| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,596,501 | T→A | 5.1% | pseudogene (1586/5422 nt) | yneO ← | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,596,501 | 0 | T | A | 5.1% | 258.2 / 2.9 | 78 | pseudogene (1586/5422 nt) | yneO | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/38); new base A (2/2); total (38/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 | |||||||||||
TATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGC > NC_000913/1596352‑1596649 | tATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCAt < 1:1667352/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcc > 2:1114307/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcc < 2:1859866/150‑1 (MQ=255) cgcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcctcc < 2:1341086/150‑1 (MQ=255) tttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTTACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGAt > 1:696011/1‑150 (MQ=255) cTATACCTCCGGTGTTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATc < 2:222150/150‑1 (MQ=255) cTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCGGTaaggg < 2:342179/150‑4 (MQ=255) aCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATa < 2:247568/150‑1 (MQ=255) ggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGa > 2:1188682/1‑131 (MQ=255) ggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGa < 1:1188682/131‑1 (MQ=255) atTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg > 2:460177/1‑150 (MQ=255) atTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg < 1:1928729/150‑1 (MQ=255) tCAGTTCACCCGTGCCTAATACAACGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAggg < 1:1508688/150‑1 (MQ=255) cAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGt < 1:1203570/150‑1 (MQ=255) aGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTg < 2:1861672/150‑1 (MQ=255) aCCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCAcc > 1:987666/1‑150 (MQ=255) cccGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCa > 2:548300/1‑150 (MQ=255) gCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACt > 1:1242675/1‑150 (MQ=255) ccTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTg < 1:140711/150‑1 (MQ=255) tAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGAc > 2:108197/1‑150 (MQ=255) ccGACCTGTAGCTATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAATTTCCAGAGACTGTCCGTTGTAATATTTACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATGCATTGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCAGCATTACTGAGATTTTCg < 2:555290/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTATATTCCAGAGACTGTCCGTTTAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTTAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACg < 1:977493/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACg < 2:1818295/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACg > 2:1137732/1‑150 (MQ=255) ccGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACg < 1:482601/150‑1 (MQ=255) tAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCt < 2:167962/150‑1 (MQ=255) gCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTAc < 1:416151/150‑1 (MQ=255) cAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTAcc < 1:396600/150‑1 (MQ=255) aTTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCaa > 1:167645/1‑150 (MQ=255) gCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTa > 1:186133/1‑150 (MQ=255) agtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGAc > 1:1234762/1‑150 (MQ=255) gtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACa > 1:279503/1‑150 (MQ=255) gatgatGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTg < 1:967414/150‑1 (MQ=255) gatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATa > 1:1202724/1‑150 (MQ=255) gatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATa > 1:609475/1‑150 (MQ=255) atgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAc < 2:175115/150‑1 (MQ=255) tgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAGATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAcc > 2:711896/1‑150 (MQ=255) tgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAcc < 1:460177/150‑1 (MQ=255) gTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAccc > 1:2784/1‑150 (MQ=255) cTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCcac < 1:426263/150‑1 (MQ=255) ttAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAg < 2:481659/150‑1 (MQ=255) tAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGTACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGCCATTGATACCCACAGt > 2:580259/1‑150 (MQ=255) aaTTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTAt > 1:927918/1‑150 (MQ=255) aaTTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTAt > 1:1870004/1‑150 (MQ=255) ttCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTAtgg < 2:1201040/150‑3 (MQ=255) ttCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCg < 2:279503/150‑1 (MQ=255) ttCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACAGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCg > 2:1990371/1‑150 (MQ=255) ccAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGaa > 1:1654667/1‑150 (MQ=255) gaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACgatg < 1:548300/150‑1 (MQ=255) gTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGt > 1:1874444/1‑150 (MQ=255) tCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTc < 2:1840380/150‑1 (MQ=255) ccGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCg > 1:294125/1‑150 (MQ=255) tGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatc < 1:353796/150‑1 (MQ=255) gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGTTACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatcc > 2:591038/1‑150 (MQ=255) gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatcc < 2:2784/150‑1 (MQ=255) aaTATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatccat > 1:1521083/1‑150 (MQ=255) tAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGt > 1:428661/1‑150 (MQ=255) cTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCa > 1:1219409/1‑150 (MQ=255) aTCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgt < 2:167645/150‑1 (MQ=255) aTCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgt < 2:1234762/150‑1 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtt < 2:767548/150‑2 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtg < 2:609475/150‑1 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtg < 2:1654667/150‑1 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtg < 2:1242675/150‑1 (MQ=255) cccTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGtgtg > 1:1580863/1‑150 (MQ=255) cccTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGtgtg > 1:1985425/1‑150 (MQ=255) cccTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGtgtg < 2:1874444/150‑1 (MQ=255) atttATCGGAGGAAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAg > 1:1808249/3‑111 (MQ=255) atttATCGGAGGAAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAg < 2:1808249/109‑1 (MQ=255) cTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc < 2:297191/150‑1 (MQ=255) cTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc < 1:108197/150‑1 (MQ=255) cTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc < 1:1753306/150‑1 (MQ=255) ttATCGGAGGAAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCg > 2:554203/1‑150 (MQ=255) ccGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATa > 2:438235/1‑150 (MQ=255) ccGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATa > 2:433923/1‑150 (MQ=255) cATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttg > 2:384431/1‑150 (MQ=255) aTTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttgc > 1:182060/1‑150 (MQ=255) aTTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttgc > 1:260645/1‑150 (MQ=255) aTTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttgc > 1:500585/1‑150 (MQ=255) | TATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGC > NC_000913/1596352‑1596649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |