Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,002,259 | 0 | G | A | 8.0% | 528.7 / 21.6 | 173 | M278I (ATG→ATA) | corA | Ni(2(+))/Co(2(+))/Mg(2(+)) transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (91/68); new base A (6/8); total (97/76) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TAACGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGC > NC_000913/4002112‑4002408 | aaCGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAAc > 2:1186257/1‑150 (MQ=255) aaCGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAAACGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAAc < 1:1176993/150‑1 (MQ=255) aCGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCAGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACt > 2:1429275/1‑150 (MQ=255) 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cTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACgaga > 1:1336978/1‑150 (MQ=255) tGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGgaag < 2:240897/124‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTg < 1:133040/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTgg > 2:319857/1‑150 (MQ=255) ccAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCtt > 2:691695/1‑150 (MQ=255) ccAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCtt < 1:665249/150‑1 (MQ=255) gttctGGCATAAACTCAAAGTTCATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGt > 1:1365431/5‑150 (MQ=255) ttctGGCATAAACTCAAAGTTCATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTc > 1:20315/4‑150 (MQ=255) tctGGCATAAACTCAAAGTTCATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCt > 1:502383/3‑150 (MQ=255) cATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTa < 2:1359002/150‑1 (MQ=255) aTGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTaa > 1:185689/1‑150 (MQ=255) gAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGc < 2:1038813/150‑1 (MQ=255) | TAACGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGC > NC_000913/4002112‑4002408 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |