Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,185,306 | 0 | A | T | 5.6% | 561.8 / 16.4 | 178 | intergenic (+33/‑44) | rpoB/rpoC | RNA polymerase subunit beta/RNA polymerase subunit beta' |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (83/85); new base T (2/8); total (85/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TATAAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTAAAACCCGGCAGCGGATTGTGCTAACTCCGACGGGAGCAAATCCGTGAAAGATTTATTAAAGTTTCTGAAAGCGCAGACTAAAACCGAAGAGTTTGATGCGATCAAAATTGCTCTGGCTTCGCCAGACATGATCCGTTCATGGTCTTTC > NC_000913/4185157‑4185454 | tataAAAACATCGTGGACGTCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTa < 1:665520/150‑1 (MQ=255) tataAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTa > 1:604309/1‑150 (MQ=255) taAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTaaa > 1:345628/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |