New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3467996 | 57 (0.700) | 4 (0.050) | 4/264 | NT | 6.4% | coding (1858/2694 nt) | chiA | endochitinase |
? | NC_000913 | = 3468011 | 63 (0.800) | coding (1843/2694 nt) | chiA | endochitinase |
GCACCACCGATAGACAGCATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTGGTTCCGGTCCAGTCAACAAAAACA > NC_000913/3467863‑3468159 | gCACCACCGATAGACAGCATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAg > 1:334079‑M2/1‑149 (MQ=255) caccacCGATAGACAGCATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAgt > 2:233795‑M2/1‑148 (MQ=255) ccaccGATAGACAGCATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAgtgg < 1:1078720‑M2/150‑5 (MQ=255) gACAGCATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGGTTTGATTTTGCTGTAGTGAGCGTATTTCTGCATACCGTAAGCGGTACGCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTa < 1:1221484/150‑1 (MQ=255) gACAGCATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTa > 2:526864/1‑150 (MQ=255) cATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGAtt > 1:1162234/1‑150 (MQ=255) aTCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTAGCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTc < 1:104077/150‑1 (MQ=255) aTCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTc > 1:1330229/1‑150 (MQ=255) aTCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTc < 1:32802/150‑1 (MQ=255) aTCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCAGCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTc < 2:375106/150‑1 (MQ=255) cacaTCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCtt < 1:997654/150‑1 (MQ=255) caTCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAg < 2:85727/150‑1 (MQ=255) caTCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAg > 1:666475/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGc > 1:256377/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGcc > 2:1020520/1‑150 (MQ=255) gCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGcc < 2:1105527/150‑1 (MQ=255) ccTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCa < 1:1386513/150‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGa < 2:666475/150‑1 (MQ=255) tCACGAAGAGATTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTCAATAACGTAAGCGGTACCAAATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGa > 2:665633/1‑150 (MQ=255) cGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATcc > 2:1236042/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCg < 2:315749/150‑1 (MQ=255) cAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGCTCCgg > 2:701814/1‑150 (MQ=255) cAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCgg < 1:526864/150‑1 (MQ=255) agCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGAt < 2:373160/150‑1 (MQ=255) cTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCg < 2:120085/150‑1 (MQ=255) ttGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTa < 2:5859/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTc < 2:615673/150‑1 (MQ=255) ttttGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCTTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCa < 2:256377/150‑1 (MQ=255) ttttGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCa < 2:1078720/150‑1 (MQ=255) tGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCg < 1:1054490/150‑1 (MQ=255) tGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCg < 2:1295845/150‑1 (MQ=255) gCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACTACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGt < 2:56277/150‑1 (MQ=255) gCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACa > 1:57620/1‑150 (MQ=255) gCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACa < 2:1330229/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACgg > 1:657657/1‑150 (MQ=255) tCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTg > 2:296695/1‑150 (MQ=255) cTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGc < 1:990600/150‑1 (MQ=255) cTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGc < 1:995538/150‑1 (MQ=255) cTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGc < 2:442087/150‑1 (MQ=255) cTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGc < 2:657657/150‑1 (MQ=255) cATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATa > 2:141424/1‑150 (MQ=255) aCCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAAc < 2:173479/150‑1 (MQ=255) gTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACgtg > 1:151685/1‑150 (MQ=255) 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tCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTTAAGTCCTTGACGTTATGATTCTTAGACAGCGCAGACAGATAAGTGATCGAATTCAGCGTAAAGTCGAAATACGTTGCATAAACGTGTTTCGTACACGCTTACTTCGGCCTACCTAagc > 2:1285111/1‑150 (MQ=255) tCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAgtggtgagtaaagatgcgaacacctgtctgccgacatggggtaccgcttacggtatgcagaattacgctcagtacagcaaaatcaaagctctgcgtgaggctggcggcgatgtgat < 1:64518‑M2/150‑117 (MQ=255) tCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGTGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTAcgc > 1:279036/1‑150 (MQ=255) cGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTAcgcg > 1:432706/1‑150 (MQ=255) cGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTAcgcg < 1:701814/150‑1 (MQ=255) 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caAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTg > 1:565074/1‑140 (MQ=255) caAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTg < 2:565074/140‑1 (MQ=255) caAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTGGTTCCGGTcc < 1:141424/150‑1 (MQ=255) caAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTGGTTCCGGTcc < 1:1148606/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTGGTTCCGGTCCAg > 1:69722/1‑150 (MQ=255) cGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTGGTTCCGGTCCAGTCAACaaa > 1:939801/1‑150 (MQ=255) aaGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTGGTTCCGGTCCAGTCAACAAAAaca < 2:28770/150‑1 (MQ=255) | GCACCACCGATAGACAGCATCACATCGCCGCCAGCCTCACGCAGAGCTTTGATTTTGCTGTACTGAGCGTAATTCTGCATACCGTAAGCGGTACCCCATGTCGGCAGACAGGTGTTCGCATCTTTACTCACCACAAACGCCAGCGTGAAGTGGTTGACGTTATGATTCTTAGCCAGCGCAGCCAGATCCGGGATCGTATTCAGCGTAAAGTCGACATACGGTGCATAAACGTGTTTCGGCCACGCTTTCTTCGGCGTACCTACGCGCTCTTTGGTTCCGGTCCAGTCAACAAAAACA > NC_000913/3467863‑3468159 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |