Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 103,574 | G→T | 6.7% | A140A (GCG→GCT) | ftsQ → | cell division protein FtsQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 103,574 | 0 | G | T | 6.7% | 198.0 / 3.6 | 60 | A140A (GCG→GCT) | ftsQ | cell division protein FtsQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/27); new base T (2/2); total (31/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.69e-01 |
TGTCAACATCATCCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAA > NC_000913/103427‑103720 | tGTCAACATCATCCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCgga < 1:1420034/150‑1 (MQ=255) tCAACATCATCCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCggaag > 2:310934/1‑150 (MQ=255) cAACATCATCCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCggaagg > 1:1368923/1‑150 (MQ=255) aaCATCATCCAGACGCAAATAGATCAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCggaagga < 2:997994/150‑1 (MQ=255) aaCATCATCCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCggaagga > 1:1079982/1‑150 (MQ=255) aCATCATCCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCggaaggaa > 1:1315011/1‑150 (MQ=255) atcatcCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAAt > 1:445568/1‑150 (MQ=255) tcatcCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATa < 2:5900/150‑1 (MQ=255) catcCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATAc < 2:1315011/150‑1 (MQ=255) atcCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATAcc < 1:552943/150‑1 (MQ=255) tcCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCt > 1:629526/1‑150 (MQ=255) cAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTc > 1:1291386/1‑150 (MQ=255) cGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCTGAAGGTATTTCCTTCcgcg < 2:528739/150‑1 (MQ=255) aaTAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCTGAAGGTATTTCCTTCCGCGtcta < 1:62461/150‑4 (MQ=255) aTAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTgccg < 2:445568/150‑1 (MQ=255) acGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACg < 1:293138/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCAc > 2:257981/1‑150 (MQ=255) cGTGGATTAAGCAGGTGATCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagca < 2:396394/150‑1 (MQ=255) gATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaagca > 2:32550/1‑150 (MQ=255) gATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaagca < 1:438448/150‑1 (MQ=255) gATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaagca > 1:753512/1‑150 (MQ=255) gATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaagca < 2:254565/150‑1 (MQ=255) ttAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAgg > 2:214333/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTg < 2:1291386/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCt < 2:629526/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTcc < 2:1175797/150‑1 (MQ=255) tGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCaa > 2:533521/1‑150 (MQ=255) gAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAAt < 2:862877/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGc < 2:393271/150‑1 (MQ=255) cGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCt > 1:1034274/1‑150 (MQ=255) gTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGAAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTg < 2:17860/150‑1 (MQ=255) tCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGt > 2:711002/1‑150 (MQ=255) cAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCTTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTa > 2:901004/1‑150 (MQ=255) ggCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAg > 2:161978/1‑150 (MQ=255) gCCTTATGAATTAAAGATTAATCTGGTTGAATATGTGAAGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTGGAATCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAgg > 2:838738/1‑150 (MQ=255) tgatgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAg > 1:1132967/1‑150 (MQ=255) gatgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAAAATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCAGAAGGCAgc > 2:1041798/1‑150 (MQ=255) gaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGcc < 2:1327797/150‑1 (MQ=255) gaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGcc < 1:533521/150‑1 (MQ=255) aTTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCaa > 2:683394/1‑150 (MQ=255) aGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAg < 2:346390/150‑1 (MQ=255) gATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAgt < 2:906022/150‑1 (MQ=255) gATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAgt < 1:683394/150‑1 (MQ=255) ctcgTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAACGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCACAACGCCCAAGCAAGCAGGTGCTTCCAATCCTGTATGGCCCGGAAGGCACCGCCAATCAAGTGTTGCAg > 2:112772/4‑150 (MQ=255) ggTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCgg > 1:500839/1‑122 (MQ=255) ggTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCgg < 2:500839/122‑1 (MQ=255) tGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTa < 1:711002/150‑1 (MQ=255) aaTATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATc > 1:71289/1‑150 (MQ=255) gCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAAt > 1:713678/1‑150 (MQ=255) gCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATCGTAGACGCGGAAGTAAATACATAAAGCGTGACGCCATAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTACAATGCTGTATTGCCCGGAAGCAAGCGCAAATGAAGTGTTGCAGGGCTATAGCGAAAt > 2:1394561/1‑150 (MQ=255) ccGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATg < 2:1368923/150‑1 (MQ=255) cGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATgg < 1:214333/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGc < 2:753512/150‑1 (MQ=255) gATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAg > 2:1402160/1‑150 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGc > 1:1051473/1‑135 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGc < 2:1051473/135‑1 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg > 2:1181573/1‑150 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg > 1:212747/1‑150 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg > 1:1268056/1‑150 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACa > 1:1316080/1‑150 (MQ=255) cATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg < 2:445023/145‑1 (MQ=255) cATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg > 1:445023/1‑145 (MQ=255) ggcggcaCGCTGAAGGTATTTCCTTCCGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTa > 1:1353551/7‑150 (MQ=255) gTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTAct > 1:324085/1‑150 (MQ=255) tAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTActc < 2:270464/150‑1 (MQ=255) gcaCGCTGAAGGTATTTCCTTCCGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTActct > 1:195432/3‑150 (MQ=255) cgcgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaa > 2:861853/1‑150 (MQ=255) | TGTCAACATCATCCAGACGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAA > NC_000913/103427‑103720 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |