Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,895,234 | G→T | 5.2% | intergenic (+16/+38) | yieF → / ← adeP | chromate reductase/adenine:H(+) symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,895,234 | 0 | G | T | 5.2% | 625.9 / 12.7 | 182 | intergenic (+16/+38) | yieF/adeP | chromate reductase/adenine:H(+) symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (95/77); new base T (5/5); total (100/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
CGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAGCGCAACGATGATTACGCACGGGCTTAGATCACGCAGACGTCCGGTACCGATTTTCATCACGCAGTAGGAG > NC_000913/3895085‑3895383 | cGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAATCCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACAGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAg > 1:563087/1‑150 (MQ=255) cGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAg < 2:955125/150‑1 (MQ=255) ggAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGc < 2:227624/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |