| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,585,156:1 | +C | 10.0% | coding (1331/2280 nt) | ydeP ← | putative oxidoreductase YdeP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,585,156 | 1 | . | C | 10.0% | 290.7 / 32.7 | 80 | coding (1331/2280 nt) | ydeP | putative oxidoreductase YdeP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (30/42); new base C (6/2); total (36/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 | |||||||||||
AAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGC > NC_000913/1585008‑1585305 | aaGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑c < 2:25899/150‑1 (MQ=255) aGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑ca < 2:213021/150‑1 (MQ=255) cTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑cagc < 2:1321816/150‑1 (MQ=255) cTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑caga < 1:1031677/150‑2 (MQ=255) ttAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑cagca < 2:952813/150‑1 (MQ=255) aGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCT‑GCAATTGCCAGCATg < 2:1318076/150‑1 (MQ=255) ggCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTcc < 2:431966/150‑1 (MQ=255) gCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCa < 1:426940/150‑1 (MQ=255) gCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCa > 2:980335/1‑150 (MQ=255) tACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAgg < 1:313096/150‑1 (MQ=255) cGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTg < 1:976734/150‑1 (MQ=255) ccccccAAATCTACATGCGTCAACGGTACAGCGCTCGCCTCCCGATCTCGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGa < 2:634695/146‑1 (MQ=255) aCCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCGTTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGa < 2:172786/150‑1 (MQ=255) ccGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAg > 1:1354586/1‑150 (MQ=255) gCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGt > 1:764766/1‑150 (MQ=255) gCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGt > 2:601647/1‑150 (MQ=255) gCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGt > 2:222000/1‑150 (MQ=255) aaaTCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTggg > 1:670738/1‑150 (MQ=255) aaTCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTgggg < 2:849655/150‑1 (MQ=255) aaTTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAg < 1:361613/150‑1 (MQ=255) ttGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGcc < 1:785778/150‑1 (MQ=255) ggTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCCTGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCa > 1:555578/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCAc < 1:293809/150‑1 (MQ=255) gTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCAc > 1:261027/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCAc < 1:401875/150‑1 (MQ=255) aCAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCAccc < 1:390460/150‑1 (MQ=255) aCAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCAccc < 1:792077/150‑1 (MQ=255) aCAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCAccc < 1:399030/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGCGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCAGGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCa > 1:601576/1‑150 (MQ=255) cgctcgctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGAc < 1:1400622/150‑1 (MQ=255) tcgctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAg > 1:678261/1‑150 (MQ=255) tCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGa < 1:254201/150‑1 (MQ=255) cccGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGaa > 2:382736/1‑150 (MQ=255) cccGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGaa > 2:430935/1‑150 (MQ=255) cccGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGaa > 2:579839/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAAct > 1:302631/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGc < 2:185621/150‑1 (MQ=255) tGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGc < 1:909874/150‑1 (MQ=255) tGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGc < 2:338264/150‑1 (MQ=255) tGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGc < 2:678261/150‑1 (MQ=255) gCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAg < 2:600775/150‑1 (MQ=255) cATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGa > 1:794286/1‑150 (MQ=255) gcgcAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTtct < 1:363163/150‑1 (MQ=255) cgcAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTtctc > 2:332129/1‑150 (MQ=255) gcAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATATCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCg > 2:604621/1‑150 (MQ=255) gcAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCg > 2:904086/1‑150 (MQ=255) cAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCgg > 1:239972/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGt > 2:1297567/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCCCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGt < 2:1303364/150‑1 (MQ=255) aaaTTGCCGCCCATGCAGATCAATGCTGGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCTATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTg < 2:209249/150‑1 (MQ=255) aaaTTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTg < 2:1291127/150‑1 (MQ=255) aTTGCCCACCATGCAGATAAATGCTCGAGCCTGACCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGAAATTG‑CAGCATGTACAGGTGCATTAGGTGGGGTTAAGCCATAGCTCTCACACAGACGAGCCAGAAACTATGCAGACGGTTTCTCGGTGAt < 2:601576/150‑1 (MQ=255) cccccATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGAc > 2:280250/1‑131 (MQ=255) cccccATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGAc < 1:280250/131‑1 (MQ=255) aTGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGtt > 1:499532/1‑150 (MQ=255) aTGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGtt < 2:261027/150‑1 (MQ=255) aGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTTGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGt > 2:1386547/1‑150 (MQ=255) aGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGt < 1:222000/150‑1 (MQ=255) gATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACAAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATGCCGACGGTTCGGTc > 1:405009/1‑150 (MQ=255) tCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGc > 2:1069908/1‑150 (MQ=255) tCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATCATGGCAATTG‑CAGCAAGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAACCCATAGCACTCACCCAGCCGCGCCAGAAACTCTGCAGACGATTTCACTGAGAAACAGACGGTTCGGTccc > 2:1320751/1‑148 (MQ=255) aaTGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGccc < 2:215230/150‑1 (MQ=255) cTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTa < 2:764766/150‑1 (MQ=255) gAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACAt < 1:601647/150‑1 (MQ=255) aGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACAtt < 1:580919/150‑1 (MQ=255) ccGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTc < 2:1354586/150‑1 (MQ=255) gTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCa < 2:1171623/150‑1 (MQ=255) aCATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACg < 2:499532/150‑1 (MQ=255) tatTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAg > 1:754220/1‑150 (MQ=255) ttgcttgcATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTg < 1:1301113/150‑1 (MQ=255) gcttgcATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTggg > 1:1237961/1‑150 (MQ=255) gcttgcATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTggg > 1:805528/1‑150 (MQ=255) ctggacATGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACCTAGTggg > 1:441324/6‑150 (MQ=255) tggacATGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGc > 1:865449/5‑150 (MQ=255) tggacATGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGc > 1:69899/5‑150 (MQ=255) tgcATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAg < 1:980335/150‑1 (MQ=255) gcATGATGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTTCATGATGTGTGGTGAAGCCATAGCGCTCACACAGAAGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTTATACCGACGGTTCGTTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGa < 2:978794/150‑1 (MQ=255) acATGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTag > 2:648744/2‑129 (MQ=255) acATGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTag < 1:648744/128‑1 (MQ=255) cATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGAt < 2:805528/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATa > 1:309183/1‑150 (MQ=255) tgctgCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATAc > 2:1293944/5‑150 (MQ=255) tgctgCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGGTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATAc > 2:1288668/5‑150 (MQ=255) gCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATAcc < 1:579839/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATAcc < 1:382736/150‑1 (MQ=255) g‑cagcaTGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGc > 2:625983/1‑150 (MQ=255) | AAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGC > NC_000913/1585008‑1585305 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |