New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1947994 = | 52 (0.640) | 3 (0.040) | 3/264 | NT | 6.1% | coding (158/741 nt) | yebC | putative transcriptional regulator YebC |
? | NC_000913 | 1948053 = | 43 (0.550) | coding (99/741 nt) | yebC | putative transcriptional regulator YebC |
CCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAATTACAA > NC_000913/1947905‑1948199 | ccATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTa > 2:136043/1‑150 (MQ=255) aaatgggccaacaccagacatcttaaagctgctcaggatgctaagcgcggtaaaatcttcactaaaatcattcgtgagctggtaACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGc > 2:1262845‑M1/85‑150 (MQ=255) catcatcaCCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGaa > 2:645047/1‑150 (MQ=255) tcatcaCCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATg > 2:1400114/1‑150 (MQ=255) atcaCCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGAt > 2:837390/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGAtttt > 1:566461/1‑150 (MQ=255) cGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAg < 2:762356/150‑1 (MQ=255) gCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGt > 1:198874/1‑150 (MQ=255) caccacGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCCGTTACCAGCTCACCAATCATTTTAGTGAAGa > 2:742409/1‑150 (MQ=255) cGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTa > 1:1323491/1‑150 (MQ=255) gTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTAc < 1:1149845/150‑1 (MQ=255) gcaggatgctaagcgcggtaaaatcttcactaaaatcattcgtgagctggtaACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTAcc > 2:676723‑M1/53‑115 (MQ=255) gcaggatgctaagcgcggtaaaatcttcactaaaatcattcgtgagctggtaACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTAcc < 1:676723‑M1/63‑1 (MQ=255) gcgcGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTa > 1:559880/1‑150 (MQ=255) aGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTgc > 2:960157/1‑150 (MQ=255) tgtCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAg < 2:1002470/150‑1 (MQ=255) gtCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGc < 1:136043/150‑1 (MQ=255) aCGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCttt < 2:54798/150‑1 (MQ=255) tgttgtTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTc < 1:1400114/150‑1 (MQ=255) tAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGgtgt > 1:70709/1‑150 (MQ=255) tgACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGtt < 1:742409/149‑1 (MQ=255) aCAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTgg > 2:86594/1‑150 (MQ=255) cAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGc > 1:849770/1‑150 (MQ=255) cAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGc > 1:1276538/1‑150 (MQ=255) cAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGC‑GGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGcc < 2:17608/150‑1 (MQ=255) tGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCa < 1:856303/150‑1 (MQ=255) tGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCa < 1:992789/150‑1 (MQ=255) tttATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCAttt < 2:80899/150‑1 (MQ=255) tttATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCAttt > 1:263700/1‑150 (MQ=255) gctggtaaccgcggctaagctgggcggtggcgatccggacgctaacccgcgtctgcgtgcggcggtTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGAGCAGCTTTAAGATGTCTGGTGTTGGCCCAttt > 2:1262845‑M2/67‑150 (MQ=255) ttATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGAtttt > 1:1344492/1‑98 (MQ=255) ttATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGAtttt < 2:1344492/98‑1 (MQ=255) ggtaaccgcggctaagctgggcggtggcgatccggacgctaacccgcgtctgcgtgcggcggtTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTgc > 2:676723‑M2/64‑115 (MQ=255) ggtaaccgcggctaagctgggcggtggcgatccggacgctaacccgcgtctgcgtgcggcggtTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTgc < 1:676723‑M2/52‑1 (MQ=255) cACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATg > 2:1194165/1‑150 (MQ=255) cacgcaGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCa < 2:486488/150‑1 (MQ=255) caGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATaaa > 1:648087/1‑150 (MQ=255) aGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATaaaa < 1:1010105/150‑1 (MQ=255) gACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATTCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATaaaaa < 1:1250378/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATTCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAata > 1:892827/1‑150 (MQ=255) gCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGAt > 2:670149/1‑150 (MQ=255) cGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGccc < 2:566461/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc < 1:215224/150‑1 (MQ=255) gcGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc < 2:788905/149‑1 (MQ=255) ccACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGt > 2:848695/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTc < 2:1248878/150‑1 (MQ=255) ccGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCa < 2:1323491/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAg < 1:645047/150‑1 (MQ=255) gCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACATGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCg > 2:1412388/1‑150 (MQ=255) cTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGAACAGGCAgggc < 2:263700/150‑4 (MQ=255) tAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTa > 1:99142/1‑150 (MQ=255) tAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTa < 2:849770/150‑1 (MQ=255) ggtTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGTCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAATTACaa < 1:837390‑M2/147‑1 (MQ=255) | CCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACGAATGATTTTAGTGAAGATTTTACCGCGCTTAGCATCCTGCGCAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAATTACAA > NC_000913/1947905‑1948199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |