Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 934,191 | C→T | 6.2% | A323V (GCA→GTA) | ftsK → | cell division DNA translocase FtsK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 934,191 | 0 | C | T | 6.2% | 256.0 / 4.5 | 81 | A323V (GCA→GTA) | ftsK | cell division DNA translocase FtsK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/42); new base T (2/3); total (36/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.91e-01 |
GAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGTTA > NC_000913/934052‑934340 | gagaTTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAgctgctgct > 2:770344/1‑150 (MQ=255) gaTTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTAc > 1:332820/1‑150 (MQ=255) aCCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACg > 1:395823/1‑150 (MQ=255) cTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGc < 1:229455/150‑1 (MQ=255) acacTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGa > 1:1335138/1‑150 (MQ=255) acTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGaca < 2:935165/150‑1 (MQ=255) acTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGaca < 1:616193/150‑1 (MQ=255) cTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGacac > 2:229679/1‑150 (MQ=255) cTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGacac < 1:86910/150‑1 (MQ=255) cTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGacac < 1:81638/150‑1 (MQ=255) gCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACaa < 2:95457/150‑1 (MQ=255) gCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGacaggt < 2:97298/150‑4 (MQ=38) cgcgGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGc < 1:1306416/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGc < 1:229679/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGacaggttcg < 2:823554/150‑7 (MQ=38) cgcgGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTATCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGc < 1:1311602/150‑1 (MQ=255) gtgtGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTggg > 1:109040/1‑150 (MQ=255) tgtgGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGc < 2:238622/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTgc < 1:1037488/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTgcg > 2:213450/1‑150 (MQ=255) cTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTgcgc < 2:1415621/150‑1 (MQ=255) gCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCg > 2:157641/1‑150 (MQ=255) gCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCg > 2:522981/1‑150 (MQ=255) ccGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCgg < 1:253858/150‑1 (MQ=255) gACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGtt < 2:376916/150‑1 (MQ=255) aCCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTagc > 1:944345/1‑106 (MQ=255) aCCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTagc < 2:944345/106‑1 (MQ=255) cccGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGa > 1:951626/1‑150 (MQ=255) gacgTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCtgtg < 1:770344/150‑1 (MQ=255) acgTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGa < 2:226001/150‑1 (MQ=255) tATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGa < 2:395823/150‑1 (MQ=255) tttCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGAcgc < 1:468632/150‑1 (MQ=255) gggCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACgccgcc < 1:355518/150‑1 (MQ=255) gCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTg < 2:69388/150‑1 (MQ=255) aTCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTg < 2:109040/150‑1 (MQ=255) cGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGcc > 1:552400/1‑150 (MQ=255) gCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCctct < 1:298474/150‑1 (MQ=255) cAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGCCTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTg > 2:250139/1‑150 (MQ=255) cAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCCCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAAACTGAGACTCAGACGCCGACTGTTGCCTCTg > 2:544428/1‑150 (MQ=255) cGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTg < 2:1027790/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGa < 1:157641/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGATGCCTCTGTTGAt > 1:688830/1‑150 (MQ=255) gCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGAc > 2:290407/1‑120 (MQ=255) gCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGAc < 1:290407/120‑1 (MQ=255) ccAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGtt > 1:278869/1‑150 (MQ=255) atatGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCAcc < 2:1072720/150‑1 (MQ=255) atatGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCAGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCAcc < 2:1271723/150‑1 (MQ=255) tGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTgc > 1:312807/1‑150 (MQ=255) gACGAATACGATCGATTATTAAACGTTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTgcg < 1:544428/150‑1 (MQ=255) cGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCa < 2:101115/150‑1 (MQ=255) aaTACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAAc > 1:265215/1‑150 (MQ=255) aTACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAAcc > 2:531658/1‑150 (MQ=255) aCGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTa > 1:1375076/1‑150 (MQ=255) cGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGAt < 2:447799/130‑1 (MQ=255) cGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGAt > 1:447799/1‑130 (MQ=255) cGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCAc < 1:922507/137‑1 (MQ=255) cGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACAACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCAc > 2:922507/1‑137 (MQ=255) aTCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTg > 1:1093720/1‑114 (MQ=255) aTCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTg < 2:1093720/114‑1 (MQ=255) tCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGt < 1:646234/150‑1 (MQ=255) ttattaAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGcc < 1:95751/150‑1 (MQ=255) attaAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTg < 1:522981/150‑1 (MQ=255) attaAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTg > 1:536673/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCa > 2:520439/1‑150 (MQ=255) gcgcCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTa > 2:1243610/1‑150 (MQ=255) cgcCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTAc > 1:135984/1‑150 (MQ=255) cAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCgg > 1:1001929/1‑150 (MQ=255) cAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCgg > 1:311013/1‑150 (MQ=255) cAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCgg > 1:347342/1‑150 (MQ=255) tACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTcc < 1:213450/150‑1 (MQ=255) aCCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCca < 2:1375076/150‑1 (MQ=255) aCCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCca > 1:783223/1‑150 (MQ=255) ccGAACATTTCGATGTAGCAGATGCTGCTACCACGACGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCcac > 2:703328/1‑150 (MQ=255) gctttgtGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCCCCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCcaca > 1:481300/7‑150 (MQ=37) cGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCcaca < 2:265215/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACg > 1:809509/1‑150 (MQ=255) gtGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACgg > 1:1137739/2‑150 (MQ=255) tGTCTCTGTAGCAGCTGATGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCTGTTGAACCTGTTACTCAGACGACGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACggg > 2:1220434/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACggg < 2:1335138/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACggg < 2:809509/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGATGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACggg < 2:688830/150‑1 (MQ=255) tCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGgag < 2:853809/150‑1 (MQ=255) tGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGcc < 1:531658/150‑1 (MQ=255) cagcTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGTTa > 1:1182557/1‑150 (MQ=255) | GAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGTTA > NC_000913/934052‑934340 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |