| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,029,932 | T→A | 6.9% | K347M (AAG→ATG) ‡ | fadB ← | dodecenoyl‑CoA delta‑isomerase, enoyl‑CoA hydratase, 3‑hydroxybutyryl‑CoA epimerase, 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,029,932 | 0 | T | A | 6.9% | 393.6 / 12.1 | 124 | K347M (AAG→ATG) ‡ | fadB | dodecenoyl‑CoA delta‑isomerase, enoyl‑CoA hydratase, 3‑hydroxybutyryl‑CoA epimerase, 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/65); new base A (4/5); total (54/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CCACAATATCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACA > NC_000913/4029783‑4030078 | ccACAATATCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACt < 1:494064/150‑1 (MQ=255) cacaATATCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACtt > 1:691052/1‑150 (MQ=255) acaATATCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTg > 2:1169763/1‑150 (MQ=255) acaATATCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTg < 2:870788/150‑1 (MQ=255) aaTATCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTc < 1:443428/150‑1 (MQ=255) tCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTg > 1:960855/1‑150 (MQ=255) tCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTg < 2:691052/150‑1 (MQ=255) ccACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACAAGTCGttaa > 1:894724/1‑148 (MQ=255) cACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTTGGTTGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGAGCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGat < 1:737503/150‑1 (MQ=255) cACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACAAGTCGttaac < 2:442787/150‑4 (MQ=255) cACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACAAGTCGttaac < 2:894724/150‑4 (MQ=255) cACGCGGTCAAATCCGGCATAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACAAGTCGttaac < 2:1189518/150‑4 (MQ=255) aCGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACAAGTCGttaacc < 2:887813/150‑5 (MQ=255) aaTCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATg < 1:863157/150‑1 (MQ=255) tCCTGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGAc < 2:1166279/150‑1 (MQ=255) tCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGAc < 2:933168/150‑1 (MQ=255) tCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGAc < 2:265493/150‑1 (MQ=255) ccGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATg > 2:920310/1‑147 (MQ=255) ccGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATg < 1:920310/147‑1 (MQ=255) gCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAAcc > 2:1269904/1‑150 (MQ=255) gCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAAcc > 1:761447/1‑150 (MQ=255) gCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAAcc > 2:739320/1‑150 (MQ=255) cGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCg < 1:691637/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGAACATCACGCAAGACAGATAAAGACAAAATAAATAGCCGAGCACAACCTTCTTGTAAAGAAGTTTAGCGGCTTCGGTCATGACGAGCTTTAACCAGATGACCTTGAAATCTTTCATGACAACCCGCAc > 2:789668/1‑150 (MQ=255) cGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGc < 1:1169763/150‑1 (MQ=255) gAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGcc < 1:990123/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTcc > 1:500875/1‑150 (MQ=255) tGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCa < 2:320893/150‑1 (MQ=255) ggTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACg < 1:788423/150‑1 (MQ=255) ggTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACg > 2:877032/1‑150 (MQ=255) ggTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACg < 1:545839/150‑1 (MQ=255) gTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGc < 1:540680/150‑1 (MQ=255) tGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCa < 1:1348040/150‑1 (MQ=255) ggATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACg > 2:223588/1‑147 (MQ=255) ggATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACg < 1:223588/147‑1 (MQ=255) aTTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCCTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGAc < 1:1012486/150‑1 (MQ=255) gtgGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTgg > 1:614493/1‑150 (MQ=255) gtgGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTgg > 1:932222/1‑150 (MQ=255) ggAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTa < 1:877032/150‑1 (MQ=255) gagaTCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTaa > 2:714287/1‑150 (MQ=255) agaTCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCCTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAg < 2:358511/150‑1 (MQ=255) gaTCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGc > 2:501430/1‑150 (MQ=255) gaTCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGGTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGc < 2:116354/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATgc < 1:225534/150‑1 (MQ=255) ccagccagTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATgccg < 1:834129/150‑1 (MQ=255) cagccagTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAAcc > 2:960739/1‑113 (MQ=255) agccagTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATgccgcc > 1:1372831/1‑150 (MQ=255) gccagTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATgccgccg > 2:240982/1‑150 (MQ=255) cagTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATgccgccgcc < 1:354014/150‑1 (MQ=255) agTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGccc < 2:1296792/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCa < 1:980016/150‑1 (MQ=255) aGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATg > 1:337480/1‑150 (MQ=255) ccATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCt > 1:676080/1‑150 (MQ=255) ccATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCt < 2:741496/150‑1 (MQ=255) ccATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCt > 2:427369/1‑150 (MQ=255) cATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTg < 2:113284/150‑1 (MQ=255) cATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTg < 1:1066354/150‑1 (MQ=255) cATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTg > 2:431272/1‑150 (MQ=255) aTCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGc > 2:1297045/1‑150 (MQ=255) tCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCa < 1:1048463/150‑1 (MQ=255) tCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCa > 1:786876/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCAc > 2:459986/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCAcc > 1:629215/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACcg < 1:605925/150‑1 (MQ=255) cgcgCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACcg > 2:69881/1‑150 (MQ=255) gcTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCgg < 2:75226/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGc > 2:105811/1‑150 (MQ=255) cTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGc > 1:893678/1‑150 (MQ=255) tCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGcc < 1:711547/150‑1 (MQ=255) tgctTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTc > 1:729282/1‑150 (MQ=255) gctTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCg > 1:884317/1‑150 (MQ=255) gctTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCg > 2:634140/1‑150 (MQ=255) ctTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCgg < 1:1269904/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGt > 2:1183870/1‑150 (MQ=255) cagcagTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTc > 2:1051223/1‑150 (MQ=255) cagcagTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTc > 2:1415701/1‑150 (MQ=255) agcagTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCa < 1:1417612/150‑1 (MQ=255) agcagTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCa < 2:337480/150‑1 (MQ=255) agTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACg < 2:786876/150‑1 (MQ=255) cgGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTgg < 2:1046837/150‑1 (MQ=255) cgGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTgg < 1:229437/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTg < 2:832654/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTg < 1:105811/150‑1 (MQ=255) tCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGt > 2:295864/1‑150 (MQ=255) tCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttct > 1:26228/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCg < 1:1272833/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCg > 2:648379/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGcc > 2:550297/1‑93 (MQ=255) gCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGcc < 1:550297/93‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACACAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGc > 1:372646/1‑150 (MQ=255) ccGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCt > 2:514902/1‑150 (MQ=255) gAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt < 2:1057876/150‑1 (MQ=255) aGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTg < 2:426531/150‑1 (MQ=255) gTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCt > 1:58012/1‑150 (MQ=255) atcaaCGACAAGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCt > 1:437750/4‑150 (MQ=255) caaCGACAAGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCttt < 2:437750/149‑1 (MQ=255) aaCGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCtttt < 2:394730/150‑1 (MQ=255) aCGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTa < 2:1372831/150‑1 (MQ=255) cGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTAc < 1:69881/150‑1 (MQ=255) gACTTGGCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTCTCTTCGCTTTGCCTTTTACa < 1:1112943/150‑1 (MQ=255) | CCACAATATCCACGCGGTCAAATCCGGCGTAGTCGAGCGTTGGGTGGATTGTGGAGATCACGCCAGCCAGTTTCAGACCATCGATCTTGCCGCGCTCAAGCTGCTTGTTCAGCAGTTTCGCGGCTTCGGTCATGCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACA > NC_000913/4029783‑4030078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |