Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,266,052 | C→T | 7.4% | intergenic (+30/‑193) | yeiP → / → yeiQ | elongation factor P family protein/putative dehydrogenase, NAD‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,266,052 | 0 | C | T | 7.4% | 333.1 / 10.9 | 108 | intergenic (+30/‑193) | yeiP/yeiQ | elongation factor P family protein/putative dehydrogenase, NAD‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (49/51); new base T (5/3); total (54/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.40e-01 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CGTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTT > NC_000913/2265903‑2266201 | cGTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTc > 2:146930/1‑150 (MQ=255) gTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCa > 1:686790/1‑150 (MQ=255) aaCAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAgg < 2:1197673/150‑1 (MQ=255) aaCAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAgg > 2:332793/1‑150 (MQ=255) aCAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGc < 1:624811/150‑1 (MQ=255) aCAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGc < 2:831775/150‑1 (MQ=255) aCAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGc < 1:1882423/150‑1 (MQ=255) cAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCt > 2:1124746/1‑150 (MQ=255) 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aTTGAGCACTGGTCTTGTTATTCATGTAACAGTAAACCTAATCCAGGGCGAAAAAATTCGTATCCTAATTTAACAACGCCGTTATCTTGGGAGTTCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTa < 2:839842/150‑1 (MQ=255) ttGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTaa > 2:257618/1‑150 (MQ=255) gAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAAtt > 2:1260738/1‑150 (MQ=255) gCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATtta > 1:886520/1‑150 (MQ=255) acgggtctggtGATTCAGGGACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATttatt < 2:588612/147‑1 (MQ=255) 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CGTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTT > NC_000913/2265903‑2266201 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |