| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,162,151 | 0 | G | C | 12.0% | 519.8 / 51.9 | 174 | intergenic (+21/+19) | yijD/trmA | conserved inner membrane protein YijD/tRNA m(5)U54 methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (74/79); new base C (12/9); total (86/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
ACAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTA > NC_000913/4162003‑4162299 | aCAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTgg < 1:1223630/150‑1 (MQ=255) cAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGgc > 2:1396816/1‑150 (MQ=255) aGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGTTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGgcg < 2:550491/150‑1 (MQ=255) 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ACAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTA > NC_000913/4162003‑4162299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |