New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3960717 = | 128 (1.570) | 7 (0.090) | 5/260 | NT | 5.5% | coding (41/2022 nt) | rep | ATP‑dependent DNA helicase Rep |
? | NC_000913 | 3960760 = | 119 (1.540) | coding (84/2022 nt) | rep | ATP‑dependent DNA helicase Rep |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAAGCAGCGCGCGAGATG > NC_000913/3960570‑3960865 | cgcgcctctttgcgccccagcgtctgccctacacgctctttcatctcgcgcgctgctttattagtaaaggtcaccgccgcaatgtgccgcgcctgataaccgcaaccgcggatcagatgggcgattttattggtgataacacgagttTTa > 2:643792‑M1/148‑150 (MQ=255) cctctttgcgccccagcgtctgccctacacgctctttcatctcgcgcgctgctttattagtaaaggtcaccgccgcaatgtgccgcgcctgataaccgcaaccgcggatcagatgggcgattttattggtgataacacgagttTTACCgg > 1:682106‑M1/144‑150 (MQ=255) tttAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGATACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACATATGCGTCTACACCCAGG‑CAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGcc > 2:928498/1‑150 (MQ=255) 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ccGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCcctgcctg < 2:995209/150‑1 (MQ=255) cAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTg < 1:1095841/150‑1 (MQ=255) aGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGc < 2:1327971/150‑1 (MQ=255) gCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACCTATGCATCTAAACCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCt > 1:616898/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTggc > 2:809696/1‑150 (MQ=255) 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2:1090165/1‑149 (MQ=255) aCCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGa > 2:1095382/1‑150 (MQ=255) cccGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACAGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGAcc < 2:1386995/150‑1 (MQ=255) caacaacaaGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACt < 2:602295/150‑1 (MQ=255) aacaacaaGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACta < 1:215402/150‑1 (MQ=255) acaacaaGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACtaa > 1:829426/1‑150 (MQ=255) aacaaGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACtaata < 1:49752/150‑1 (MQ=255) aacaaGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACtaata < 1:489472/150‑1 (MQ=255) aacaaGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACtaata > 1:283145/1‑150 (MQ=255) aGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAagc > 2:305556/1‑150 (MQ=255) aGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAagc < 1:344166/150‑1 (MQ=255) cTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAagcag > 1:964289/1‑150 (MQ=255) tGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAagcagc > 1:1379042/1‑150 (MQ=255) gAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTAGTAATAAAGCAgcgcgc > 1:1194842/1‑150 (MQ=255) gAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAAGCAgcgcgc > 2:1010489/1‑150 (MQ=255) aTTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGAc > 1:634050/1‑126 (MQ=255) aTTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGAc < 2:634050/126‑1 (MQ=255) aTTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACtaataa < 1:113486/138‑1 (MQ=255) aTTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACtaataa > 2:113486/1‑138 (MQ=255) gTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAACTCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAAGCAGCGCGCGAGATg > 1:1394493/1‑150 (MQ=255) gTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAG‑‑GCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAAGCAGcgcgcg < 1:767860/143‑1 (MQ=255) gTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAG‑‑GCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAAGCAGcgcgcg > 2:767860/1‑143 (MQ=255) | TCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTACAATCCTCCCCCCGTTCGAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAACAAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGTTCCGGTAAAACTCGTGTTATCACCAATAAAATCGCCCATCTGATCCGCGGTTGCGGTTATCAGGCGCGGCACATTGCGGCGGTGACCTTTACTAATAAAGCAGCGCGCGAGATG > NC_000913/3960570‑3960865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |