| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,603,201 | A→T | 6.6% | intergenic (‑343/‑276) | yjjP ← / → yjjQ | putative succinate exporter YjjP/DNA‑binding transcriptional repressor YjjQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,603,201 | 0 | A | T | 6.6% | 522.1 / 18.4 | 191 | intergenic (‑343/‑276) | yjjP/yjjQ | putative succinate exporter YjjP/DNA‑binding transcriptional repressor YjjQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (81/97); new base T (8/5); total (89/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
ATAATGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAG > NC_000913/4603052‑4603348 | atAATGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATta > 2:413147/1‑150 (MQ=255) aaTGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCACATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGCGAAGGGATATCATTTAATtata > 1:717366/1‑150 (MQ=255) aTGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaa < 2:177638/150‑1 (MQ=255) tGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaaa < 1:514188/150‑1 (MQ=255) tGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaaa > 1:1232133/1‑150 (MQ=255) tGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaaa > 2:355345/1‑150 (MQ=255) aaTTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTGTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaaatt > 2:1424878/1‑150 (MQ=255) aTTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaaatta > 1:829431/1‑150 (MQ=255) aTTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaaatta > 1:977985/1‑150 (MQ=255) tttATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaaattaa > 1:405189/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAaatg > 2:340776/1‑150 (MQ=255) tGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAaatgaa < 2:1297851/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCCTTTACGAAACAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAaatgaat > 2:447425/1‑150 (MQ=255) ttGGTCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTTATAATTAaatgatatc < 1:900012/150‑5 (MQ=255) tGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTTATAATTAaatgatatcc < 1:685164/150‑6 (MQ=255) tttACGAATCAGGATAATATATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTc < 2:730014/150‑1 (MQ=255) tACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaa < 2:551295/129‑1 (MQ=255) tACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTAtaa > 1:551295/1‑129 (MQ=255) tACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTg < 1:41505/150‑1 (MQ=255) gAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGttt > 1:542055/1‑150 (MQ=255) aaTCAGGATAATAGATAACCGGGCATGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGtttt > 1:997219/1‑150 (MQ=255) aaTCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGtttt > 2:1151352/1‑150 (MQ=255) aTCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGttttt < 1:127531/150‑1 (MQ=255) aTCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGttttt < 1:1154407/150‑1 (MQ=255) tCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGTTTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTc < 2:860375/150‑1 (MQ=255) cAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCa < 1:754049/150‑1 (MQ=255) aGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCAt < 2:1361344/150‑1 (MQ=255) aGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCAt > 2:831170/1‑150 (MQ=255) gATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTa < 1:1333714/150‑1 (MQ=255) gATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTa < 1:1037401/150‑1 (MQ=255) cataataGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTa < 2:139760/149‑1 (MQ=255) ataataGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTaa > 1:1291343/1‑150 (MQ=255) tattaGTTAACATGGCACGTTTTTTATTGTTAACAAGCTAAATCCTTCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGGATTCTGCGGGTAGTTATATCATTTAATTATAAATTTAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAg < 2:1023922/147‑1 (MQ=255) taataGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAg < 2:1237405/150‑1 (MQ=255) aGATAAACGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTAtt > 2:458987/1‑150 (MQ=255) gATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTc > 2:973472/1‑150 (MQ=255) ttAACCGGGCACGTTTTTAAATGTTAACTAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAATGGATATCATTTAATTAAAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTcc < 2:1125075/149‑1 (MQ=255) tAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCt > 2:909817/1‑150 (MQ=255) ggCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAATGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTaacaac > 2:919858/1‑150 (MQ=255) ggCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTaacaac > 2:1066108/1‑150 (MQ=255) gCACGTTTTATAATATTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTATGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACt > 2:1350866/1‑150 (MQ=255) cACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACtt > 1:648665/1‑150 (MQ=255) cGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTTTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTaa < 1:1388661/150‑1 (MQ=255) ttttttAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATg < 1:1134391/150‑1 (MQ=255) tttttAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGt < 1:177107/150‑1 (MQ=255) ttttAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTTAATAAATATTGGTTGTGTTATTTTGCATTCTGCGGGAATGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTa < 2:1335279/150‑1 (MQ=255) ttAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGa < 1:192065/150‑1 (MQ=255) ttAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGa < 2:387180/150‑1 (MQ=255) tAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGat < 2:892548/150‑1 (MQ=255) tAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGat > 2:206975/1‑150 (MQ=255) aTGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGatat > 2:149087/1‑150 (MQ=255) aTGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGatat > 1:675133/1‑150 (MQ=255) tGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATAtt > 2:1053503/1‑150 (MQ=255) tGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATAtt < 1:149087/150‑1 (MQ=255) ttAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATAtttt < 2:623687/150‑1 (MQ=255) tAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTa < 1:443910/150‑1 (MQ=255) aacaacCTAAAACCATCAGATTTCATTCAATAAATATTGGTTGTGAGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTaa < 2:139246/150‑1 (MQ=255) aaCAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTaa > 2:1430770/1‑150 (MQ=255) aCAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTaaa < 2:402284/150‑1 (MQ=255) cAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAAt < 2:810115/150‑1 (MQ=255) gCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAg < 1:856838/114‑1 (MQ=255) tAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAATGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGtctc < 1:919858/150‑1 (MQ=255) tAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGtctc > 2:933869/1‑150 (MQ=255) tAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGtctc < 2:675133/150‑1 (MQ=255) aaaaCCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACtt > 1:210020/1‑126 (MQ=255) aaaCCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGAATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCa > 2:1204458/1‑150 (MQ=255) aaCCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAg < 2:214759/150‑1 (MQ=255) ccATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGc > 1:1085415/1‑150 (MQ=255) cATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAg > 2:78873/1‑150 (MQ=255) ttGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCAAGGCTATTTCACCAGGt > 1:26196/1‑150 (MQ=255) taataaataTTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTa < 2:713153/149‑1 (MQ=255) aataaataTTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTAt > 1:1010843/1‑150 (MQ=255) gtgATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCt > 1:1356141/1‑150 (MQ=255) gtgATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCt > 2:140575/1‑150 (MQ=255) gATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTc < 2:646481/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCt > 2:274494/1‑150 (MQ=255) ttttGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTg < 1:1424878/150‑1 (MQ=255) tGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGaca > 1:448410/1‑150 (MQ=255) cATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGAcaca < 1:1204458/150‑1 (MQ=255) cATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGAcaca > 2:1010657/1‑150 (MQ=255) tCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGc > 1:1308758/1‑150 (MQ=255) tGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACAGATGCAg > 1:848320/1‑150 (MQ=255) cGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTg > 1:1255175/1‑150 (MQ=255) gggAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTgg < 1:206975/150‑1 (MQ=255) aGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAgtt > 1:964924/1‑150 (MQ=255) tcacattCATTTAATTTATAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAgttg > 2:1217506/7‑150 (MQ=255) cacattCATTTAATTTATAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAgttgt > 2:1329471/6‑150 (MQ=255) acattCATTTAATTTATAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAgttgtt > 1:64335/5‑150 (MQ=255) cattCATTTAATTTATAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGttgttg > 1:1414563/4‑150 (MQ=255) ttCATTTAATTTATAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTtgtg > 1:339433/2‑150 (MQ=255) tCATTTAATTTATAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgc > 2:236432/1‑150 (MQ=255) tCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgc < 1:933869/150‑1 (MQ=255) tCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgc < 2:307185/150‑1 (MQ=255) tCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGGCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgc < 2:947454/150‑1 (MQ=255) cttttAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgca < 2:1176581/148‑1 (MQ=255) cATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGAATTCTGTTTTTCATTAAGTATTACAAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCAAGGATATTTAACCAGGTTATAATTTGATGAAAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgca > 2:615107/1‑150 (MQ=255) aTTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgcag > 1:221982/1‑150 (MQ=255) aTTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgcag < 1:384870/150‑1 (MQ=255) tAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGcagcag > 2:749932/1‑150 (MQ=255) ttATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAg < 1:1001116/150‑1 (MQ=255) | ATAATGAATTTATTGTTTGGCCTTTACGAATCAGGATAATAGATAACCGGGCACGTTTTTTAATGTTAACAAGCTAAAACCATCAGATTTCATTGAATAAATATTGGTTGTGTGATTTTGCATTCTGCGGGAAGGGATATCATTTAATTATAAATTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAG > NC_000913/4603052‑4603348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |