Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,261,358 | T→A | 5.2% | intergenic (+52/‑311) | yjbM → / → dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,261,358 | 0 | T | A | 5.2% | 1520.7 / 42.7 | 457 | intergenic (+52/‑311) | yjbM/dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (229/204); new base A (12/12); total (241/216) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
CGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACT > NC_000913/4261209‑4261506 | cgAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAatat < 2:455926/150‑1 (MQ=255) tCGTTTGACCCATCCTCAAAGGAAGAGATTAAAATAGTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCTGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTTAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAAtatttttt < 1:603080/150‑1 (MQ=255) cGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGAACCCAATAAATATTg > 1:1383635/1‑150 (MQ=255) 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2:377747/1‑150 (MQ=255) cAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCAt < 2:1017104/150‑1 (MQ=255) | CGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACT > NC_000913/4261209‑4261506 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |