| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3136627 | 121 (1.490) | 16 (0.220) | 11/244 | NT | 12.5% | intergenic (‑256/+36) | pitB/gss | metal phosphate:H(+) symporter PitB/fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase |
| ? | NC_000913 | = 3136632 | 117 (1.620) | intergenic (‑261/+31) | pitB/gss | metal phosphate:H(+) symporter PitB/fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase | |||||
AAAAGAGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3136464‑3136627‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccccgtactgattatGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATAC < NC_000913/3136632‑3136484 AAAAGAGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATC > 1:893011/1‑150 AAGAGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCC > 1:750687/1‑150 GAGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCG < 1:1142574/150‑1 AGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGT > 1:268819/1‑150 TGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTAC < 2:76773/150‑1 GTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACT > 1:271301/1‑150 TTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTG < 1:28139/150‑1 TATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGA > 1:838512/1‑150 TATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGA > 2:1268154/1‑150 TTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTA < 2:888606/150‑1 TCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTAT < 2:768506/150‑1 TCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTAAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTAT < 1:181532/150‑1 TCTAGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCAATGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCAAGTACTGATTAT > 2:1351290/1‑150 GTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAG > 1:173899/1‑150 AGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATC < 2:337298/150‑1 AATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTA < 2:613275/150‑1 ATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTTGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTAC < 2:656181/150‑1 ATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTAC < 2:48000/150‑1 ATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTAC < 1:893913/150‑1 AAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGG < 1:1410521/150‑1 AAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGG < 1:886201/150‑1 GCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGG < 2:455767/150‑1 GCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGG < 2:904330/150‑1 CATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGA < 2:173899/150‑1 CATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCC < 2:295339/117‑1 CATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCC > 1:295339/1‑117 CAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAA > 1:1361191/1‑150 CCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATAT < 1:313421/150‑1 ACACAGGTATTCCACTTGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCC < 2:1262714/150‑1 ACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCC < 2:359296/150‑1 TCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATT < 2:1361191/150‑1 ATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAA < 2:228418/150‑1 CCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGC > 1:789804/1‑150 CCCCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGC > 1:106509/1‑150 CCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTT > 2:1422212/1‑150 CCGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTT < 1:334133/150‑1 CGTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTA > 2:1166213/1‑150 GTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATGTTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTAT < 1:1097440/150‑1 GTACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTAT > 2:1164654/1‑150 TACTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGTAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATT > 2:421415/1‑150 CTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGT > 1:15565/1‑150 CTGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGT > 2:838512/1‑150 TGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTa > 1:1268083/1‑149 TGATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTC > 1:1005142/1‑150 GATTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCT > 1:758791/1‑150 TTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGA < 2:530577/150‑1 TTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGA < 1:939512/150‑1 TTATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTAAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGA < 1:1325298/150‑1 TATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGAT < 1:1218942/150‑1 ATGAAGAATAATCAGTACGGTGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATA < 1:450307/150‑1 ATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATA > 1:1384709/1‑150 ATGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACATGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATA > 1:1384710/1‑150 TGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTTTTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATAa > 2:1012969/1‑149 TGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATAC > 1:731060/1‑150 TGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATAC > 2:555637/1‑150 AAAAGAGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3136464‑3136627‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccccgtactgattatGAAGAATAATCAGTACGGGGATTAATCAAAATATTCAATATTTATATATTCCAATATTTATTCATTTCATATGTGAATATATTAACCAGTGGAATACCTGTGTTTTGATTATTTCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATAC < NC_000913/3136632‑3136484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |