Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,515,968 | C→G | 9.5% | G237A (GGA→GCA) | fecA ← | ferric citrate outer membrane transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,515,968 | 0 | C | G | 9.5% | 237.4 / 13.7 | 74 | G237A (GGA→GCA) | fecA | ferric citrate outer membrane transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/31); new base G (4/3); total (40/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.42e-01 |
CCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGCGAGGC > NC_000913/4515824‑4516115 | ccgccCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTaa > 2:906565/1‑150 (MQ=255) ccgccCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTaa > 2:901702/1‑150 (MQ=255) caTCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAAcgcaccgc > 1:1141354/1‑150 (MQ=255) tCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAAcgcaccgcac > 1:160904/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTGCGTTAcggaccgcaga < 1:1259349/150‑3 (MQ=255) aGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTGCGTTAcggaccgcagag < 1:1414432/150‑4 (MQ=255) ggTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTGCGTTAcggaccgcagagc < 1:385678/150‑5 (MQ=255) ggTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGcaccac > 1:32626/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGcaccac < 2:1346370/150‑1 (MQ=255) gTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGcaccacc < 2:693101/150‑1 (MQ=255) gTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGcaccacc < 1:376451/150‑1 (MQ=255) gtgCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACATTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCaccaccacc > 2:1115008/1‑150 (MQ=255) gCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACcgc > 2:320682/1‑150 (MQ=255) cGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAAc > 1:564915/1‑131 (MQ=255) cGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAAc < 2:564915/131‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACcgcg < 2:198710/150‑1 (MQ=255) tctcTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTa < 1:27260/150‑1 (MQ=255) ctctTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTAc > 2:1372242/1‑150 (MQ=255) tctTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTAcc < 1:1372242/150‑1 (MQ=255) tctTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGACACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTAcc > 1:632886/1‑150 (MQ=255) gggTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCa > 2:709986/1‑150 (MQ=255) gttgttTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAAt > 1:794760/1‑150 (MQ=255) ttgttttgttAAGAGGTTGGGCTGAGCTGAGCTTCCACGCCCGGCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGTGTAACAAAGTTCACCACGTCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCAACACCGCGTACCACGTCAATg < 2:538291/150‑1 (MQ=255) ttgttTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATg < 2:1210038/150‑1 (MQ=255) gttTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGc > 1:961504/1‑150 (MQ=255) gttTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGc > 1:506133/1‑150 (MQ=255) tttGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCAt > 2:209690/1‑150 (MQ=255) gtgAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCa > 1:1319923/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCg < 1:901702/150‑1 (MQ=255) gTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCg < 1:906565/150‑1 (MQ=255) gggCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTACTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGc < 2:814795/150‑1 (MQ=255) tgagctgaCCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGaaa > 2:1266312/1‑150 (MQ=255) gctgaCCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACgg > 1:79089/1‑150 (MQ=255) tgaCCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGa < 2:1370420/150‑1 (MQ=255) tgaCCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGa < 1:971786/150‑1 (MQ=255) gaCCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAg > 2:132074/1‑150 (MQ=255) ccTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGcc > 1:666917/1‑150 (MQ=255) ccTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGcc > 1:1191327/1‑150 (MQ=255) tCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGt > 2:880968/1‑150 (MQ=255) cACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGa > 2:1164311/1‑150 (MQ=255) cccgccTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAAcgcaccgca < 2:797642/87‑1 (MQ=255) cccgccTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAAcgcaccgca > 1:797642/1‑87 (MQ=255) gccTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGc < 1:1248388/150‑1 (MQ=255) ccTCGATACCAAAGTCCAGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCAAAACGCCGCCCACGCTCTGCGGGCCGTAACGCCCAGCACCACCACCGACTACCACGTCAATGGCATCCATGATGCCCAGCGAAACGGCTGCCAGTGAAAGCTGCg > 2:1335855/1‑150 (MQ=255) tCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGGCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGc < 1:803803/150‑1 (MQ=255) aaGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACATCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTaa < 2:32626/150‑1 (MQ=255) tCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAggg < 1:709986/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATGAATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCGAGTGATAGCTGCTGCTGACCGTAAgggg < 2:632886/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAgggg < 2:160904/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAgggg > 2:789474/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAgggg > 2:1080416/1‑150 (MQ=255) cGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACgggg < 2:394301/150‑1 (MQ=255) gTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATg > 1:998964/1‑150 (MQ=255) gTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATg < 1:895052/150‑1 (MQ=255) tAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGTTGc < 2:1319923/150‑1 (MQ=255) tAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGc > 2:1133798/1‑150 (MQ=255) cAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGt > 2:137395/1‑150 (MQ=255) cAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGt < 2:794760/150‑1 (MQ=255) gTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCCCCACCGCGTACCACGTCAAGGGCATCCATGTTGCCGAGCGAACCGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGCCGGGGATGCCGTccgt > 1:565743/1‑148 (MQ=255) caccacGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAg < 1:1164311/150‑1 (MQ=255) ccacGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGa < 1:209690/150‑1 (MQ=255) cacGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGAc > 1:1167387/1‑150 (MQ=255) cacGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGAc < 2:506133/150‑1 (MQ=255) aCGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCgg < 1:789474/150‑1 (MQ=255) gtggtGCGGTGCGTTACGGACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCt > 1:503225/5‑150 (MQ=255) tctGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAg > 2:451880/1‑110 (MQ=255) tctGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAg < 1:451880/110‑1 (MQ=255) gtGCGGTGCGTTACGGACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGc > 1:306538/2‑150 (MQ=255) gtGCGGTGCGTTACGGACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGc > 1:843705/2‑150 (MQ=255) ctGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGc < 1:1115008/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGCGTTACGGACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGCg > 1:1026822/1‑150 (MQ=255) ggTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGCGAgg > 1:1391004/1‑150 (MQ=255) ggTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGCGAgg > 1:1402451/1‑150 (MQ=255) gTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGCGAGgc > 2:703454/1‑150 (MQ=255) | CCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCATCAGGACGGTCGAGCGGCTGGCGAGGC > NC_000913/4515824‑4516115 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |