| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,267,748 | G→A | 7.2% | intergenic (+37/‑81) | yeiQ → / → yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,267,748 | 0 | G | A | 7.2% | 255.1 / 6.0 | 83 | intergenic (+37/‑81) | yeiQ/yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/42); new base A (4/2); total (39/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTA > NC_000913/2267602‑2267897 | gTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTcc > 1:805608/1‑150 (MQ=255)gTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTcc < 1:954406/150‑1 (MQ=255) gatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGc < 1:1471489/150‑1 (MQ=255) gatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGc < 2:599164/150‑1 (MQ=255) gatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGcttt < 1:1637030/150‑3 (MQ=255) tCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTcc < 2:1546546/150‑1 (MQ=255) tGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTcccc > 2:528099/1‑150 (MQ=255) tGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTcccc > 1:1450416/1‑150 (MQ=255) gCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCACCAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCt > 1:1056456/1‑150 (MQ=255) aGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTtct > 2:1047750/1‑150 (MQ=255) aGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTtct < 2:642963/150‑1 (MQ=255) aGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTtct < 1:1495044/150‑1 (MQ=255) aTAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTctct < 2:1408048/150‑1 (MQ=255) cccGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACTATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTc < 2:677463/150‑1 (MQ=255) cccGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTc > 1:1552075/1‑150 (MQ=255) cccGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTc > 1:1956313/1‑150 (MQ=255) cGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCTTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTg > 2:1275502/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCt > 2:1503103/1‑150 (MQ=255) 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aaCAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAAc < 1:697593/150‑1 (MQ=255) aCAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACg < 2:1980667/150‑1 (MQ=255) aCAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACg < 1:1047750/150‑1 (MQ=255) caacaaATCGTACAATTCGGCGGACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTGTGCGGTTAAAGCGGATGAATCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAAc < 1:1442167/150‑1 (MQ=255) caacaaATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAAc < 2:1802307/150‑1 (MQ=255) caacaaATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAAc < 2:214373/150‑1 (MQ=255) caacaaATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAAc > 2:218415/1‑150 (MQ=255) aacaaATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACt > 2:1778867/1‑150 (MQ=255) aaTCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTAcc < 2:1675275/150‑1 (MQ=255) tCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCag < 2:821128/150‑1 (MQ=255) 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ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCtcat > 2:777445/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCAcc > 2:1277689/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCAcc < 1:1713051/150‑1 (MQ=255) aaaTTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCg > 1:1194946/1‑150 (MQ=255) ttAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGttt < 2:1450416/150‑1 (MQ=255) 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ggagaGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGaaa > 2:1397107/5‑150 (MQ=255) tAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGaaaa < 2:1194946/150‑1 (MQ=255) gaGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAAcc > 2:239880/2‑150 (MQ=255) aGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCa > 1:359704/1‑150 (MQ=255) gCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCAc < 1:218415/150‑1 (MQ=255) 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NC_000913/2267602‑2267897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |