Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,850,816 | Δ1 bp | 6.2% | coding (170/351 nt) | hypA → | hydrogenase 3 nickel incorporation protein HypA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,850,816 | 0 | C | . | 6.2% | 210.7 / 7.5 | 64 | coding (170/351 nt) | hypA | hydrogenase 3 nickel incorporation protein HypA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/32); new base . (2/2); total (30/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.48e-01 |
CAACGGGCACTGGAATTGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGCAGACGACGGTTTA > NC_000913/2850668‑2850964 | cAACGGGCACTGGAATTGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCg < 2:491221/150‑1 (MQ=255) aaCGGGCACTGGAATTGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCgg < 1:507617/150‑1 (MQ=255) cACTGGAATTGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGtt > 2:542576/1‑150 (MQ=255) cTGGAATTGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGt > 1:520316/1‑150 (MQ=255) ggAATTGATCGATCAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTTGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTTTTTCGAAACCAGCTATCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGGCGAGGCAGCGTGGCGGAAGTTTGTaa < 2:674854/150‑1 (MQ=255) tGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGG‑GGAAGGTTGTAAACTGCa > 2:359440/1‑150 (MQ=255) tGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGG‑GGAAGGTTGTAAACTGCa > 2:364562/1‑150 (MQ=255) gATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCTCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCa < 2:1263148/150‑1 (MQ=255) gATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCa < 1:583864/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCga < 2:797787/150‑1 (MQ=255) cagcagGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCgaa < 1:927475/150‑1 (MQ=255) gcagGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCgaaga > 1:1063742/1‑150 (MQ=255) gcagGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCgaaga < 2:117992/150‑1 (MQ=255) gcagGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCgaaga > 2:788664/1‑150 (MQ=255) gcagGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTACCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCgaaga < 1:176636/150‑1 (MQ=255) ggCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACa > 2:1075689/1‑150 (MQ=255) ccGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAag > 2:24545/1‑150 (MQ=255) gCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAagag > 2:1204339/1‑150 (MQ=255) cAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAgg < 2:418539/150‑1 (MQ=255) aaaaCACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGc < 2:529640/150‑1 (MQ=255) cGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATg < 1:1033549/150‑1 (MQ=255) gcgcAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGAGCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCt > 2:489819/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGgtg < 1:1177671/150‑1 (MQ=255) aaaCGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGgtgt < 1:600030/150‑1 (MQ=255) aaCGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGtgtg < 1:524155/150‑1 (MQ=255) aaCGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGtgtg < 2:451361/150‑1 (MQ=255) cgTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAAc > 1:273/1‑150 (MQ=255) gggTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAAc < 2:670630/150‑1 (MQ=255) ggCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTAtg < 1:1075689/150‑1 (MQ=255) cTCAAAATTGTCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTTCAGCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTAtgtg < 2:1164220/150‑1 (MQ=255) cTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTAtgtg < 1:54894/150‑1 (MQ=255) cAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGAc > 1:940074/1‑150 (MQ=255) cAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGAc > 2:204239/1‑150 (MQ=255) aaaTTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGc > 1:87694/1‑150 (MQ=255) ggCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTg > 2:1160263/1‑150 (MQ=255) ggCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTg > 2:1289686/1‑150 (MQ=255) gcATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGAcc < 1:1403446/150‑1 (MQ=255) ttCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAgcg < 1:1135326/150‑1 (MQ=255) cTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGcgcg > 1:1247147/1‑150 (MQ=255) gtgtCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTcc > 1:525153/1‑150 (MQ=255) ctctctTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGG‑GGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAg < 1:364562/150‑1 (MQ=255) ctctctTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGG‑GGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAg < 1:359440/150‑1 (MQ=255) ctctTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAgt < 1:1204339/150‑1 (MQ=255) ctTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGcgcg > 2:990058/1‑130 (MQ=255) ctTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGcgcg < 1:990058/130‑1 (MQ=255) ctTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAgtgt > 2:865350/1‑150 (MQ=255) tttgATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACAtg < 2:180606/150‑1 (MQ=255) ttgATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACAtgc < 2:1063742/150‑1 (MQ=255) ttgATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACAtgc < 2:525153/150‑1 (MQ=255) tgATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACAtgct > 1:819872/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACAtgctgc < 2:520316/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCa > 1:575141/1‑150 (MQ=255) cTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAg > 1:505718/1‑150 (MQ=255) ggTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGAt > 1:1365464/1‑150 (MQ=255) ggTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGAt < 2:1247147/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGATACTGAACGAGCGCGTCCGACGGTGTCAAGAGTGTAATGGTGAGATGCTGAAGATtgtg < 2:940074/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTgg > 1:795240/1‑150 (MQ=255) gCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTgg > 2:1406243/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGc > 1:410414/1‑150 (MQ=255) aGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGCAgacgac > 1:857354/1‑150 (MQ=255) aGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGCAgacgac > 2:977049/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGCAGACGACgg < 1:489819/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGCAGACGACgg > 2:971463/1‑150 (MQ=255) gCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGCAGACGACGGTTTa < 1:971463/150‑1 (MQ=255) | CAACGGGCACTGGAATTGATCGAACAGCAGGCCGCAAAACACGGCGCAAAACGCGTAACTGGGGTCTGGCTCAAAATTGGCGCATTTTCTTGTGTCGAAACCAGCTCTCTTGCCTTTTGTTTTGATCTGGTTTGCCGCGGCAGCGTGGCGGAAGGTTGTAAACTGCACCTCGAAGAACAAGAGGCCGAATGCTGGTGTGAAACATGCCAACAGTATGTGACGCTACTGACCCAGCGCGTCCGCCGCTGTCCACAGTGTCATGGTGACATGCTGCAGATTGTGGCAGACGACGGTTTA > NC_000913/2850668‑2850964 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |