| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 774,633 | G→T | 7.0% | intergenic (+31/‑119) | ybgE → / → ybgC | cyd operon protein YbgE/esterase/thioesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 774,633 | 0 | G | T | 7.0% | 235.5 / 5.7 | 71 | intergenic (+31/‑119) | ybgE/ybgC | cyd operon protein YbgE/esterase/thioesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/32); new base T (3/2); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.40e-01 | |||||||||||
GTGCTGGTGTGATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTC > NC_000913/774484‑774782 | gtgCTGGTGTGATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCg > 1:655182/1‑150 (MQ=255)gtgCTGGTGTGATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCg > 2:1093014/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGTGATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCt > 1:282632/1‑150 (MQ=255) gtgATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGc < 1:1093014/150‑1 (MQ=255) tgATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGcc < 1:1413409/150‑1 (MQ=255) tgATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGcc < 1:872351/150‑1 (MQ=255) ttCAAGGCGTGCGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCATTGGCAAGGGATTTTTTGCCAATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGCGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATTGGCAGCTCCACGCCCAt > 2:746852/1‑150 (MQ=255) cACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTcc < 2:213017/140‑1 (MQ=255) cACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTcc > 1:213017/1‑140 (MQ=255) gCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttt > 2:50458/1‑150 (MQ=255) gggCTTTCGTCCGCCGACGGTTCTTTGGCCAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAACTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTAc < 2:576720/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCGTCCGCAGATGGTTCTTTGGCAAGCGATTTTTTGCGCTTTGCTTTGCGATATTGTTCTCATTTTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATGAGAATTCTCTTTATAAATTTATGTGCCTGGCGCGGCCCATAATTTTTTaaa < 2:551118/150‑3 (MQ=255) ggCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACg < 2:50593/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAATTTATGGGCCTGGAGCGGCCCATAATTTTTTaaag < 2:1383133/150‑4 (MQ=38) cTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 2:1225437/1‑150 (MQ=255) cTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 1:454854/1‑150 (MQ=255) cTTGCGGCCGCAGAAGGCTCTTTGGCAAGGGATGGTTTGCCCATTGCGTGCCGATATTGTGCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTGCTTTTAAATCAGAAGTCTCTTTAAAAATTTATGGGCCGGGAGCGGCCCATAATTTTTTaaaga < 1:1280820/150‑5 (MQ=25) ttCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTcc > 1:230472/1‑150 (MQ=255) aGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTg < 1:936542/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGATCCCTTAACTTGc > 1:391542/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCGGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGc < 1:927600/150‑1 (MQ=255) ggTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCt > 2:410710/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCAtt > 1:145162/1‑150 (MQ=255) aaGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAAc < 1:410710/150‑1 (MQ=255) aGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAAcc < 2:602969/150‑1 (MQ=255) gggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCt > 2:987386/1‑150 (MQ=255) gggAATTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTATTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTACCTTGCCCTCATTCCCACACCt > 2:180483/1‑150 (MQ=255) ggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTc > 2:290754/1‑150 (MQ=255) aTTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGta < 1:1336441/150‑1 (MQ=255) gcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtag > 1:399434/1‑150 (MQ=255) cttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGGTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagt > 1:471236/1‑150 (MQ=255) cttgcCGATACTGTTCTCATTGTCGCGCTGATCTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCACGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagt < 2:182736/150‑1 (MQ=255) ttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagta < 1:369566/150‑1 (MQ=255) ttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagta > 2:79591/1‑150 (MQ=255) ttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagta < 1:658837/150‑1 (MQ=255) ttGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGttt < 1:409638/150‑1 (MQ=255) gTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaa > 2:1095354/1‑150 (MQ=255) ctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAg > 1:1136454/1‑150 (MQ=255) ctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAg < 1:290754/150‑1 (MQ=255) ctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAAACGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAg > 1:1141448/1‑150 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTa < 2:560699/93‑1 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTa > 1:560699/1‑93 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgcg < 1:1144985/127‑1 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgcg > 2:1144985/1‑127 (MQ=255) tGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTa > 1:247220/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTaa > 2:178736/1‑150 (MQ=255) gATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTATCTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTttgtt < 1:998350/150‑1 (MQ=255) aTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTttgttg < 1:1101191/150‑1 (MQ=255) ttttCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGc > 1:1077196/1‑150 (MQ=255) cttcttcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACGTTTGTTGCATTa > 1:322623/1‑150 (MQ=255) ttcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCgg > 2:1066369/1‑150 (MQ=255) cttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGa < 1:1095354/150‑1 (MQ=255) ttttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGAt < 2:655182/150‑1 (MQ=255) ttttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGAt > 2:67070/1‑150 (MQ=255) ttttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGAt > 1:455234/1‑150 (MQ=255) aaaTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTaa > 2:531276/1‑150 (MQ=255) aaTCAGAATACTCTTTAAAAAAATATTAGCCGATACAAGCACAAAAATTTATACGAAACATTAAAATAAACTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTaaa > 2:611878/1‑150 (MQ=255) aTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAg < 1:67070/150‑1 (MQ=255) tCAGAATTATCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTGTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAgc < 1:427514/150‑2 (MQ=255) cAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTg > 1:640301/1‑150 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGaa < 2:251597/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAAt < 2:1077196/150‑1 (MQ=255) cgtAAAAATTTATGGGCCTGGAGCGGCCCATAATTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACgg > 1:339622/3‑149 (MQ=38) cgtAAAAATTTATGGGCCTGGAGCGGCCCATAATTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGc > 1:1197850/3‑150 (MQ=38) cgtAAAAATTTATGGGCCTGGAGCGGCCCATAATTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGc > 1:1205566/3‑150 (MQ=38) ttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCt < 1:34893/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGtt > 2:527767/1‑150 (MQ=255) aaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGttt < 1:987386/150‑1 (MQ=255) aaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCg > 2:612284/1‑150 (MQ=255) aTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGa > 2:411307/1‑150 (MQ=255) tATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATg < 1:160249/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGTcc < 2:399434/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGcc < 2:230472/150‑1 (MQ=255) gCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTc > 2:399592/1‑150 (MQ=255) | GTGCTGGTGTGATTCACGGCGTGGGCTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTC > NC_000913/774484‑774782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |