) agtaccaGGCGCTGGCAACGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAgg > 1:1364424/7‑150 (MQ=255) agtaccaGGCGCTGGCAACGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTCCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAgg > 1:1040302/7‑150 (MQ=255) tggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGgtg > 1:1640365/1‑150 (MQ=255) ggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGgtgt > 2:1507259/1‑150 (MQ=255) gtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGtgtg < 1:1235103/150‑1 (MQ=255) tAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTTTATCTGGCTGGACATGTGGTGACCGTCTTTGATCGGGTGCCGGGGGCCGCCCTGGTAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGc < 2:828120/150‑1 (MQ=255) tAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGc > 2:1001996/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGcc > 2:1787596/1‑150 (MQ=255) gTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTa > 2:1520046/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa > 1:1595755/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa < 1:35636/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAg > 2:627837/1‑150 (MQ=255) | CACCATAAAAAAGCCGCATGTTGAATAATATTTTCAACTGAGTTATCAAGATGTGATTAGATTATTATTCTTTTACTGTATCTACCGTTATCGGAGTGGCTATGCGAGTTGTCATACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAG > NC_000913/1237470‑1237760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |