Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,211,610 | A→G | 6.4% | intergenic (+33/+70) | icdC → / ← iraM | protein IcdC/anti‑adaptor protein IraM, inhibitor of sigma(S) proteolysis |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,211,610 | 0 | A | G | 6.4% | 383.3 / 11.2 | 125 | intergenic (+33/+70) | icdC/iraM | protein IcdC/anti‑adaptor protein IraM, inhibitor of sigma(S) proteolysis |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/56); new base G (4/4); total (65/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGA > NC_000913/1211462‑1211758 | gTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtat < 2:960264/150‑1 (MQ=255) tATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCAAACGTCTGATGGAAGGCTCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGGGAAGCGATCATCGAATAGATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtata < 2:1312039/150‑1 (MQ=25) ggAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAaca > 1:33140/1‑150 (MQ=255) 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caatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTGTTATACGCCCgtt < 2:700853/150‑1 (MQ=255) aatGCCAAGAGCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGATGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACTTGTAATCTCTCCATGTTTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGtttt < 2:987931/150‑1 (MQ=255) aatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGtttt < 1:1331602/150‑1 (MQ=255) aatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGtttt < 2:793495/150‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTttta < 1:175942/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |