New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2590079 = | 57 (0.700) | 5 (0.060) | 5/266 | NT | 8.6% | coding (2485/3114 nt) | acrD | multidrug efflux pump RND permease AcrD |
? | NC_000913 | 2590108 = | 51 (0.650) | coding (2514/3114 nt) | acrD | multidrug efflux pump RND permease AcrD |
GTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCTGGTGGTATTCCTGTGTCTGGCTG > NC_000913/2589959‑2590256 | gTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCg > 1:230422/1‑150 (MQ=255) tCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGa > 2:527675/1‑150 (MQ=255) ccGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGAt > 2:182996/1‑150 (MQ=255) ggcgtacagcgccggagcctgcgcgccggaaagccgctcctgatacgacatcgccgtccactccagaccaaagccgtttggcagctgcttcactaacgattccataatatccatcGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGa < 2:510929‑M1/35‑1 (MQ=255) gcgtacagcgccggagcctgcgcgccggaaagccgctcctgatacgacatcgccgtccactccagaccaaagccgtttggcagctgcttcactaacgattccataatatccatcGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGat > 1:894699‑M1/115‑150 (MQ=255) aTAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGata > 2:969487/1‑150 (MQ=255) tAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGatat < 2:1005495/150‑1 (MQ=255) aaaGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGAtatt > 1:1207868/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATgg < 2:278585/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATgg > 1:1143669/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATgg < 2:515497/150‑1 (MQ=255) gcctgcgcgccggaaagacgctcctgatacgacatcgccgtccactccagaccaaagccgtttggcagctgcttcactaacgattccataatatccatcGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTa < 1:441017‑M1/51‑1 (MQ=255) aTGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTa < 1:3828/150‑1 (MQ=255) cctgcgcgccggaaagccgctcctgatacgacatcgccgtccactccagaccaaagccgtttggcagctgcttcactaacgattccataatatccatcGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAg > 1:510929‑M1/99‑150 (MQ=255) cccTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAag > 1:1083101/1‑150 (MQ=255) gtGCGTTCGGGTCCTCACGCTGGGTATCAGGCTCGCGGCGTGTGTAACGCTATAACGGTTTTTGTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCAGCGGTGGTCAGTATAGTTACGGCGATGGATTTTATGGTATCGTTAGTGAAGCAGGTGc < 2:188829/149‑1 (MQ=255) tGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGcc < 1:858675/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCa > 1:655062/1‑150 (MQ=255) tCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCGCGCCGCGCCTGGAACGCTATAACGCTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGACGCCGCACCGGGGGGCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGGTAGTGAAGCAGCTGCCAAACg < 2:801688/150‑1 (MQ=255) cgACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCt > 2:528744/1‑150 (MQ=255) ccTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTg > 1:1134356/1‑150 (MQ=255) cTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTgg < 1:511078/150‑1 (MQ=255) cGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTg > 1:945037/1‑150 (MQ=255) gCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTgg < 1:1256220/150‑1 (MQ=255) tGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAg < 1:1186833/150‑1 (MQ=255) atcgccgtccactccagaccaaagccgtttggcagctgcttcactaacgattccataatatccatcGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAg > 2:441017‑M1/67‑150 (MQ=255) aCAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACg > 2:355990/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACgg < 1:355990/150‑1 (MQ=255) aGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGc > 1:1278528/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTgg > 2:992331/1‑139 (MQ=255) ggCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTgg < 1:992331/139‑1 (MQ=255) ctccagaccaaagccgtttggcagctgcttcactaacgattccataatatccatcgccgtaccggtactgacccccggtgcggcGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGAt > 2:441017‑M2/85‑150 (MQ=255) tCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATg < 1:52124/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTGGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATg < 1:1124305/150‑1 (MQ=255) cgccgcGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGt < 2:1083101/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGt < 2:1371972/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGt > 1:1094592/1‑150 (MQ=255) gcgTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTa < 2:1143669/150‑1 (MQ=255) gAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAg > 1:969588/1‑150 (MQ=255) gCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGc < 2:466706/150‑1 (MQ=255) gCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGc < 2:230422/150‑1 (MQ=255) tataACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCtt < 2:1186488/150‑1 (MQ=255) cGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCgg > 1:357955/1‑150 (MQ=255) ggTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGgc < 1:1306369/150‑1 (MQ=255) gTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGgcg > 1:133522/1‑150 (MQ=255) tATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGgcgcg < 1:1414765/150‑1 (MQ=255) tATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGgcgcg > 2:1083762/1‑150 (MQ=255) tATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGgcgcg < 2:23881/150‑1 (MQ=255) ctaacgattccataatatccatcgccgtaccggtactgacccccggtgcggcGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAgg > 1:510929‑M2/53‑150 (MQ=255) taacgattccataatatccatcgccgtaccggtactgacccccggtgcggcGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGTCTTTCCGGCGCGCAGGc < 1:441017‑M2/99‑1 (MQ=255) ggTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTcc > 1:559231/1‑150 (MQ=255) tgttgGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTa < 1:196368/150‑1 (MQ=255) atccatcgccgtaccggtactgacccccggtgcggcGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGc > 1:894699‑M2/37‑150 (MQ=255) tccatcgccgtaccggtactgacccccggtgcggcGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGcc < 2:510929‑M2/115‑1 (MQ=255) gggAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCa > 2:1096933/1‑150 (MQ=255) ggAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCAt < 1:182996/150‑1 (MQ=255) aCCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCt > 2:1339103/1‑150 (MQ=255) cGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCtgg < 2:1134356/150‑1 (MQ=255) cGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCtgg < 1:1096933/150‑1 (MQ=255) ggTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCTggtggt < 2:1161027/150‑1 (MQ=255) gTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGCAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCTggtggtt > 2:758290/1‑149 (MQ=255) gTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCtg < 1:987965/140‑1 (MQ=255) gTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCtg > 2:987965/1‑140 (MQ=255) aCCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCTGGTGGTATTCCtg < 1:969487/150‑1 (MQ=255) cGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCTGGTGGTATTCCTGTGTCTGGCTg < 2:1207868‑M2/149‑1 (MQ=255) | GTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCTGGTGGTATTCCTGTGTCTGGCTG > NC_000913/2589959‑2590256 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |