Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 231,007 | C→A | 6.0% | intergenic (‑126/‑115) | yafC ← / → yafD | putative LysR family transcriptional regulator YafC/endonuclease/exonuclease/phosphatase domain‑containing protein YafD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 231,007 | 0 | C | A | 6.0% | 339.8 / 6.7 | 100 | intergenic (‑126/‑115) | yafC/yafD | putative LysR family transcriptional regulator YafC/endonuclease/exonuclease/phosphatase domain‑containing protein YafD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/50); new base A (3/3); total (47/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
GTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGT > NC_000913/230860‑231153 | gTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGGATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACtt < 2:245026/150‑1 (MQ=255) tcttcCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGc < 1:331807/150‑1 (MQ=255) tcttcCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGc < 2:688733/150‑1 (MQ=255) cttcCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCt > 2:790717/1‑150 (MQ=255) tcCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTa < 2:523294/150‑1 (MQ=255) tcCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTa < 2:481068/150‑1 (MQ=255) gACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACAt < 1:5853/150‑1 (MQ=255) aCGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCAAGTGCTTACacc < 1:1920097/150‑3 (MQ=255) gTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGATGTAAGCAAGTGCTTACaccgg < 1:408219/150‑5 (MQ=255) gCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAat < 2:1499846/150‑1 (MQ=255) gCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAat < 2:1150356/150‑1 (MQ=255) gCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCAAGTGCTTACaccggtca < 2:928568/150‑8 (MQ=255) cTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAata < 1:1496371/150‑1 (MQ=255) cTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAata < 2:752089/150‑1 (MQ=255) cTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAata < 1:1783055/150‑1 (MQ=255) tttCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAatat < 1:790717/150‑1 (MQ=255) tttCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAatat > 2:1483947/1‑150 (MQ=255) tCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATAc < 2:1549515/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATAc < 1:1992317/150‑1 (MQ=255) tttttGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAAt > 2:1649829/1‑150 (MQ=255) tttttGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAAt > 1:1074399/1‑150 (MQ=255) cTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCg > 1:488460/1‑150 (MQ=255) gCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAaga > 1:281311/1‑150 (MQ=255) cAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAagag > 2:322710/1‑150 (MQ=255) cAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAagag < 2:1625961/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGt > 1:1000165/1‑150 (MQ=255) aaaaTAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGt > 1:1161789/1‑150 (MQ=255) aaaTAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATTCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTg > 2:706067/1‑150 (MQ=255) aaaTAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTg > 2:722517/1‑150 (MQ=255) tagtagAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTTCTTACATAACAATATACAATTGCTGGTTGATAGAGTGAGc < 2:1402468/150‑1 (MQ=255) tAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGc < 1:963150/150‑1 (MQ=255) tAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGc < 2:1982596/150‑1 (MQ=255) gaagaGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTa > 1:852010/1‑150 (MQ=255) aagaGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTaa < 1:111340/150‑1 (MQ=255) agagATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTaaa > 2:1011094/1‑150 (MQ=255) agagATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTaaa > 2:1410523/1‑150 (MQ=255) agagATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTAAGCTaaa > 1:1683319/1‑150 (MQ=255) tagaTATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTaaaa > 1:396745/2‑150 (MQ=255) gagaTATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTaaaa < 2:1806489/150‑1 (MQ=255) gagaTATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTaaaa < 2:1074399/150‑1 (MQ=255) gagaTATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCAATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTaaaa > 2:1891485/1‑150 (MQ=255) agaTATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAAt < 2:1085310/150‑1 (MQ=255) gaTATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATc > 1:551026/1‑150 (MQ=255) tatTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATccc > 2:827908/1‑150 (MQ=255) atTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAag < 1:243704/133‑1 (MQ=255) atTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAag > 2:243704/1‑133 (MQ=255) ttttGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCta < 2:762228/150‑1 (MQ=255) aaTTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACa > 1:1167658/1‑150 (MQ=255) atttatttGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAg < 1:1649829/150‑1 (MQ=255) tatttGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAg > 1:738058/1‑150 (MQ=255) tatttGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAg < 2:852010/150‑1 (MQ=255) tatttGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCCGTGTAAGCACTTTCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAg < 2:1527128/150‑1 (MQ=255) tGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAAcc < 1:447965/150‑1 (MQ=255) gTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAAccc < 1:215401/150‑1 (MQ=255) cATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTc > 1:12602/1‑150 (MQ=255) cATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTc > 2:1101081/1‑150 (MQ=255) ccATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGATCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTg < 2:1288787/150‑1 (MQ=255) ccATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTg < 2:250684/150‑1 (MQ=255) aTCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCg > 1:1353079/1‑150 (MQ=255) aGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGaa > 1:1975839/1‑150 (MQ=255) ggATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAg < 2:181849/150‑1 (MQ=255) tGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGt < 1:213180/150‑1 (MQ=255) gATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACg < 2:1000165/150‑1 (MQ=255) atatGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGt < 2:488460/150‑1 (MQ=255) tatGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTa > 2:1713060/1‑150 (MQ=255) gTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATa > 2:1605856/1‑150 (MQ=255) gTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATa > 1:1538701/1‑150 (MQ=255) tGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAgg < 2:396745/150‑1 (MQ=255) aTTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTc > 1:647423/1‑150 (MQ=255) tttAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTCACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCa < 1:1410523/150‑1 (MQ=255) aTGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGt > 2:247693/1‑150 (MQ=255) aTGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGt < 2:738058/150‑1 (MQ=255) tGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACACAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAg < 1:1379959/148‑1 (MQ=255) tGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACACAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAg > 2:1379959/1‑148 (MQ=255) gTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCa < 2:1161789/150‑1 (MQ=255) tctcCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCaaa < 1:727706/150‑1 (MQ=255) ccATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGt > 2:969434/1‑150 (MQ=255) cATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTg > 2:6419/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCg > 1:1942632/1‑150 (MQ=255) aaTGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCTAAGTCAAAAGTGCGa > 1:573127/1‑150 (MQ=255) aTGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGaa < 1:593693/150‑1 (MQ=255) gAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGaaaa > 2:1763300/1‑150 (MQ=255) gAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGaaaa > 2:139298/1‑150 (MQ=255) gCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGaaaaaa > 2:1395171/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAaacaac > 2:1369608/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAAATGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAac > 1:1647008/1‑150 (MQ=255) aaaaTTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAaca < 2:551026/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAGAACAcc < 1:1823053/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACAcc < 1:457647/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACAcc < 2:869986/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACAcc < 1:1483947/150‑1 (MQ=255) ttgttatgtAAGCAAGTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGcc > 1:1400383/7‑150 (MQ=255) ccGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCAt > 1:280610/1‑150 (MQ=255) tatgtAAGCAAGTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATgc > 2:1626782/3‑150 (MQ=255) tatgtAAGCAAGTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATgc > 1:448314/3‑150 (MQ=255) tgtAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATgcgc < 1:827908/150‑1 (MQ=255) gtAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCt > 1:1123910/1‑150 (MQ=255) aGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATg < 1:1891485/150‑1 (MQ=255) gCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGt < 1:1756939/150‑1 (MQ=255) gCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGt > 1:1029298/1‑150 (MQ=255) | GTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGT > NC_000913/230860‑231153 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |