| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,470,058 | T→A | 5.7% | intergenic (‑205/+87) | chiA ← / ← tufA | endochitinase/translation elongation factor Tu 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,470,058 | 0 | T | A | 5.7% | 394.7 / 9.3 | 122 | intergenic (‑205/+87) | chiA/tufA | endochitinase/translation elongation factor Tu 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/62); new base A (5/2); total (58/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCG > NC_000913/3469909‑3470205 | tACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACCGCACTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAAAATGAATAATTTATTCGtt < 1:1234659/150‑1 (MQ=255) cGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCt < 2:816398/150‑1 (MQ=255) gTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTg < 2:271488/150‑1 (MQ=255) ttttACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGa < 1:491323/150‑1 (MQ=255) tttACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGAc < 2:513417/150‑1 (MQ=255) tttACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGAc < 1:1274617/150‑1 (MQ=255) tACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAg > 1:591703/1‑150 (MQ=255) aagataaCCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATTAATCATTTTAAAAACAGAAACATTAATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGt < 1:125055/145‑1 (MQ=255) gagaACCCTTCAATATGAATTAAATTACTTCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTAc < 2:669023/150‑1 (MQ=255) gagaACCATTCAATATGAATTAAATTAAGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGACTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTAc > 2:1311461/1‑150 (MQ=255) aaCCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGaa < 2:788835/150‑1 (MQ=255) aCCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAAt > 1:1418649/1‑150 (MQ=255) cccTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATa > 2:871200/1‑150 (MQ=255) cccTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAACAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGaaaa > 2:1104241/1‑148 (MQ=255) ttCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTACTGTCAGAACGAATaaat < 2:1140559/150‑3 (MQ=255) tCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGat < 1:601722/150‑1 (MQ=255) cAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAATCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGata < 2:498705/150‑1 (MQ=255) atatGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATg > 1:1200133/1‑150 (MQ=255) atatGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTACTgtc > 2:493481/1‑131 (MQ=255) atatGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTACTgtc < 1:493481/133‑3 (MQ=255) attaaattaCGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTca > 2:327970/1‑150 (MQ=255) taaattaCGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTcaac > 1:1176426/1‑150 (MQ=255) taaattaCGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTcaac > 1:1181373/1‑150 (MQ=255) aaattaCGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTcaaca > 1:202968/1‑150 (MQ=255) aaattaCGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTcaaca < 1:225804/150‑1 (MQ=255) cGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCa > 2:1275398/1‑150 (MQ=255) gCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCaaa > 2:638786/1‑150 (MQ=255) cATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCaaaa > 1:360618/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAggg > 1:1246119/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAggg > 2:268233/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAAGAAAAAAGACTCACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTCATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGAAGTCAAAAAATGCAAAAAggg > 2:1048987/1‑150 (MQ=255) aaaTAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGgcg > 1:721662/1‑150 (MQ=255) aaaTAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGgcg > 2:788151/1‑150 (MQ=255) aGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGaa > 2:872058/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAgcgc < 2:226449/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGcc < 2:580031/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGcc < 2:982223/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGccc < 2:469572/150‑1 (MQ=255) gCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCtt > 1:498056/1‑150 (MQ=255) gCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCtt < 1:423018/150‑1 (MQ=255) tGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttc < 1:583222/150‑1 (MQ=255) tGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttc < 2:1235613/150‑1 (MQ=255) gACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCTTCGGCGCCCtttttg < 1:1334928/150‑3 (MQ=255) gACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttca < 1:237532/150‑1 (MQ=255) gACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttc < 1:951044/149‑1 (MQ=255) gACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttc > 2:951044/1‑149 (MQ=255) cAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttcaat > 2:546039/1‑150 (MQ=255) cAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttcaat < 1:829826/150‑1 (MQ=255) aGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAAc < 2:202968/150‑1 (MQ=255) aTTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTaa > 1:304345/1‑150 (MQ=255) aTTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTaa > 2:45034/1‑150 (MQ=255) tAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTaa > 2:975204/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACAAATTAAc < 1:1021939/150‑1 (MQ=255) aaaaCAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCt < 2:1080189/71‑1 (MQ=255) aaaaCAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCt > 1:1080189/1‑71 (MQ=255) aaaaCAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACg < 2:561429/150‑1 (MQ=255) aaaaCAGAAACATTCATATTAAAAATGTTAAATTGAATTGATATATTAAATATGAATAATAAATTCGTTCTTACAGTACGAATAAGATATGACGTCAACAAAAGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTAATAAAATCAAAACTAATAAACg > 1:870377/1‑150 (MQ=255) aCAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACgtgt < 2:1200133/150‑1 (MQ=255) aCAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACgtgt < 1:402330/150‑1 (MQ=255) cAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttcaa < 2:1138794/129‑1 (MQ=255) cAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTttcaa > 1:1138794/1‑129 (MQ=255) cAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGAGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTa > 1:31586/1‑150 (MQ=255) aGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTaa < 2:1176426/150‑1 (MQ=255) aGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTaa < 2:1181373/150‑1 (MQ=255) aaCATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTa < 2:1259266/150‑1 (MQ=255) cATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGc < 2:1418649/150‑1 (MQ=255) aaTTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGc < 1:361738/149‑1 (MQ=255) aTTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGcc > 1:778856/1‑150 (MQ=255) ttCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGccc < 1:1323439/150‑1 (MQ=255) cATATTTAAAATTTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAg < 1:822953/150‑1 (MQ=255) tatTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGaa > 2:381147/1‑150 (MQ=255) tatTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGaa < 1:986507/150‑1 (MQ=255) atTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAAc < 1:611857/150‑1 (MQ=255) tAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACttt < 2:621091/150‑1 (MQ=255) aaaaTGTTAAATTTAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTa < 1:1048987/150‑1 (MQ=255) aTGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGca < 2:1224364/150‑1 (MQ=255) aTGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGca > 2:362413/1‑150 (MQ=255) tttAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAggg > 1:1419451/2‑87 (MQ=255) gTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAggg < 2:1419451/87‑1 (MQ=255) gTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGcaac > 1:582846/1‑150 (MQ=255) aaaTTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCaacaac > 2:848393/1‑150 (MQ=255) aattgaTATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCcgc < 1:268233/150‑1 (MQ=255) attgaTATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCcgcg < 1:1161691/150‑1 (MQ=255) ttgaTATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCgcgc > 1:376749/1‑150 (MQ=255) tgaTATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTaa < 1:1272678/117‑1 (MQ=255) tgaTATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTaa > 2:1272678/1‑117 (MQ=255) gaTATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCa > 2:975915/1‑150 (MQ=255) atTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACg > 2:914890/1‑150 (MQ=255) atTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACg > 2:826196/1‑150 (MQ=255) atttAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACgg < 2:22016/149‑1 (MQ=255) tAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTAc < 1:1311461/150‑1 (MQ=255) tatGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgcc > 1:1081600/1‑150 (MQ=255) tGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgc > 1:1409933/1‑150 (MQ=255) gcatatcttATTCGTACTGTCAGAACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc > 2:187109/8‑150 (MQ=39) gcatatcttATTCGTACTGTCAGAACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc > 1:388253/8‑150 (MQ=39) aataatTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCt > 1:1313037/1‑150 (MQ=255) ttATTCGTACTGTCAGAACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACgg > 2:627646/1‑150 (MQ=255) tATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAAc < 1:36520/130‑1 (MQ=255) tATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGa < 1:381147/150‑1 (MQ=255) gTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCg > 2:787199/1‑150 (MQ=255) | TACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCG > NC_000913/3469909‑3470205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |