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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,790,300 | 0 | A | T | 11.6% | 859.2 / 77.5 | 302 | intergenic (‑219/+20) | waaH/tdh | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase/threonine dehydrogenase |
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Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
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aaaGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAAAGCCCTTCTGGAAATCATCGATAGAGAAACGATGGGTAATGATCGGCGAAAGATCGAGGCCAGACTg < 1:1298606/150‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGTATTCCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAAAGACCTTCTGGAAATCATCGATAGAGAAACGATGGGTAATGATCGGAGAAAGATCGAGGCCAGACTGa > 1:1086823/1‑150 (MQ=255) ggCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAAAGCCCTTCTGGAAATCATCGATAGAGAAACGATGGGTAATGATCGGCGAAAGATCGAGGCCAGACTGAATc > 1:1121293/1‑150 (MQ=255) cTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAAAGCCCTTCTGGAAATCATCGATAGAGAAACGATGGGTAATGATCGGCGAAAGATCGAGGCCAGACTGAATCAg < 1:367805/150‑1 (MQ=255) cTGGAATACCAGCCATTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAAAGACCTTCTGGAAATCATCGATAGAGAAACGATGCGTAATGATCGGCGAAAGATCGAGGCCAGACTGAATCac > 2:618126/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |