Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,612,525 | C→T | 5.4% | Q221* (CAG→TAG) | yhhT → | putative transporter YhhT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,612,525 | 0 | C | T | 5.4% | 232.1 / 2.1 | 74 | Q221* (CAG→TAG) | yhhT | putative transporter YhhT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/33); new base T (2/2); total (39/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.73e-01 |
TTTTGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCATTGTTTTTAGTG > NC_000913/3612383‑3612674 | ttttGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTgc > 2:541177/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGCGGGTGCAGTTTgcgc > 2:1169010/1‑150 (MQ=255) gcgcTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATTGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTg > 1:26908/1‑150 (MQ=255) cgcTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGa > 1:1299918/1‑150 (MQ=255) cTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGAtg < 1:335559/150‑1 (MQ=255) taatCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGc < 2:840198/150‑1 (MQ=255) aatCGACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCa > 1:418136/1‑150 (MQ=255) tCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGt < 2:198315/150‑1 (MQ=255) cacaGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTGTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTAc < 2:4331/150‑1 (MQ=255) cacaGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATAGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTAc > 2:440141/1‑150 (MQ=255) cacaGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATCGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTAc > 1:515661/1‑150 (MQ=255) caGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGACAGTACTg > 1:523707/1‑150 (MQ=255) gATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGc > 1:219384/1‑150 (MQ=255) aTTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCg < 2:700528/150‑1 (MQ=255) aTCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTTTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTg > 1:1141145/1‑150 (MQ=255) aTCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTg < 1:800842/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGc < 1:1171002/150‑1 (MQ=255) gcgGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTc > 1:105334/1‑150 (MQ=255) gcgGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTc > 1:1132420/1‑150 (MQ=255) cgGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCa < 1:1336112/150‑1 (MQ=255) ggATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTgg < 1:818541/136‑1 (MQ=255) ggATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTgg > 2:818541/1‑136 (MQ=255) ttACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTAc > 1:1279775/1‑150 (MQ=255) cACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAata > 1:165636/1‑150 (MQ=255) tAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCgg > 2:396900/1‑150 (MQ=255) aaaGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGgc > 2:468126/1‑150 (MQ=255) aaaGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAATACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGgc > 2:1296743/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGgcg < 1:893409/150‑1 (MQ=255) gCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGGCATCGTCTGTCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCgg < 2:300048/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTa > 2:567184/1‑150 (MQ=255) tttCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGTAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTaa > 2:1388253/1‑150 (MQ=255) tttCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGTAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTAAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTaa > 2:412908/1‑150 (MQ=255) ttCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCGGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAAt < 1:691594/150‑1 (MQ=255) aCTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccg < 2:219384/150‑1 (MQ=255) aCTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGGCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccg < 1:284652/150‑1 (MQ=255) tCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGt < 1:7552/150‑1 (MQ=255) gaaTTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTCCGCAGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTAAGTGCCCAAAATCGTCGCGGTAATTTCCGCCGTAACg > 2:41812/3‑150 (MQ=255) aaGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATg > 1:1056956/1‑150 (MQ=255) cTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAg < 1:718555/150‑1 (MQ=255) tACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAgg > 2:1100629/1‑150 (MQ=255) tACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAgg < 2:1132420/150‑1 (MQ=255) aGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtgctg > 2:468120/1‑150 (MQ=255) gTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGTTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtgctgc < 1:687848/150‑1 (MQ=255) tATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGc > 1:1363081/1‑96 (MQ=255) tATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGc < 2:1363081/96‑1 (MQ=255) aTGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGtt < 1:440141/150‑1 (MQ=255) ggACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTa < 2:418136/150‑1 (MQ=255) ggACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTa > 2:237058/1‑150 (MQ=255) gACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTaa > 1:1076705/1‑150 (MQ=255) gtgtCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAATACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGgtg < 1:1296743/150‑1 (MQ=255) tgtCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGgtgt < 2:515661/150‑1 (MQ=255) aTCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTAc > 2:209462/1‑150 (MQ=255) aTCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTAc > 1:755710/1‑150 (MQ=255) tCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCgg > 2:573257/1‑91 (MQ=255) tCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCgg < 1:573257/91‑1 (MQ=255) tCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGACAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACg < 2:523707/150‑1 (MQ=255) cGTCTGTCTGGGGCTGGAGCTTATGGGTGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCTGCGCTGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGa < 1:41812/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGaa > 1:754336/1‑150 (MQ=255) tggctggGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGt < 1:889222/150‑1 (MQ=255) ggctggggcgggAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCGGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTa < 2:921641/150‑1 (MQ=255) gctggggctggAGCTGATGGGGGTGTAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTAt < 1:412908/150‑1 (MQ=255) gctggggctggAGCTGATGGGGGTGTAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTAt < 1:1388253/150‑1 (MQ=255) tggggctggAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTc > 1:779543/1‑150 (MQ=255) tggggctggAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTc > 1:17396/1‑150 (MQ=255) ggctggAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTgg > 1:638359/1‑150 (MQ=255) ggctggAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTgg < 2:1279775/150‑1 (MQ=255) ggAGCTTATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCgg < 1:216949/150‑1 (MQ=255) cTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCa < 1:1100629/150‑1 (MQ=255) gATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCAtt > 1:382629/1‑150 (MQ=255) gATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCAtt > 2:102516/1‑150 (MQ=255) gggTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCATTGtttt > 2:1099170/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCATCTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCATTGttttt < 1:142616/150‑1 (MQ=255) tGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCATTGTTTTTAg > 1:595179/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCATTGTTTTTAGt < 1:396900/150‑1 (MQ=255) cAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCATTGTTTTTAGTg > 2:152665/1‑150 (MQ=255) | TTTTGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGATGGGGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATTCTGGTCGGCGCATTGTTTTTAGTG > NC_000913/3612383‑3612674 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |