Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,413,968 | A→G | 5.0% | intergenic (‑41/+16) | ralR ← / ← recT | Rac prophage; endodeoxyribonuclease toxin RalR/Rac prophage; recombinase, DNA renaturation |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,413,968 | 0 | A | G | 5.0% | 1013.1 / 23.9 | 317 | intergenic (‑41/+16) | ralR/recT | Rac prophage; endodeoxyribonuclease toxin RalR/Rac prophage; recombinase, DNA renaturation |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (142/159); new base G (5/11); total (147/170) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.04e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
TTCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGA > NC_000913/1413819‑1414117 | ttCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACACCCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTa > 2:677682/1‑150 (MQ=255) tCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTac < 2:537701/150‑1 (MQ=255) cGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTaca > 2:1436735/1‑150 (MQ=255) gggATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTacac > 2:296238/1‑150 (MQ=255) ggATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACAcc > 2:444261/1‑150 (MQ=255) gATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCg > 1:1123256/1‑150 (MQ=255) tCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGTAATGCACCGCCa < 1:345308/150‑1 (MQ=255) cGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAg > 2:1179847/1‑150 (MQ=255) gCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGTAATGCACCGCCaac < 1:541529/150‑3 (MQ=255) gCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAgg > 1:593071/1‑150 (MQ=255) acacTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAattat > 1:612723/1‑150 (MQ=255) cacTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAattatt < 1:1554656/150‑1 (MQ=255) cacTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCACCAGGCTGAattatt > 1:448954/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTcc < 2:913778/150‑1 (MQ=255) cTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTcc > 1:559423/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTcc > 1:1453064/1‑150 (MQ=255) ttCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCct > 2:576350/1‑150 (MQ=255) tCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCctc < 1:929406/150‑1 (MQ=255) cGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCAGAAt > 1:1998197/1‑150 (MQ=255) atatCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCg < 1:120756/150‑1 (MQ=255) tCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGAtt > 2:503273/1‑150 (MQ=255) ccTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTa > 2:334797/1‑150 (MQ=255) cTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAGTTATCGATTac > 2:70421/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTg < 1:1821595/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGt < 2:1648811/150‑1 (MQ=255) gCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTAtt > 1:217275/1‑150 (MQ=255) cTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTc > 1:733673/1‑150 (MQ=255) ttCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTccc < 2:1138808/150‑1 (MQ=255) aCCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCgg < 1:753656/150‑1 (MQ=255) aCCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCgg < 2:1283005/150‑1 (MQ=255) ccGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGt < 1:1698902/150‑1 (MQ=255) tACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAAt < 2:1462144/150‑1 (MQ=255) aCTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATa < 2:1715184/150‑1 (MQ=255) cTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATaa > 1:1354238/1‑149 (MQ=255) cTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATAc > 2:476181/1‑150 (MQ=255) gATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACag < 1:1948972/150‑1 (MQ=255) tGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACagag > 1:422360/1‑150 (MQ=255) tGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACaga < 1:284935/149‑1 (MQ=255) tgACAACCACAAAATTGACATTGTTTAAAATTTTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTGAAGTTGTCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACagatt < 2:612723/149‑3 (MQ=255) ggACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAgg > 2:1926028/1‑150 (MQ=255) ggACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAgg < 2:1301921/150‑1 (MQ=255) aaCCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTAACCGGGGAATACAGTGTAATc < 1:1230538/150‑1 (MQ=255) aCCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCt > 1:1006942/1‑150 (MQ=255) cacaAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGc > 1:1381545/1‑150 (MQ=255) acaAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCa > 2:1165050/1‑150 (MQ=255) acaAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCa < 1:323068/150‑1 (MQ=255) acaAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCa > 2:866040/1‑150 (MQ=255) caAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAg < 1:396521/150‑1 (MQ=255) aTGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATc < 2:1539462/150‑1 (MQ=255) ggACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGa > 1:96/1‑150 (MQ=255) gACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGAt > 1:1283218/1‑150 (MQ=255) gACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCAGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGAt < 2:1998197/150‑1 (MQ=255) cATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTg > 2:643863/1‑150 (MQ=255) cATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTg < 2:733673/150‑1 (MQ=255) cATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAAGACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTg > 2:1960245/1‑150 (MQ=255) gTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAat > 1:1769559/1‑79 (MQ=255) gTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAg < 2:1849335/150‑1 (MQ=255) tttAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGt > 1:838630/1‑150 (MQ=255) tttAACATTGTCATATCTCATAATTTTTATCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGTTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCTATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGTAATCTGCAGGATCGATTGTCAGt < 1:1614515/150‑1 (MQ=255) ttAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTg < 2:1696234/150‑1 (MQ=255) tAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTgg > 1:1681730/1‑150 (MQ=255) aCATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACGCCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGtt > 1:721877/1‑113 (MQ=255) gTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCttt > 2:1490778/1‑150 (MQ=255) gTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCttt > 1:587763/1‑150 (MQ=255) cATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTc > 1:1145657/1‑150 (MQ=255) atatCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTTCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCa < 1:886035/150‑1 (MQ=255) tctcATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCGAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGATTCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATcc < 1:1517482/150‑1 (MQ=255) cATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCAtt < 1:1908305/150‑1 (MQ=255) aTAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTg > 2:120262/1‑150 (MQ=255) tAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGa < 2:422360/150‑1 (MQ=255) tttttCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATAc > 2:1798200/1‑150 (MQ=255) ttttCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACt < 1:1787851/150‑1 (MQ=255) tttCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTg < 2:627341/150‑1 (MQ=255) ctcATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCAc > 2:1750279/1‑150 (MQ=255) aTAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCt < 1:503273/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTgg > 1:1191543/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTgg < 1:1056038/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTgg > 1:493277/1‑150 (MQ=255) aaaaaTATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGa > 1:1861835/1‑150 (MQ=255) aaaaaTATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGa < 2:1820301/150‑1 (MQ=255) atatTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGAtctc < 2:1014636/150‑1 (MQ=255) atTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCaa < 1:1428600/150‑1 (MQ=255) atTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCaa > 1:1914770/1‑150 (MQ=255) tttCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAAt > 1:476504/1‑150 (MQ=255) ttCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAAtt < 2:217275/150‑1 (MQ=255) ttCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAAtt < 2:1039775/150‑1 (MQ=255) ttCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAAtt > 1:1661135/1‑150 (MQ=255) cAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGa > 2:1581662/1‑150 (MQ=255) aGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATa > 1:255388/1‑150 (MQ=255) cctGGCGGTGTAATGCACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATAc > 2:80964/3‑150 (MQ=255) cctGGCGGTGTAATGCACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATAc > 1:637072/3‑150 (MQ=255) ttGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACg < 1:456471/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGc < 1:683519/150‑1 (MQ=255) gCATTACACCGCCAGGCTGATTTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAata < 2:1367987/150‑1 (MQ=255) aTTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATAtt < 2:278058/150‑1 (MQ=255) tACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTg < 2:888265/150‑1 (MQ=255) tACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTg < 1:277861/150‑1 (MQ=255) tACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTg < 2:1570390/150‑1 (MQ=255) acacCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGa > 1:1714016/1‑150 (MQ=255) acacCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGa > 2:384667/1‑150 (MQ=255) | TTCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGA > NC_000913/1413819‑1414117 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |