New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2042116 = | 84 (1.030) | 8 (0.110) | 7/254 | NT | 10.1% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome |
? | NC_000913 | 2042149 = | 65 (0.860) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGC > NC_000913/2041967‑2042264 | ttttaataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaatat < 1:694462‑M1/1‑1 (MQ=255) taataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACa < 1:211446‑M1/4‑1 (MQ=255) taataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACa < 2:440048‑M1/4‑1 (MQ=255) taataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACa < 1:926809‑M1/4‑1 (MQ=255) ttatCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAg < 1:1315067/150‑1 (MQ=255) aataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaacaagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAg < 1:858368‑M1/5‑1 (MQ=255) tatCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGa > 1:1366836/1‑150 (MQ=255) ataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGa < 1:793410‑M1/6‑1 (MQ=255) atCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGac < 1:1140064/150‑1 (MQ=255) atCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGac > 1:1094332/1‑150 (MQ=255) ccATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGacac > 2:1070108/1‑150 (MQ=255) atttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGacac < 1:41232‑M1/9‑1 (MQ=255) cATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACg < 2:224094/150‑1 (MQ=255) tatCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCt > 1:1010869/1‑150 (MQ=255) tatCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCt > 2:130015/1‑150 (MQ=255) cAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcat > 2:926809/1‑150 (MQ=255) aGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatc < 2:268666/150‑1 (MQ=255) aGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatc > 1:186345/1‑150 (MQ=255) 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cacaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCCCACGCCAtt > 1:823334/1‑150 (MQ=255) cacaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAACAAACCTGTGATCACGCAAtt > 2:65225/1‑150 (MQ=255) caAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGc < 2:855523/150‑1 (MQ=255) aCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTta > 1:1047043/1‑150 (MQ=255) cGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTtat > 1:463557/1‑150 (MQ=255) ccACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTatat > 2:117362/1‑150 (MQ=255) aCTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTACATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTg > 2:858368/1‑150 (MQ=255) cTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTgg > 1:897412/1‑150 (MQ=255) aaCGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTg > 1:1346447/1‑150 (MQ=255) aCGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTgg > 2:1223957/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAACACGGCCAACAGAGCAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGt < 1:1016907/150‑1 (MQ=255) aaGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTAc < 2:1027568/150‑1 (MQ=255) gctagctaCAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACaa < 1:1409299/150‑1 (MQ=255) ctagctaCAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAat < 2:1010869/150‑1 (MQ=255) agctaCAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAatat > 1:119424/1‑150 (MQ=255) ctaCAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGACAACAGAGAAAGATACCTGTGCCCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGc < 2:823334/150‑1 (MQ=255) | CGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGC > NC_000913/2041967‑2042264 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |