| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1456149 | 109 (1.340) | 12 (0.150) | 8/262 | NT | 10.8% | coding (225/498 nt) | paaD | phenylacetate degradation protein |
| ? | NC_000913 | = 1456169 | 95 (1.220) | coding (245/498 nt) | paaD | phenylacetate degradation protein | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ACTGATTTAGGCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCCGCGCTGCGCC > NC_000913/1456021‑1456317 | cTGATTTAGGCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAgg < 2:423280‑M2/150‑3 (MQ=255) tGATTTAGGCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAggt > 1:1006976‑M2/1‑147 (MQ=255) aTTTAGGCATGGTGCGTAATGTGACAGAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAggttg > 2:212297‑M2/1‑145 (MQ=255) tttAGGCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAggttgt > 1:674190‑M2/1‑144 (MQ=255) tggcggcaaatgggcatggcaactgtgtccggcgggcgggctaatgccatactctcgcagacgctcacgggcatcgggggtcatccagtcgggggtccatgccgggtcgagttgcagcACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTtgt > 1:1063817‑M1/119‑150 (MQ=255) tAGGCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGtgc < 2:602596/150‑1 (MQ=255) gcggcaaatgggcatggcaactgtgtccggcgggcgggctaatgccatactctcgcagacgctcacgggcatcgggggtcatccagtcggtggtccatgccgggtcgagttgcagcACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGtgc > 2:448118‑M1/117‑150 (MQ=255) aGGCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACACCCGTTCAGGTTGtgct < 2:317837/150‑1 (MQ=255) ggCATGGTGCGTAATGTGACACCGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACTTTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGtgctg < 2:357665/150‑1 (MQ=255) gcaaatgggcatggcaactgtgtccggcgggcgggctaatgccatactctcgcagacgctcacgggcatcgggggtcatccagtcgggggtccatgccgggtcgagttgcagcACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGtgctgc > 2:119768‑M1/114‑150 (MQ=255) gCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGtgctgc < 1:582071/150‑1 (MQ=255) gCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGtgctgc < 1:299273/150‑1 (MQ=255) gCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGtgctgc < 1:1027941/150‑1 (MQ=255) 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cacaGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGa < 2:116577/150‑1 (MQ=255) cacaGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGa < 1:1155778/150‑1 (MQ=255) acaGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACTGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGac < 2:321787/150‑1 (MQ=255) gATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGaccac < 2:932106/150‑1 (MQ=255) aTGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGaccacc < 1:653181/150‑1 (MQ=255) gagaAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACt > 1:435709/1‑150 (MQ=255) gagaAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACt < 2:702975/150‑1 (MQ=255) agaAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTg < 1:671241/150‑1 (MQ=255) gaAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTgg < 1:810666/150‑1 (MQ=255) aGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCTGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGAt > 2:851979/1‑150 (MQ=255) 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AACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGCTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGa > 1:948629‑M1/1‑150 (MQ=255) accaacGGGTTTACCCCCGTT‑gttgtcattgcctcacgtatcgcgccaatcaaatgttccgttgccggacaaccggaatatgtcggcgtaaagccgatcacccatccttctcccatctgtgtcacatta < 2:345852‑M2/130‑109 (MQ=255) aacGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTa > 1:951356/1‑150 (MQ=255) aacGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTa < 2:633653/150‑1 (MQ=255) aacGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTa < 2:1177422/150‑1 (MQ=255) ggTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGtt > 2:487400/1‑150 (MQ=255) tttACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGc < 2:695838/150‑1 (MQ=255) aCCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCcg < 1:226002/150‑1 (MQ=255) aCCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCcg > 2:1028527/1‑150 (MQ=255) aCCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCcg > 2:1274493/1‑150 (MQ=255) cccccGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCcgc > 2:1373875/1‑150 (MQ=255) cccGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCCgcgc > 1:546397/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCCGCGCTGCGcc < 1:1313162/150‑1 (MQ=255) aGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCa > 2:648947/1‑81 (MQ=255) aGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCa < 1:648947/81‑1 (MQ=255) | ACTGATTTAGGCATGGTGCGTAATGTGACACAGATGGGAGAAGGATGGGTGATCGGCTTTACGCCGACATATTCCGGTTGTCCGGCAACGGAACATTTGATTGGCGCGATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCCGCGCTGCGCC > NC_000913/1456021‑1456317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |