New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1769673 | 34 (0.420) | 3 (0.040) | 3/262 | NT | 7.4% | coding (600/1113 nt) | ydiK | putative transporter YdiK |
? | NC_000913 | = 1769704 | 43 (0.550) | coding (631/1113 nt) | ydiK | putative transporter YdiK |
CCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCC > NC_000913/1769525‑1769821 | ccTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGgag < 2:404795/150‑1 (MQ=255) ggTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATg > 1:171632/1‑150 (MQ=255) ggTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATg > 1:195931/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTAGCGGAGATgcc > 1:610298/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGtgctgc < 2:222815/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTgctgct > 1:1314362/1‑150 (MQ=255) gcgcATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAATCCGTCTGGCTGGCGTTCGCTGAGATTCCGATGTGTTGCTggcg < 2:868083/150‑1 (MQ=255) gcATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTggcggc < 2:501438/150‑1 (MQ=255) tATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGTCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAtagcctgtgccgccagcagcacggcggcatctccgcga < 2:197010‑M1/150‑39 (MQ=255) tATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCcgcgc < 1:377185/150‑1 (MQ=255) tGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCgg > 1:952184/1‑150 (MQ=255) ggTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGt > 2:731350/1‑150 (MQ=255) gCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGgc > 2:282206/1‑150 (MQ=255) gtgCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTgg > 1:602608/1‑150 (MQ=255) cTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGtgtg > 2:488567/1‑150 (MQ=255) gATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTgtggt < 2:1285602/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGtt < 2:1353565/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAg > 1:188791/1‑150 (MQ=255) gTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAg > 1:54299/1‑150 (MQ=255) ctgctgTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAg > 1:276482/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCt < 2:365653/150‑1 (MQ=255) gAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATc > 2:867891/1‑150 (MQ=255) gAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATc > 2:1052754/1‑150 (MQ=255) gAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATc < 1:43574/150‑1 (MQ=255) ggCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGc > 1:873406/1‑150 (MQ=255) cacaAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCg < 1:282206/150‑1 (MQ=255) cacaAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGCCAGTGCTTGGCGGTATCGACCTCGCCg > 1:628691/1‑150 (MQ=255) aaGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTAt > 2:259435/1‑150 (MQ=255) aGGCATTCGTCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAtagcctgtgccgccagcagcacggcggcatctccgcgaacg < 1:705804‑M1/84‑42 (MQ=255) aGGCATTCGTCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAtagcctgtgccgccagcagcacggcggcatctccgcgaacg > 2:705804‑M1/1‑43 (MQ=255) ttCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCg < 1:428068/150‑1 (MQ=255) cGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTa > 1:829785/1‑150 (MQ=255) ttttGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTa < 2:1314362/150‑1 (MQ=255) ttGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATg > 1:1113651/1‑150 (MQ=255) gCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCa > 2:907876/1‑150 (MQ=255) cccGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACTGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGt > 1:513495/1‑150 (MQ=255) cggttttgCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGATGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGtt < 2:610298/143‑1 (MQ=255) ggCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAAc > 1:358587/1‑150 (MQ=255) cGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTAtccgcgaacgcctgccagacgggttgcaaaatgacgaatgcct > 2:705804‑M2/1‑41 (MQ=255) cGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTAtccgcgaacgcctgccagacgggttgcaaaatgacgaatgcct < 1:705804‑M2/84‑44 (MQ=255) gTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTa < 2:276482/150‑1 (MQ=255) tCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTAtccgcgaacgcctgccagacgggttgcaaaatggcgaatgccttgtgacacctgttcaccgcgccagtacagcagggcactgaagagaagcatcagcgcacaatgcaccata < 2:197010‑M2/150‑113 (MQ=255) cgcgGAGATGCCGACGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGAGTTAATg > 2:314014/1‑150 (MQ=255) cgGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTAcc > 2:556681/1‑120 (MQ=255) cgGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTAcc < 1:556681/120‑1 (MQ=255) ggAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATc > 2:478714/1‑150 (MQ=255) gagaTGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGAGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATcc < 2:513495/150‑1 (MQ=255) | CCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCC > NC_000913/1769525‑1769821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |