New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 1269840 | 70 (0.910) | intergenic (‑30/‑18) | ldrB/rdlB | small toxic polypeptide LdrB/small regulatory antisense RNA RdlB |
TTGCCATCACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAAGTGTCTGGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTTTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACA > NC_000913/1269669‑1269966 | ttGCCATCACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGC < 1:1261186‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCATCACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCt > 1:113703/1‑150 (MQ=37) gCCATCACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGCCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCt < 1:128734/150‑1 (MQ=37) tCACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCttgtt > 1:943743/1‑150 (MQ=37) cACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCttgttg < 1:1064457/150‑1 (MQ=37) cACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCttgttg < 2:1290760/150‑1 (MQ=37) cACGGCAGCCTGAAGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTAAGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCttgttg > 2:1142195/1‑150 (MQ=255) gCCTGACGCCCGTTTTCACATTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATAGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCaaaatgttgtcatt > 2:1181947‑M1/1‑136 (MQ=255) ccTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGTCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGaca < 2:265776/150‑1 (MQ=37) aCGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACAt < 1:1004702/150‑1 (MQ=37) cGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACAtt > 1:1185348/1‑150 (MQ=37) cccGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACAtttt > 1:1177488/1‑150 (MQ=37) cccGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACAtttt < 2:78107/150‑1 (MQ=37) cGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTgc > 1:966927‑M2/1‑148 (MQ=255) gTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTgcg > 1:1382604‑M2/1‑147 (MQ=255) gTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTgcg > 2:797037‑M2/1‑147 (MQ=255) ttttCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTgcgg > 1:970941‑M2/1‑146 (MQ=255) tttCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTgcggc < 2:193926‑M2/150‑6 (MQ=255) 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ttACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatga < 1:1181947‑M1/150‑35 (MQ=255) ttACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCtt < 1:172862/150‑1 (MQ=37) tACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTg > 1:168870/1‑150 (MQ=37) aCTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatgacg < 1:329984‑M1/150‑37 (MQ=255) aCTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGa < 1:1224898/150‑1 (MQ=37) 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cATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAAGTGTCTGGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTTTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGcc > 1:715427/1‑150 (MQ=32) ataGCCGCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatgacgctcgcgcagtttgccatgactttctggcacgacctggcggcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcggctggtggcgtaaccggaagtaaggtg < 1:1248764‑M1/150‑143 (MQ=255) ataGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAAGTGTCTGGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTTTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGccccc < 2:1145903/150‑1 (MQ=32) taGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAAGTGTCTGGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTTTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCg > 1:557874/1‑150 (MQ=33) gccgccTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAAGTGTCTGGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTTTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCa < 1:980655/150‑1 (MQ=35) gccgccTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAAGTGTCTGGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTTTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCa < 2:96553/150‑1 (MQ=35) gCCGCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatgacgctcgcgcagtttgccatgactttctggcacgacctggcggcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcggctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaa < 2:193926‑M1/150‑146 (MQ=255) ccGCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatgacgctcgcgcagtttgccatgactttctggcacgacctggcggcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcggctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaa > 1:970941‑M1/1‑4 (MQ=255) cGCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatgacgctcgcgcagtttgccatgactttctggcacgacctggcggcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcggctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaac > 2:797037‑M1/1‑3 (MQ=255) cGCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatgacgctcgcgcagtttgccatgactttctggcacgacctggcggcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcggctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaac > 1:1382604‑M1/1‑3 (MQ=255) gCaaaatgttgtcattacaacaaggcggctatatgacgctcgcgcagtttgccatgactttctggcacgacctggcggcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcggctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacg > 1:966927‑M1/1‑2 (MQ=255) | TTGCCATCACGGCAGCCTGACGCCCGTTTTCACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCCGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCCGCCAGGTCGTGCCAGAAAGTCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAAGTGTCTGGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTTTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACA > NC_000913/1269669‑1269966 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |