| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 987,424 | A→T | 10.0% | intergenic (‑442/+161) | ompF ← / ← asnS | outer membrane porin F/asparagine‑‑tRNA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 987,424 | 0 | A | T | 10.0% | 328.8 / 18.4 | 114 | intergenic (‑442/+161) | ompF/asnS | outer membrane porin F/asparagine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/65); new base T (5/7); total (42/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTG > NC_000913/987275‑987573 | tCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGaa > 2:1385072/1‑150 (MQ=255) cTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATg > 2:832625/1‑150 (MQ=255) ttATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATTGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGGAATAAGAATGc < 2:467595/150‑1 (MQ=255) tataTTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATGGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCg < 1:685429/150‑1 (MQ=255) atatTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCgg < 1:1406222/150‑1 (MQ=255) tatTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGa > 2:1432611/1‑150 (MQ=255) tatTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGa > 1:1259794/1‑150 (MQ=255) tttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAtt < 1:265385/150‑1 (MQ=255) tttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAtt < 2:1099051/150‑1 (MQ=255) tttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATCGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAtt < 2:761517/150‑1 (MQ=255) ttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACAT‑CAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAg < 2:527633/150‑1 (MQ=255) tAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAg < 2:1163252/150‑1 (MQ=255) tAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAg < 1:246411/150‑1 (MQ=255) tAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAg > 1:819710/1‑150 (MQ=255) aaTTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGtt < 1:1207785/150‑1 (MQ=255) aaTTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGtt > 1:1328977/1‑150 (MQ=255) aTTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGttt < 1:945427/150‑1 (MQ=255) ttAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGtttt < 2:348467/150‑1 (MQ=39) tAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGttttt < 1:791953/150‑1 (MQ=255) tAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAG‑AAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTg < 1:757956/150‑1 (MQ=255) aaCTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGGTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTg < 2:165643/150‑1 (MQ=255) aaCTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTg < 1:1027876/150‑1 (MQ=255) aCTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTgc < 2:1175227/150‑1 (MQ=255) cTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGttttttct < 2:1328977/150‑4 (MQ=39) cTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTgcg < 1:792700/150‑1 (MQ=255) aaaCGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGcgcg < 1:1309837/150‑1 (MQ=255) aCGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTa < 1:591116/150‑1 (MQ=255) cGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTaa > 1:1328154/1‑150 (MQ=255) cGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTaa > 1:301624/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGtt < 1:543783/150‑1 (MQ=255) gTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCTGAATCCC‑AAAAAATAGTATGAATATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAATCTTATCCGCAATTAGATTGCGGATTAGTTTTTGCGGGTAAATGTTGCAAt < 2:195255/150‑1 (MQ=255) tttCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATg < 1:1347640/150‑1 (MQ=255) cTGATTGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGtta < 1:752964/150‑3 (MQ=255) cTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTaa > 2:363363/1‑150 (MQ=255) tGATTGAAACTTTATCGACCTTGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAat < 1:595477/150‑1 (MQ=255) tGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATAtt < 2:362746/150‑1 (MQ=255) tATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCATAATCCA‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGATAAGAAAAAACTTATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGACTAAATGTTGCAATGTAATATTCAGTAACat > 2:15398/1‑149 (MQ=255) aTCCACCTGTAACAAAATCTTCATTCAGACATGCAGAATTCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGAGGATTAGTTTTTGCTCGTAAATTTTGCAATGTAATATTCGGTAACatt < 2:657348/150‑3 (MQ=255) aCCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGAGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatg > 2:1391388/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatga < 1:653217/150‑1 (MQ=255) cTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGt < 2:1023960/114‑1 (MQ=255) cTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGt > 1:1023960/1‑114 (MQ=255) tGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCg < 1:1079819/150‑1 (MQ=255) tGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATAAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCg > 2:553491/1‑150 (MQ=255) cacaAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTa > 2:1188831/1‑150 (MQ=255) cacaAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTa < 2:382879/150‑1 (MQ=255) caAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATg < 1:1385072/150‑1 (MQ=255) aaaaTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgat > 1:1398542/1‑139 (MQ=255) aaaaTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgat < 2:1398542/139‑1 (MQ=255) aaaaTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATgg < 1:1126757/150‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGc < 1:875970/150‑1 (MQ=255) aaaTATTCATTCAGACATCCAGAATGAC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGc > 2:1188060/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCgg < 2:580313/150‑1 (MQ=255) cttcttTCATACATCCATAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCgggg < 2:646893/150‑1 (MQ=255) ttCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCa < 1:469566/150‑1 (MQ=255) ttCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCa < 1:1432611/150‑1 (MQ=255) aGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAAt < 1:208410/150‑1 (MQ=255) gACATACAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAATAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATa < 2:334605/150‑1 (MQ=255) tCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTTCTATTAGCTAAGAAAAAAATAATACGCAATAAGAATTCGGATTAGTTTTTTCGCGTAAATGTTGGAATGGAATATTACGTAACAGGATGATAGTTATGGCGGGGTTTCAAATAGAtt > 2:898504/1‑150 (MQ=255) tCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGAtt > 2:750421/1‑150 (MQ=255) cAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGc < 2:873239/150‑1 (MQ=255) aGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCt < 1:512653/150‑1 (MQ=255) tGCA‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATTTTGCAATGTAATATTCCTAAACAGGATGATCGTTATGGCGGTGTTGCAAATAGATTGCTTGAc < 2:805625/150‑1 (MQ=255) c‑AAAAAATAGTTTGAAATTTGTTCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGAGTAAATGTTGGAATGTAATATTAGGTAACAGGATGATCGTTATGTCGTGGTTGCTAATAGATTGCTTGACTTa < 2:271019/150‑1 (MQ=255) c‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTa > 2:92375/1‑150 (MQ=255) c‑AAAAAATAGAATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTa > 1:1090126/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatgat > 1:243433/1‑113 (MQ=255) aaaaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatgat < 2:243433/113‑1 (MQ=255) aaaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaac < 1:1296663/150‑1 (MQ=255) aaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaacaa < 1:522045/150‑1 (MQ=255) tAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaacaaaca < 1:832625/150‑1 (MQ=255) tAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaacaaaca < 1:157279/150‑1 (MQ=255) aTGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATa > 1:833844/1‑150 (MQ=255) aTGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATa > 1:750356/1‑150 (MQ=255) tGAAAATTGTGCAAATAGCTAACAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCAGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATaa > 2:455992/1‑150 (MQ=255) aaTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTg < 2:301624/150‑1 (MQ=255) tgtgCTATTAGCTAAGAAAAAACTATTACGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCTTAAATGTTTCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGTGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACa < 1:15398/150‑1 (MQ=255) tgtgCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACa < 1:1188831/150‑1 (MQ=255) tgCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGa > 1:469868/1‑150 (MQ=255) tATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGaaaa > 1:436281/1‑150 (MQ=255) cTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTAAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaa < 2:1174257/150‑1 (MQ=255) tAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaa > 2:89023/1‑150 (MQ=255) cgcaaaaaCTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaa > 1:934675/4‑150 (MQ=39) gAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaaa > 1:1136724/1‑150 (MQ=255) gAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaaa > 1:703801/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAag > 1:1058732/1‑150 (MQ=255) aaaaCTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAagag > 2:717987/1‑150 (MQ=39) aaaaCTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATAGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAagag > 1:1175572/1‑150 (MQ=39) aaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGTCGGGGTTTCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACATATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAagag < 2:1234196/150‑1 (MQ=255) aaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAagag < 1:899771/150‑1 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGcc > 1:720522/1‑150 (MQ=255) aCTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCa > 1:1428660/1‑150 (MQ=255) cTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAg > 1:312641/1‑150 (MQ=255) ccGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGgc < 1:1225074/150‑1 (MQ=255) gCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGgcgc < 2:1090126/150‑1 (MQ=255) cAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCt < 2:1005546/150‑1 (MQ=255) gAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCa < 2:606952/135‑1 (MQ=255) gAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCa > 1:606952/1‑135 (MQ=255) aaTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCtt > 2:379570/1‑150 (MQ=255) aTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTg < 2:1274687/150‑1 (MQ=255) | TCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCC‑AAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTG > NC_000913/987275‑987573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |